Job Description P77357 Confidence 98.82% Date Thu Jan 5 12:28:08 GMT 2012 Rank 72 Aligned Residues 275 % Identity 17% Template c2ek8A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:aminopeptidase; PDBTitle: aminopeptidase from aneurinibacillus sp. strain am-1 Resolution 1.80 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30			.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure																					.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	P	K	L	S	H	W	R	R	D	F	H	H	Y	A	E	S	G	W	.	.	V	E	F	R	T	A	T	L	V	A	E	E	L	H	Q	L	G	Y	S	L	A	L	G	R	E	V	V	N	E	S	S	R	M	G	L	P	D	E	F	T	L	Q	R	E	F	E	R	A	R	Q	Q	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																					.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	E	N	M	Y	N	T	I	Q	F	L	S	Q	A	P	R	V	A	G	S	P	E	E	L	K	A	V	R	Y	I	E	Q	Q	F	K	S	Y	G	Y	H	V	E	V	Q	P	F	Q	F	E	G	Y	T	A	P	S	E	V	T	L	K	I	G	T	E	K	K	E	G	E	A	F	T	Y	S	P	N	S	D	V	T
Template Known Secondary structure													T	T	S				T	T	S																	T	T																	S							T	T									B	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.
								82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	G	A	L	A	Q	W	I	A	A	F	E	G	G	F	T	G	I	V	A	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	E	L	V	Y	V	G	L	G	T	T	A	D	V	A	G	K	D	L	N	G	K	I	A	L	I	Q	R	G	N	I	S	F	A	D	K	V	R	N	A	A	K	Q	G	A	K	A	V	I	I	Y	N	N	T	D	G	K	L	N	G	T	L	G	G	S	D	A	S	F	V	A	A	V	G	I	T	K	Q	E	G
Template Known Secondary structure								T	T			T	T	T	T	T	T	S			T	T	S								S	S												T	T		S							S	S	S	S					B		S	S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
																																										103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	T	G	R	P	G	P	V	M	A	F	R	V	D	M	D	A	L	D	L	S	E	E	Q	D	V	S	H	R	P	Y	R	D	G	F	A	S	C	N	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	A	L	A	A	N	L	R	A	G	E	K	I	T	A	T	V	K	V	A	G	A	E	V	K	T	L	T	S	H	N	V	I	A	T	K	K	P	D	A	N	K	K	N	T	N	D	I	I	I	I	G	S	H	H	D	S	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										T	T											S																			S	S	T	T																T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.
		143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.					200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.
Query Sequence		G	M	M	H	A	C	G	H	D	G	H	T	A	I	G	L	G	L	A	H	T	L	K	Q	F	E	S	G	L	H	G	V	I	K	L	I	F	Q	P	A	E	E	G	T	R	G	A	R	A	M	V	D	A	G	V	V	D	.	.	.	.	D	V	D	Y	F	T	A	V	H	I	G	T	G	V	P	A	G	T	V
Query Conservation																																																											.	.	.	.
Alig confidence																											.	.																															.	.	.	.
Template Conservation																											.	.
Template Sequence		K	A	P	G	A	N	D	D	A	S	G	V	A	V	T	L	E	L	A	R	V	M	S	K	L	.	.	K	T	D	T	E	L	R	F	I	T	F	G	A	E	E	N	G	L	I	G	S	K	K	Y	A	A	S	L	S	E	D	E	I	K	R	T	I	G	M	F	Q	L	D	M	V	G	S	K	D	A	G	D	L
Template Known Secondary structure		T				T	T	T	T															T	T	S	.	.			S	S								S	S	S	T	T	T	S								T	T																	S			B	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																											.	.
Template SS confidence
		234	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.			.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	C	G	S	D	N	F	M	A	T	T	K	F	D	A	H	F	T	G	T	A	A	H	A	G	A	K	P	E	D	G	H	N	A	L	L	A	A	A	Q	A	T	L	A	L	H	A	I	A	P	H	S	E	G	A	S	R	V	N	V	G	V	M	Q	A	G	S	G	R	N	V	V	P	A	S	A	L	L	K	V
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	M	Y	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		312	.	.	.
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	T	R	G	A	S	D	V	I	N	Q	Y	V	F	D	R	A	Q	Q	A	I	Q	G	A	A	T	M	Y	G	V	G	V	E	T	R	L	M	G	A	A	T	A	S	S	P	S	P	Q	W	V	A	W	L	Q	S	Q	A	A	Q	V	A	G	V	N	Q	A	I	E	R	V	E	A	P	A	G	S	E	D	A	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	G	K	K	N	R	V	T	D	L	G	A	A	A	S	S	R	L	S	G	.	.	.	.	V	L	P	Y	G	Q	E	G	R	S	D	H	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S																	T	S	.	.	.	.									S	S	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Template SS confidence
																																												316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.					.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.				.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.
Query Sequence		L	M	M	A	R	V	Q	Q	H	Q	G	Q	A	S	Y	V	V	F	G	T	Q	L	A	A	G	H	H	N	E	.	.	.	K	F	D	F	D	E	Q	V	L	A	I	A	V	E	T	L	A	R	T	A	L	N	F	P	W	T	R	G	I
Query Conservation																															.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.																				.				.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.																				.
Template Sequence		S	F	.	.	.	.	H	A	L	G	I	P	A	A	L	F	I	H	A	P	V	E	P	W	Y	.	H	T	P	N	D	T	L	D	K	I	S	K	E	K	L	D	N	V	A	D	I	V	G	S	A	V	Y	Q	A	A	R	P	G	E	L
Template Known Secondary structure				.	.	.	.		T	T	T										S			T	T	T	.	T	S	T	T			G	G	G	B																					S	S	S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.																				.
Template SS confidence
		350	.					.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370		.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.