Job Description P77357 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:28:08 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 380 % Identity 14% Template c3mruB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:aminoacyl-histidine dipeptidase; PDBTitle: crystal structure of aminoacylhistidine dipeptidase from vibrio2 alginolyticus Resolution 3.00 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.		.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.
Query SS confidence																.
Query Sequence		M	E	S	L	N	Q	F	V	N	S	L	A	P	K	.	L	S	H	W	R	R	D	F	H	H	Y	A	E	S	G	W	V	E	F	R	T	A	T	L	V	A	E	E	L	H	Q	L	G	Y	S	L	A	L	G	R	E	V	V	N	E	S	S	R	M	G	L	P	D	E	F	T	L	Q	R	E	F	E	R	A	R
Query Conservation																.
Alig confidence																.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	S	E	F	H	S	E	I	S	T	L	S	P	A	P	L	W	Q	F	F	D	K	I	C	S	I	P	H	P	S	K	H	E	E	A	L	A	Q	Y	I	V	T	W	A	T	E	Q	G	F	D	V	R	R	D	P	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					S	S			G	G	G	S	S	S											T	T	S			B	T	T														T	T	T	T							T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.				.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.				.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.																							.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.																							.	.	.
Query Sequence		Q	Q	G	A	L	A	Q	W	I	A	A	F	E	G	G	F	T	G	I	V	A	T	L	D	T	G	.	.	.	R	P	G	P	V	M	A	F	R	V	D	M	D	A	L	D	L	S	E	E	Q	D	.	.	.	V	S	H	R	P	Y	R	D	G	F	A	S	C	N	A	G	M	M	H	A	C	G	H	D	G	H
Query Conservation																												.	.	.																							.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.																							.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	V	F	I	K	K	P	A	T	P	G	M	E	N	K	K	G	V	V	L	Q	A	H	I	D	M	V	P	Q	K	N	E	D	T	D	H	D	F	T	Q	D	P	I	Q	P	Y	I	D	G	E	W	V	T	A	K	G	T	T	L	G	A	D	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										S	S			S	B											B				B		S	S					T	T	T	S								T	T					S	S	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																			58	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.		.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.											.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
Predicted Secondary structure																																				.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	A	I	G	L	G	L	A	H	T	L	K	Q	F	E	S	G	L	H	G	V	I	K	L	I	F	Q	P	A	E	E	G	T	R	.	G	A	R	A	M	V	D	A	G	V	V	D	D	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	F	T	A	V	H	I	G	T	G	V	P	A	G	T	V	V	C	G	S
Query Conservation																																				.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.																															.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.
Template Sequence		G	I	G	.	M	A	S	C	L	A	V	L	A	S	K	E	I	K	H	G	P	I	E	V	L	L	T	I	D	E	E	A	G	M	T	G	A	F	G	L	E	A	G	W	L	K	G	D	I	L	L	N	T	D	S	E	Q	E	G	E	V	Y	M	G	C	A	G	G	I	D	G	A	M	T	F	D	I	T	R	D
Template Known Secondary structure					.									T		S	S				S								S		S	S	S	T	T					S			T	T	S				S										T	T
Template Predicted Secondary structure					.
Template SS confidence
		121	.	.		.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.		.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250		.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	N	F	M	A	T	T	K	F	D	A	H	F	T	G	.	T	A	A	H	A	G	A	K	P	E	D	G	H	.	N	A	L	L	A	A	A	Q	A	T	L	A	L	H	A	I	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																	.														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	I	P	A	G	F	I	T	R	Q	L	T	L	K	G	L	K	G	G	H	S	G	C	D	I	H	T	G	R	G	N	A	N	K	L	I	G	R	F	L	A	G	H	A	Q	E	L	D	L	R	L	V	E	F	R	G	G	S	L	R	N	A	I	P	R	E	A	F	V	T	V	A	L	P	A	E	N	Q	D	K
Template Known Secondary structure					T	T															B	T	T	T	G	G	G	S																					T										S		T	T	B													G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																			269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	290	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	S	E	G	A	S	R	V	N	V	G	V	M	Q	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	R	N	V	V	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	A	E	L	F	N	Y	Y	T	E	L	L	K	T	E	L	G	K	I	E	T	D	I	V	T	F	N	E	E	V	A	T	D	A	Q	V	F	A	I	A	D	Q	Q	R	F	I	A	A	L	N	A	C	P	N	G	V	M	R	M	S	D	E	V	E	G	V	V	E	T	S	L	N	V	G	V	I	T	T	E	E
Template Known Secondary structure																		T	T	T															S																		S			S						S	S	S	T	T															T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	S	A	L	L	K	V	E	T	R	G	A	S	D	V	I	N	Q	Y	V	F	D	R	A	Q	Q	A	I	Q	G	A	A	T	M	Y	G	V	G	V	E	T	R	L	M	G	A	A	T	A	S	S	P	S	P	Q	W	V	A	W	L	Q	S	Q	A	A	Q	V	A	G	V	N	Q	A	I	E	R	V	E	A	P
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.																																					.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.																																					.	.	.
Template Sequence		N	K	V	T	V	L	C	L	I	R	S	L	I	D	S	G	R	S	Q	V	E	G	M	L	Q	S	V	A	E	L	A	.	.	.	.	G	A	Q	I	E	F	S	G	A	Y	P	G	W	K	P	D	A	D	S	E	I	M	A	I	F	R	D	M	Y	E	G	I	Y	G	H	K	.	.	.	P	N	I	M	V	I
Template Known Secondary structure		T											S	S																		T	.	.	.	.	T												B				S	S									T	T	T	T	T	T			S		.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.																																					.	.	.
Template SS confidence
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390					.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.				.	.	.	430	.	.
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	S	E	D	A	T	L	M	M	A	R	V	Q	Q	H	Q	G	Q	A	S	Y	V	V	F	G	T	Q	L	A	A	G	H	H	N	E	K	F	D	F	D	E	Q	V	L	A	I	A	V	E	T	L	A	R	T	A	L	N	F	P	W	T
Query Conservation
Alig confidence																.	.					.	.							.
Template Conservation																.	.					.	.							.
Template Sequence		H	A	G	L	E	C	G	L	F	K	E	P	Y	P	.	.	N	M	D	M	.	.	V	S	F	G	P	T	.	I	K	F	P	H	S	P	D	E	K	V	K	I	D	T	V	Q	L	F	W	D	Q	M	V	A	L	L	E	A	I	P	E	K
Template Known Secondary structure		S	S			G	G	G	G	G	G	S	S	S	S	.	.					.	.							.			S	T	T	S	T	T																					T			B
Template Predicted Secondary structure																.	.					.	.							.
Template SS confidence
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.			.	.	.	450			.	.	.	.	.	.		.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.