Job Description P33602 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:52:24 GMT 2012 Rank 24 Aligned Residues 550 % Identity 10% Template d1vlfm2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 2.00

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.
Query Sequence		C	Q	Q	C	S	I	G	C	N	I	S	P	G	E	R	Y	G	E	L	R	R	I	E	N	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	N	G	T	V	N	H	Y	F	L	C	D	R	G	R	F	G	Y	G	Y	V	N	L	K	D	R	P	R	Q	P	V	Q	R	R	G	.	.
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	T	N	S	S	T	G	G	P	V	F	V	Y	V	K	D	G	K	I	I	R	M	T	P	M	D	F	D	D	A	V	D	A	P	S	W	K	I	E	A	R	G	K	T	F	T	P	P	R	K	T	S	I	A	P	Y	T	A	G	F	K	S	M	I	Y	S	D	L	R	I	P	Y	P	M	K	R	K	S	F	D
Template Known Secondary structure							T	T									T	T									B			T	T	T	S									T	T							S	B									T	T					T		T	T	B			S					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
																						288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.								.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.							.	.	330	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	F	I	T	L	N	A	E	Q	A	M	Q	G	A	A	D	I	L	R	Q	S	K	K	V	I	G	.	.	.	.	.	.	.	I	G	S	P	R	A	S	V	E	S	N	F	A	.	.	.	.	.	.	L	R	E	L	V	G	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	N	G	E	R	N	P	Q	L	R	G	A	G	L	S	K	Q	D	P	W	S	D	Y	E	R	I	S	W	D	E	A	T	D	I	V	V	A	E	I	N	R	I	K	H	A	Y	G	P	S	A	I	L	S	T	P	S	S	H	H	M	W	G	N	V	G	Y	R	H	S	T	Y	F	R	F	M	N	M	M	G	F
Template Known Secondary structure		T	T	S				G	G	G	T	T					T	T		G	G	G	G																								T		G	G	G							S				S		T	T	T	S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.					.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.		.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.						.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.															.																					.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.															.																					.	.	.	.	.
Query Sequence		E	N	F	Y	T	G	I	A	H	G	E	Q	E	R	L	Q	L	A	L	K	.	.	.	.	V	L	R	E	G	G	I	Y	T	P	A	L	R	E	.	I	E	S	Y	D	A	V	L	V	L	G	E	D	V	T	Q	T	G	A	R	.	.	.	.	.	V	A	L	A	V	R	Q	A	V	K	G	K	A	R	E	M
Query Conservation																						.	.	.	.															.																					.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.															.																					.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	Y	A	D	H	N	P	D	S	W	E	G	W	H	W	G	G	M	H	M	W	G	F	S	W	R	L	G	N	P	E	Q	Y	D	L	L	E	D	G	L	K	H	A	E	M	I	V	F	W	S	S	D	P	E	T	N	S	G	I	Y	A	G	F	E	S	N	I	R	R	Q	W	L	K	D	L	G	V	D	F	V
Template Known Secondary structure									T	T	T						T								G	G	G	T	T					T	T										S						S								S	S	S		T	T	T	T										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.		.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.						440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.							.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure														.																								.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.																								.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	A	Q	K	V	A	D	W	Q	I	A	.	A	I	L	N	I	G	Q	R	A	K	H	P	L	F	V	T	N	V	D	D	T	R	L	.	.	.	.	.	D	D	I	A	A	W	T	Y	R	A	P	V	E	D	Q	A	R	L	G	F	A	I	.	.	.	.	.	.	A	H	A	L	D	N	S	A	P	A	V
Query Conservation														.																								.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.																								.	.	.	.	.											.	.											.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.
Template Sequence		F	I	D	P	H	M	N	H	T	A	R	L	V	A	D	K	W	F	S	P	K	I	G	T	D	H	A	L	S	F	A	I	A	Y	T	W	L	K	E	D	S	Y	D	K	E	Y	V	A	A	N	A	.	.	H	G	F	E	E	W	A	D	Y	V	L	G	K	T	D	G	T	P	K	T	C	E	W	A	E	E	E
Template Known Secondary structure					S	S										S							T	T																	T		S										.	.		S									T	T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.			.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
		473	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.						500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	G	I	E	P	E	L	Q	S	K	I	D	V	I	V	Q	A	L	A	G	A	K	K	P	L	I	I	.	.	.	.	.	S	G	T	N	A	G	S	L	E	V	I	Q	A	A	A	N	V	A	K	A	L	K	G	R	G	A	D	V	G	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																													.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.																							.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.
