Job Description Q46939 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:35:58 GMT 2012 Rank 35 Aligned Residues 296 % Identity 22% Template c3o04A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:beta-keto-acyl carrier protein synthase ii; PDBTitle: crystal structure of the beta-keto-acyl carrier protein synthase ii2 (lmo2201) from listeria monocytogenes Resolution 1.85 Å

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		2	.	.	.	.	.	.		.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	D	V	V	I	V	G	.	A	L	R	T	P	I	G	C	F	R	G	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	H	S	A	V	E	L	G	S	L	V	V	K
Query Conservation									.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	R	V	V	V	T	G	I	G	A	V	T	P	I	G	N	D	A	E	T	S	W	E	N	A	K	K	G	V	N	G	V	A	K	X	T	R	L	N	P	D	D	F	P	V	K	I	A	A	E	L	K	D	F	D	V	E	K	Y	L	E	K	K	E	A	R	K	X	D	R	F	T	H	Y	A	I	A	S	A	E
Template Known Secondary structure													B	T	T	B	S	S										T	T									S	S		G	G	G	S	S								S	S			G	G	G	T	S						T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
		36	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.					50	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	I	E	R	T	G	V	P	A	Y	A	V	D	.	.	.	.	E	V	I	L	G	Q	V	L	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	G	Q	N	P	A	R	Q	S	A	I	K	G	G	L	P	N	S	V	S	A	I	T	I	N
Query Conservation																.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template Conservation																																																																										.	.
Template Sequence		X	A	V	Q	D	S	G	L	V	I	D	D	S	N	A	N	R	V	G	V	W	I	G	S	G	I	G	G	X	E	T	F	E	T	Q	Y	E	I	F	L	N	R	G	H	R	R	V	S	P	F	F	V	P	X	X	I	P	D	X	G	S	G	Q	V	S	I	R	F	G	A	K	G	.	.	I	N	S	T	T	V
Template Known Secondary structure								T					T	T	T	G	G	G								S	S																		T	T	T	S		T	T						S	T	T											T			S	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.			.	.	.	.	160	.
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	V	C	G	S	G	L	K	A	L	H	L	A	T	Q	A	I	Q	C	G	E	A	D	I	V	I	A	G	G	Q	E	N	M	S	R	A	P	H	V	L	T	D	S	R	T	G	A	Q	L	G	N	S	Q	L	V	D	S	L	V	H	D	G	L	W	D	A	F	N	D	Y	H	I	G	V	T	A	E	N	L	A
Query Conservation
Alig confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	A	C	A	T	A	T	N	S	I	G	D	A	F	K	V	I	E	R	G	D	A	D	A	X	I	T	G	G	A	E	A	P	I	T	K	X	S	L	A	G	F	T	A	N	K	A	L	S	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			G	G	G															T	T	S		S												S										T	T		B				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	E	Y	G	I	S	R	Q	L	Q	D	A	Y	A	L	S	S	Q	Q	K	A	R	A	A	I	D	A	G	R	F	K	D	E	I	V	P	V	M	T	Q	S	N	G	Q	T	L	V	V	D	T	D	E	Q	P	R	T	D	A	S	A	E	G	L	A	R	L	N	P	S	F	D	S	L	G	S	V	T	A	G	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	P	E	T	A	C	R	P	F	D	K	D	R	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T	S			T	T	B	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																			213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.						.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.
Query Sequence		A	S	S	I	N	D	G	A	A	A	V	M	M	M	S	E	A	K	A	R	A	L	N	L	P	V	L	A	R	I	R	A	F	A	S	V	G	V	.	.	.	.	.	D	P	A	L	M	G	I	A	P	V	Y	A	T	R	R	C	L	E	R	V	G	W	Q	L	A	E	V	D	L	I	E	A	N	E	A	F	A
Query Conservation																																								.	.	.	.	.
Alig confidence																																								.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	F	I	I	G	E	G	A	G	I	V	I	L	E	E	Y	E	H	A	K	A	R	G	A	K	I	Y	A	E	I	V	G	Y	G	A	T	G	D	A	Y	H	I	T	A	P	A	P	N	G	E	G	A	A	R	A	X	K	X	A	I	D	D	A	G	L	T	P	D	K	V	D	Y	I	N	A	H	G	T	S	T
Template Known Secondary structure		S	B		B	B																		T																	S		S	S	S			G	G	G															T			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
		321	.						.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.																												.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	Q	.	.	.	.	.	A	L	S	V	G	K	M	L	E	W	D	E	R	R	V	N	V	N	G	G	A	I	A	L	G	H	P	I	G	A	S	G	C	R	I	L	V	S	L	V	H	E	M	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R
Query Conservation				.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	Y	N	D	E	Y	E	T	Q	A	I	K	T	V	F	G	E	H	A	K	K	L	A	I	S	S	T	K	S	X	T	G	H	T	L	G	A	S	G	G	I	E	A	I	F	A	L	L	T	I	R	D	N	I	I	A	P	T	I	H	L	K	N	Q	D	E	V	C	D	L	D	Y	V	P	N	E	A	R	E	A
Template Known Secondary structure																	G	G	G	T	T	T	S					T						B		G	G	G																T					B	T	T			S	B		S	S			S				B	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	A	R	K	G	L	A	T	L	C	I	G	G	G	Q	G	V	A	L	T	I	E	R	D	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		N	V	N	V	V	I	S	N	S	F	G	F	G	G	H	N	A	T	L	V	F	K	R	I	E
Template Known Secondary structure													T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.