Job Description Q46939 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:35:58 GMT 2012 Rank 33 Aligned Residues 295 % Identity 23% Template c2iwyB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase; PDBTitle: human mitochondrial beta-ketoacyl acp synthase Resolution 2.06 Å

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		1	.	.		.	.	.	.	.		.	10	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.						.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.						.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	K	D	.	V	V	I	V	G	.	A	L	R	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	C	F	R	G	A	L	A	G	H	S	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation					.						.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.						.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	H	R	R	V	V	I	T	G	I	G	L	V	T	P	L	G	V	G	T	H	L	V	W	D	R	L	I	G	G	E	S	G	I	V	S	L	V	G	E	E	Y	K	S	I	P	C	S	V	A	A	Y	V	P	R	G	S	D	E	G	Q	F	N	E	Q	N	F	V	S	K	S	D	I	K	S	M	S	S	P	T
Template Known Secondary structure																T	T			S										T	T									S	G	G	G	T	T		S									B	S	S	S	T	T		B		G	G	G	T	S						T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		28	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.						.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	L	G	S	L	V	V	K	A	L	I	E	R	T	G	V	P	.	.	.	.	.	A	Y	A	V	D	E	V	I	L	G	Q	V	L	T	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	Q	N	P	A	R	Q	S	A	I	K	G	G	L	P
Query Conservation																			.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	M	A	I	G	A	A	E	L	A	M	K	D	S	G	W	H	P	Q	S	E	A	D	Q	V	A	T	G	V	A	I	G	M	G	M	I	P	L	E	V	V	S	E	T	A	L	N	F	Q	T	K	G	Y	N	K	V	S	P	F	F	V	P	K	I	L	V	N	M	A	A	G	Q	V	S	I	R	Y	K	L	K
Template Known Secondary structure																T					S						T								S																			G	G	G	S		T	T							T	T											T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	S	V	S	A	I	T	I	N	D	V	C	G	S	G	L	K	A	L	H	L	A	T	Q	A	I	Q	C	G	E	A	D	I	V	I	A	G	G	Q	E	N	M	S	R	A	P	H	V	L	T	D	S	R	T	G	A	Q	L	G	N	S	Q	L	V	D	S	L	V	H	D	G	L	W	D	A	F	N	D	Y	H
Query Conservation
Alig confidence			.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	.	.	P	N	H	A	V	S	T	A	C	T	T	G	A	H	A	V	G	D	S	F	R	F	I	A	H	G	D	A	D	V	M	V	A	G	G	T	D	S	C	I	S	P	L	S	L	A	G	F	S	R	A	R	A	L	S	T	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	.	.								G	G	G																T	S		S												S										T	T		B				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		200			.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	G	V	T	A	E	N	L	A	R	E	Y	G	I	S	R	Q	L	Q	D	A	Y	A	L	S	S	Q	Q	K	A	R	A	A	I	D	A	G	R	F	K	D	E	I	V	P	V	M	T	Q	S	N	G	Q	T	L	V	V	D	T	D	E	Q	P	R	T	D	A	S	A	E	G	L	A	R	L	N	P	S	F	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	P	K	L	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																												258	.	260	.	.	.
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.						.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	L	G	S	V	T	A	G	N	A	S	S	I	N	D	G	A	A	A	V	M	M	M	S	E	A	K	A	R	A	L	N	L	P	V	L	A	R	I	R	A	F	A	S	V	G	V	.	.	.	.	.	D	P	A	L	M	G	I	A	P	V	Y	A	T	R	R	C	L	E	R	V	G	W	Q	L	A	E	V	D
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	R	P	F	H	P	K	R	D	G	F	V	M	G	E	G	A	A	V	L	V	L	E	E	Y	E	H	A	V	Q	R	R	A	R	I	Y	A	E	V	L	G	Y	G	L	S	G	D	A	G	H	I	T	A	P	D	P	E	G	E	G	A	L	R	C	M	A	A	A	L	K	D	A	G	V	Q	P	E	E	I	S
Template Known Secondary structure				T	T		T	T				B		B	B																	T	T																	S		S	S	S			T	T																T			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320					.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.		.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.																										.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.																										.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	I	E	A	N	E	A	F	A	.	.	.	.	A	Q	A	L	S	V	G	K	M	L	E	W	D	E	R	R	V	N	V	N	G	G	A	I	A	.	L	G	H	P	I	G	A	S	G	C	R	I	L	V	S	L	V	H	E	M	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation											.	.	.	.																										.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.																										.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	I	N	A	H	A	T	S	T	P	L	G	D	A	A	E	N	K	A	I	K	H	L	F	K	D	H	A	Y	A	L	A	V	S	S	T	K	G	A	T	G	H	L	L	G	A	A	G	A	V	E	A	A	F	T	T	L	A	C	Y	Y	Q	K	L	P	P	T	L	N	L	D	C	S	E	P	E	F	D	L	N
Template Known Secondary structure									S																	G	G	G	G	G	T	S											B		G	G	G																T					B	T	T		S				T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
													368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	N	A	R	K	G	L	A	T	L	C	I	G	G	G	Q	G	V	A	L	T	I	E	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	V	P	L	K	A	Q	E	W	K	T	E	K	R	F	I	G	L	T	N	S	F	G	F	G	G	T	N	A	T	L	C	I	A	G
Template Known Secondary structure				B	S	S							S	S											T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.