Job Description P77357 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:28:08 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 331 % Identity 15% Template c3khzA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:putative dipeptidase sacol1801; PDBTitle: crystal structure of r350a mutant of staphylococcus aureus2 metallopeptidase (sapep/dape) in the apo-form Resolution 2.50 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.													.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	Q	F	V	N	S	L	A	P	K	L	S	H	W	R	R	D	F	H	H	Y	A	E	S	G	W	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	R	T	A	T	L	V	A	E	E	L	H	Q	L	G	Y	S	L	A	L	G	R	E	V	V	N	E	S	S	R	M	G	L	P	D	E	F	T	L	Q
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	E	K	V	Q	Q	Y	E	D	Q	I	I	N	D	L	K	G	L	L	A	I	E	S	V	R	D	D	A	K	A	S	E	D	A	P	V	G	P	G	P	R	K	A	L	D	Y	M	Y	E	I	A	H	R	D	G	F	T	T	H	D	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	T													T	S			B			T	T	S			S	S	S	T	T																		T	T							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.
		73	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	E	F	E	R	A	R	Q	Q	G	A	L	A	Q	W	I	A	A	F	E	G	G	F	T	G	I	V	A	T	L	D	T	G	R	P	G	P	V	M	A	F	R	V	D	M	D	A	L	D	L	S	E	E	Q	D	V	S	H	R	P	Y	R	D	G	F	A	S	C	N	A	G	M	M	H	A	C	G	H	D	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	I	A	G	R	I	E	A	G	K	G	N	D	V	L	G	I	L	C	H	V	D	V	V	P	A	G	D	.	.	G	W	D	S	N	P	F	E	P	V	V	T	E	D	A	I	I	A	R	G	T	L	D	D	K	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T									S	S											B					T	.	.	T		S	S		T	T	S					S	S				S	T	T	S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template SS confidence
																										65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.			.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.		.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure																																					.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	T	A	I	G	L	G	L	A	H	T	L	K	Q	F	E	S	G	L	H	G	V	I	K	L	I	F	Q	P	A	E	E	G	T	R	.	G	A	R	A	M	V	D	A	G	V	V	D	D	V	D	Y	F	T	A	V	H	I	G	T	G	V	P	A	G	T	V	V	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																					.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.										.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.
Template Sequence		P	T	I	A	A	Y	Y	A	I	K	I	L	E	D	M	N	V	D	W	K	K	R	I	H	M	I	I	G	T	D	E	E	S	D	W	K	C	T	D	R	Y	F	K	T	E	.	.	E	M	P	T	L	G	F	A	P	D	A	E	F	P	C	I	H	G	E	K	G	I	T	T	F	D	L	V	Q	N	K	L	T
Template Known Secondary structure																T	T				S	S										T	T					T	T	S						S	.	.				S					T	T		S	S		S				B
Template Predicted Secondary structure																																															.	.
Template SS confidence
		119	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.			.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
																																																						221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	D	N	F	M	A	T	T	K	F	D	A	H	F	T	G	T	A	A	H	A	G	A	K	P	E	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation																																																																												.
Template Sequence		E	D	Q	D	E	P	D	Y	E	L	I	T	F	K	S	G	E	R	Y	N	M	V	P	D	H	A	E	A	R	V	L	V	K	E	N	M	T	D	V	I	Q	D	F	E	Y	F	L	E	Q	N	H	L	Q	G	D	S	T	V	D	S	G	I	L	V	L	T	V	E	G	K	A	V	H	G	.	M	D	P	S	I
Template Known Secondary structure								S											S	S	S	B												S	S		S														T	T									T	T									B			B	T	.	T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																												.
Template SS confidence
		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270		.	.	.	.	.
		249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	H	N	A	L	L	A	A	A	Q	A	T	L	A	L	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	I	A	P	H	S	E	G	A	S	R	V	N	V	G	V	M	Q	A	G	S	G	R	N	V	V	P	A	S	A	L	L	K	V	E	T	R	G	A	S	D	V
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	V	N	A	G	L	Y	L	L	K	F	L	A	S	L	N	L	D	N	N	A	Q	A	F	V	A	F	S	N	R	Y	L	F	N	S	D	F	G	E	K	M	G	M	K	F	H	T	D	V	M	G	D	V	T	T	N	I	G	V	I	T	Y	D	N	E	N	A	G	L	F	G	I	N	L	A	Y	P	E	G	F
Template Known Secondary structure		S	B											T	T	S		B															T	T	T		T	T	S	G	G	G	T						T	T	T														T	T	T												T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
		307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	N	Q	Y	V	F	D	R	A	Q	Q	A	I	Q	G	A	A	T	M	Y	G	V	G	V	E	T	R	L	M	G	A	A	T	A	S	S	P	S	P	Q	W	V	A	W	L	Q	S	Q	A	A	Q	V	A	G	V	N	Q	A	I	E	R	V	E	A	P	A	G	S	E	D	A	T	L	M	M	A	R	V	Q	Q
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	F	E	K	A	M	D	R	F	A	N	E	I	Q	Q	Y	.	.	.	.	G	F	E	V	K	L	G	K	V	Q	P	P	H	Y	V	D	K	N	D	P	F	V	Q	K	L	V	T	A	Y	R	N	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														T	G	G	G	.	.	.	.	T												B			G	G	G															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.					.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	Q	G	Q	A	S	Y	V	V	F	G	T	Q	L	A	A	G	H	H	N	E	K	F	D	F	D	E	Q	V	L	A	I	A	V	E	T	L	A	R	T	A	L	N	F	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	H	Q	K	N	E	Y	I	T	K	K	Q	L	F	N	A	T	S	I	Y	L	E	A	I	Y	S	L	C
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																			404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.