Job Description P77357 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:28:08 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 372 % Identity 12% Template c1lfwA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:pepv; PDBTitle: crystal structure of pepv Resolution 1.80 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.													.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	L	N	Q	F	V	N	S	L	A	P	K	L	S	H	W	R	R	D	F	H	H	Y	A	E	S	G	W	V	E	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	T	A	T	L	V	A	E	E	L	H	Q	L	G	Y	S	L	A	L	G	R	E	V	V	N	E	S	S	R	M	G	L	P	D	E	F	T
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	F	K	E	L	A	E	A	K	K	D	A	I	L	K	D	L	E	E	L	I	A	I	D	S	S	E	D	L	E	N	A	T	E	E	Y	P	V	G	K	G	P	V	D	A	M	T	K	F	L	S	F	A	K	R	D	G	F	D	T	E	N	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									T	T													T	S			B			G	G	G			S	S	S	T	T																		T	T							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.		.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																						.
Query SS confidence																																																																						.
Query Sequence		L	Q	R	E	F	E	R	A	R	Q	Q	G	A	L	A	Q	W	I	A	A	F	E	G	G	F	T	G	I	V	A	T	L	D	T	G	R	P	G	P	V	M	A	F	R	V	D	M	D	A	L	D	L	S	E	E	Q	D	V	S	H	R	P	Y	R	D	G	F	A	.	S	C	N	A	G	M	M	H	A	C	G
Query Conservation																																																																						.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.													.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Y	A	G	R	V	N	F	G	A	G	D	K	R	L	G	I	I	G	H	M	D	V	V	P	A	G	E	.	.	G	W	T	R	D	P	F	K	M	E	I	D	E	E	G	R	I	Y	G	R	G	S	A	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T										S	S										B					S	.	.			S	S		T	T	S					T	T					S	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template SS confidence
																												68	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.			.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	D	G	H	T	A	I	G	L	G	L	A	H	T	L	K	Q	F	E	S	G	L	H	G	V	I	K	L	I	F	Q	P	A	E	E	G	T	R	G	A	R	A	M	V	D	A	G	V	V	D	D	V	D	Y	F	T	A	V	H	I	G	T	G	V	P	A	G	T	V	V	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	K	G	P	S	L	T	A	Y	Y	G	M	L	L	L	K	E	A	G	F	K	P	K	K	K	I	D	F	V	L	G	T	N	E	E	T	N	W	V	G	I	D	Y	Y	L	K	H	E	P	T	P	D	I	V	F	S	P	D	A	E	Y	P	I	I	N	G	E	Q	G	I	F	T	L	E	F	S	F	K	N	D
Template Known Secondary structure		S																		T				S	S								S		T	T	T	T											S				S					S	S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																																			221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	D	N	F	M	A	T	T	K	F	D	A	H	F	T	G	T	A	A	H	A	G	A	K	P	E	D	G	H	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation																																																																									.
Template Sequence		D	T	K	G	D	Y	V	L	D	K	F	K	A	G	I	A	T	N	V	T	P	Q	V	T	R	A	T	I	S	G	P	D	L	E	A	V	K	L	A	Y	E	S	F	L	A	D	K	E	L	D	G	S	F	E	I	N	D	E	S	A	D	I	V	L	I	G	Q	G	A	H	A	.	S	A	P	Q	V	G	K	N
Template Known Secondary structure						S	B									S	B	T	T	B			S									S																	T									T	T									B			B	T	.	T		G	G	G	S	B
Template Predicted Secondary structure																																																																									.
Template SS confidence
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270		.	.	.	.	.	.	.	.
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	L	A	A	A	Q	A	T	L	A	L	H	A	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	H	S	E	G	A	S	R	V	N	V	G	V	M	Q	A	G	S	G	R	N	V	V	P	A	S	A	L	L	K	V	E	T	R	G	A	S	D	V	I	N	Q
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	A	T	F	L	A	L	F	L	D	Q	Y	A	F	A	G	R	D	K	N	F	L	H	F	L	A	E	V	E	H	E	D	F	Y	G	K	K	L	G	I	F	H	H	D	D	L	M	G	D	L	A	S	S	P	S	M	F	D	Y	E	H	A	G	K	A	S	L	L	N	N	V	R	Y	P	Q	G	T	D	P	D
Template Known Secondary structure											T	T	S		B														T	T	T	T		T	T	S	T	T	T	T						T	T	T														T	T	S												T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		279	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	V	F	D	R	A	Q	Q	A	I	Q	G	A	A	T	M	Y	G	V	G	V	E	T	R	L	M	G	A	A	T	A	S	S	P	S	P	Q	W	V	A	W	L	Q	S	Q	A	A	Q	V	A	G	V	N	Q	A	I	E	R	V	E	A	P	A	G	S	E	D	A	T	L	M	M	A	R	V	Q	Q	H	Q	G
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.																																					.	.	.																.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.																																					.	.	.																.	.	.	.	.
Template Sequence		T	M	I	K	Q	V	L	D	K	F	S	G	.	.	.	.	.	I	L	D	V	T	Y	N	G	F	E	E	P	H	Y	V	P	G	S	D	P	M	V	Q	T	L	L	K	V	Y	E	K	Q	T	G	K	P	.	.	.	G	H	E	V	V	I	G	G	G	T	Y	G	R	L	F	.	.	.	.	.	E	R	G	V
Template Known Secondary structure												T	T	.	.	.	.	.	T						S			B							T	T																			.	.	.							S	S			G	G	G	G	S	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.																																					.	.	.																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370						.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.				.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.						.	.	.	.
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	A	S	Y	V	V	F	G	T	Q	L	A	A	G	H	H	N	E	K	F	D	F	D	E	Q	V	L	A	I	A	V	E	T	L	A	R	T	A	L	N	F	P	W	T	R
Query Conservation
Alig confidence								.	.
Template Conservation								.	.
Template Sequence		A	F	G	A	Q	P	.	.	E	N	G	P	M	V	M	H	A	A	N	E	F	M	M	L	D	D	L	I	L	S	I	A	I	Y	A	E	A	I	Y	E	L	T	K	D	E
Template Known Secondary structure								.	.	T	T					T	T	S	T	T																								S
Template Predicted Secondary structure								.	.
Template SS confidence
		426	.	.	.	430	.			.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.