Job Description Q46939 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:35:58 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 294 % Identity 21% Template c1oxhD_ PDB info PDB header:transferase Chain: D: PDB Molecule:beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase; PDBTitle: the crystal structure of beta-ketoacyl-[acyl carrier2 protein] synthase ii from streptococcus pneumoniae,3 triclinic form Resolution 2.09 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10		.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	K	D	V	V	I	V	G	A	L	.	R	T	P	I	G	C	F	R	G	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	H	S	A	V	E	L	G	S	L	V	V
Query Conservation												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	N	R	V	V	V	T	G	Y	G	V	T	S	P	I	G	N	T	P	E	E	F	W	N	S	L	A	T	G	K	I	G	I	G	G	I	T	K	F	D	H	S	D	F	D	V	H	N	A	A	E	I	Q	D	F	P	F	D	K	Y	F	V	K	K	D	T	N	R	F	D	N	Y	S	L	Y	A	L	Y	A	A
Template Known Secondary structure														B	T	T	B	S	S											T									S	S			T	T	S	S									S									G	G	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		35	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.					50	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	A	L	I	E	R	T	G	V	P	A	Y	A	V	D	.	.	.	.	E	V	I	L	G	Q	V	L	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	G	Q	N	P	A	R	Q	S	A	I	K	G	G	L	P	N	S	V	S	A	I	T	I
Query Conservation																	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.
Template Conservation																																																																											.	.
Template Sequence		Q	E	A	V	N	H	A	N	L	D	V	E	A	L	N	R	D	R	F	G	V	I	V	A	S	G	I	G	G	I	K	E	I	E	D	Q	V	L	R	L	H	E	K	G	P	K	R	V	K	P	M	T	L	P	K	A	L	P	N	M	A	S	G	N	V	A	M	R	F	G	A	N	G	.	.	V	C	K	S	I
Template Known Secondary structure								T	T			G	G	G	S		G	G	G								S	S		S																G	G	G	S		T	T						S	T	T											T			S	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.			.	.	.	.	160
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	D	V	C	G	S	G	L	K	A	L	H	L	A	T	Q	A	I	Q	C	G	E	A	D	I	V	I	A	G	G	Q	E	N	M	S	R	A	P	H	V	L	T	D	S	R	T	G	A	Q	L	G	N	S	Q	L	V	D	S	L	V	H	D	G	L	W	D	A	F	N	D	Y	H	I	G	V	T	A	E	N	L
Query Conservation
Alig confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	T	A	C	S	S	S	N	D	A	I	G	D	A	F	R	S	I	K	F	G	F	Q	D	V	M	L	V	G	G	T	E	A	S	I	T	P	F	A	I	A	G	F	Q	A	L	T	A	L	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				G	G	G															T	T	S		S												S											T		B				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	E	Y	G	I	S	R	Q	L	Q	D	A	Y	A	L	S	S	Q	Q	K	A	R	A	A	I	D	A	G	R	F	K	D	E	I	V	P	V	M	T	Q	S	N	G	Q	T	L	V	V	D	T	D	E	Q	P	R	T	D	A	S	A	E	G	L	A	R	L	N	P	S	F	D	S	L	G	S	V	T	A	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	P	T	R	A	S	I	P	F	D	K	D	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		T	T	T	S			T	T	B	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																				213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.						.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.
Query Sequence		N	A	S	S	I	N	D	G	A	A	A	V	M	M	M	S	E	A	K	A	R	A	L	N	L	P	V	L	A	R	I	R	A	F	A	S	V	G	V	.	.	.	.	.	D	P	A	L	M	G	I	A	P	V	Y	A	T	R	R	C	L	E	R	V	G	W	Q	L	A	E	V	D	L	I	E	A	N	E	A	F
Query Conservation																																									.	.	.	.	.
Alig confidence																																									.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	G	F	V	M	G	E	G	S	G	M	L	V	L	E	S	L	E	H	A	E	K	R	G	A	T	I	L	A	E	V	V	G	Y	G	N	T	C	D	A	Y	H	M	T	S	P	H	P	E	G	Q	G	A	I	K	A	I	K	L	A	L	E	E	A	E	I	S	P	E	Q	V	A	Y	V	N	A	H	G	T	S
Template Known Secondary structure				B		B	B																		T																	S		S	S	S			T	T																T			G	G	G										S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
		320					.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.		.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.																										.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.																										.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	.	.	.	.	A	Q	A	L	S	V	G	K	M	L	E	W	D	E	R	R	V	N	V	N	G	G	A	I	A	.	L	G	H	P	I	G	A	S	G	C	R	I	L	V	S	L	V	H	E	M	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation			.	.	.	.																										.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.																		.	.	.						.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.
Template Sequence		T	P	A	N	E	K	G	E	S	G	A	I	V	A	V	L	G	K	E	V	P	V	.	.	.	S	S	T	K	S	F	T	G	H	L	L	G	A	A	G	A	V	E	A	I	V	T	I	E	A	M	R	H	N	F	V	P	M	T	A	G	T	S	E	V	S	D	Y	I	E	A	N	V	V	Y	G	Q	G	L	E
Template Known Secondary structure																			S		S			.	.	.			T						B		G	G	G															T	T					B	S	S			S	B		T	T			S				B	S	S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.
Template SS confidence
		307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.				.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	N	A	R	K	G	L	A	T	L	C	I	G	G	G	Q	G	V	A	L	T	I	E	R	D	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	E	I	P	Y	A	I	S	N	T	F	G	F	G	G	H	N	A	V	L	A	F	K	R	W	E
Template Known Secondary structure					S									T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.