Template Sequence		S	G	V	P	A	C	E	I	R	A	L	A	R	Q	W	A	K	K	N	T	Y	L	A	A	G	G	L	G	G	W	G	G	A	C	R	A	S	H	G	I	E	W	A	R	G	M	I	A	L	A	T	M	Q	G	.	M	G	K	P	G	S	N	M	W	S	T	T	Q	G	V	P	L	D	Y	E	F	Y	F	P	G
Template Known Secondary structure																			S							T	T	T	T	S			G	G	G	S	S	T	T															T	T	.	T	T	S	T	T						S	S	S						T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																								.
Template SS confidence
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.		.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
																																531	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	I	A	R	S	V	N	S	M	G	L	G	I	M	G	G	G	S	L	E	E	A	L	T	E	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	A	E	G	G	I	S	G	D	C	E	N	S	A	A	G	F	K	F	A	W	R	M	F	D	G	K	T	T	F	P	S	P	S	N	L	N	T	S	A	G	Q	H	I	P	R	L	K	I	P	E	C	I	M	G	G	K	F	Q	W	S	G	K	G	F	A	G	G	D	I	S	H	Q	L	H	Q	Y	E	Y	P
Template Known Secondary structure		G	G	G		T	T	S			T	T	T	S	G	G	G	T	T								S	S	S							S	S	S	S	T	T	S					G	G	G								S								S	S			S	S	T	T	G	G	G						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.
					558	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.		.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.			.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.												.																	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.												.																	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	T	G	R	A	D	A	V	V	V	L	E	.	N	D	L	H	R	H	A	S	A	I	R	V	N	A	A	L	.	.	A	K	A	P	L	V	M	V	V	D	H	Q	R	T	A	I	M	E	N	A	H	L	V	L	S	A	A	S	F	A	E	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.												.																	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.												.																	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	P	G	Y	S	K	I	K	M	F	W	K	Y	G	G	P	H	L	G	T	M	T	A	T	N	R	Y	A	K	M	Y	T	H	D	S	L	E	F	V	V	S	Q	S	I	W	F	E	G	E	V	P	F	A	D	I	I	L	P	A	C	T	N	F	E	R	W	D	I	S	E	F	A	N	C	S	G	Y	I	P	D
Template Known Secondary structure			T	T											S							S	S	S	T							T	T		T	T									S	B	S		T	T	G	G	G		S					B			G	G	G	S						T	T			B	T	T	B	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		484	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
		618	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.			.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.
Query SS confidence																																																			.	.
Query Sequence		G	T	V	I	N	N	E	G	R	A	Q	R	F	F	Q	V	Y	D	P	A	Y	Y	D	S	K	T	V	M	L	E	S	W	R	W	L	H	S	L	H	S	T	L	L	S	R	E	V	D	W	.	.	T	Q	L	D	H	V	I	D	A	V	V	A	K	I	P	E	L	A	G	I	K	D	A	A	P	D	A	T	F
Query Conservation																																																			.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.																												.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.
Template Sequence		N	Y	Q	L	C	N	H	R	V	I	S	L	Q	A	K	C	I	.	.	.	.	.	E	P	V	G	E	S	M	S	D	Y	E	I	Y	R	L	F	A	K	K	L	N	I	E	E	M	F	S	E	G	K	D	E	L	A	W	C	E	Q	Y	F	N	A	T	D	M	P	K	Y	M	T	W	D	E	F	F	K	K	G
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	S	S	S										S	.	.	.	.	.			S	T	T		B													T	T							T	T													T	S	S	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		564	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580						.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.
		696	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	I	R	G	Q	K	L	A	R	E	P	H	R	Y	S	G	R	T	A	M	R	A	N	I	S	V	H	E	P	R	Q	P	Q	D	I	D	T	M	F	T	F	S	M	E	G	N	N	Q	P	T	A	H	R	S	Q	V	P	F	A	W	A	P	G	W	N	S	P	Q	A	W	N	K	F	Q	D	E	V	G	G	K
Query Conservation
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	F	V	V	P	D	N	P	N	R	K	K	T	V	A	L	R	W	F	A	E	G	R	E	K	D	T	P	D	W	G	P	R	L	N	N	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	C	R	K	G	L	Q	T	T	T	G	K	V	E	F	I	A	T	S	L	K	N
Template Known Secondary structure									T	T	S					T	T					T	T	S				S	S		S		S		G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	T	T	B	S		S	S	T	T	S	S			S	B
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		639	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.
		776	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	F	G	D	P	G	V	R	L	F	E	T	S	E	N	G	L	D	Y	F	T	S	V	P	A	R	F	Q	P	Q	D
Query Conservation
Alig confidence																								.
Template Conservation																								.
Template Sequence		F	E	E	Q	G	Y	I	D	E	H	R	P	S	M	H	T	Y	V	P	A	W	E	.	S	Q	K	H	S	P	L	A	V
Template Known Secondary structure					T	T				T	T	S		S	B							T	T	.	S	T	T	T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																								.
Template SS confidence
		698	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.		720	.	.	.	.	.	.	.	.