Job Description P33602 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:52:24 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 568 % Identity 16% Template d1h0ha2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 1.8

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.			.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.			290	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.																																																	.	.
Query SS confidence																											.	.																																																	.	.
Query Sequence		R	K	W	D	M	Q	F	A	P	S	I	C	Q	Q	C	S	I	G	C	N	I	S	P	G	E	.	.	R	Y	G	E	L	R	R	I	E	N	R	Y	N	G	T	V	N	H	Y	F	L	C	D	R	G	R	F	G	Y	G	Y	V	N	L	K	D	R	P	R	Q	P	V	Q	R	R	G	D	D	.	.	F	I	T
Query Conservation																											.	.																																																	.	.
Alig confidence																											.	.																																																	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	T	V	D	A	K	Q	T	T	S	V	C	C	Y	C	S	V	G	C	G	L	I	V	H	T	D	K	K	T	N	R	A	I	N	V	E	G	D	P	D	H	P	I	N	E	G	S	L	C	A	K	G	A	S	T	W	Q	L	A	E	N	E	R	R	P	A	N	P	L	Y	R	A	P	G	S	D	Q	W	E	E
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	S								S	S	B	T	T										T	T	T										T	T		T	T	T	T	T								T						S		T	T	S		S	S						T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.			340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Query Sequence		L	N	A	E	Q	A	M	Q	G	A	A	D	I	L	R	Q	S	K	K	V	I	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	P	R	A	S	V	E	S	N	F	A	L	R	E	L	V	G	E	E	N	F	Y	T	.	.	G	I	A	H	G	E	Q	E	R	L	Q	L	A
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	S	W	D	W	M	L	D	T	I	A	E	R	V	A	K	T	R	E	A	T	F	V	T	K	N	A	K	G	Q	V	V	N	R	C	D	G	I	A	S	V	G	S	A	A	M	D	N	E	E	C	W	I	Y	Q	A	W	L	R	S	L	G	L	F	Y	I	E	H	Q	A	R	I	H	S	A	T	V	A	A	L
Template Known Secondary structure																												T	T	S								S							T	T	S															T	T	B						G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		353	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	K	V	L	R	E	G	G	I	Y	T	P	A	L	R	E	I	E	S	Y	D	A	V	L	V	L	G	E	D	V	T	Q	T	G	A	R	V	A	L	A	V	R	Q	A	V	K	G	K	A	R	E	M	A	A	A	Q	K	V	A	D	W	Q	I	A	A	I	L	N	I	G	Q	R	A	K	H	P	L	F	V	T
Query Conservation
Alig confidence							.
Template Conservation							.
Template Sequence		A	E	S	Y	G	.	R	G	A	M	T	N	H	W	I	D	L	K	N	S	D	V	I	L	M	M	G	S	N	P	A	E	N	H	P	I	S	F	K	W	V	M	R	A	K	D	K	G	A	T	L	I	H	V	D	P	R	Y	T	R	T	S	T	K	C	D	L	Y	A	P	L	R	S	G	S	D	I	A	F	L
Template Known Secondary structure						S	.			S		S	S		T	G	G	G	G	G		S						S							S	T	T											T	T								S	S			T	T	G	G	G		S							T	T
Template Predicted Secondary structure							.
Template SS confidence
		167	.	.	170	.		.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		433	.	.	.	.	.	.						440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.																																																			.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	V	D	D	T	R	L	.	.	.	.	.	D	D	I	A	A	W	T	Y	R	A	P	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	Q	A	R	L
Query Conservation									.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	G	M	T	K	Y	I	L	E	K	E	L	Y	F	K	D	Y	V	V	N	Y	T	N	A	S	F	I	V	G	E	G	F	A	F	E	E	G	L	F	A	G	Y	N	K	E	T	R	K	Y	D	K	S	K	W	G	F	E	R	D	E	N	G	N	P	K	R	D	E	T	L	K	H	P	R	C	V	F	Q	I	M
Template Known Secondary structure											T	T		S									B	G	G	G	B	B	B		T	T					T	T			T	T			T	T	T	T				G	G	G	G		B		B		T	T	S		B		B		T	T	S		S	T	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
		458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500						.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.		.	.	.	530	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.																											.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.																											.
Query Sequence		G	F	A	I	A	H	A	L	D	N	S	A	P	A	V	D	G	I	E	P	E	L	Q	S	K	I	D	V	I	V	Q	A	L	A	G	A	K	K	P	L	I	I	S	.	.	.	.	.	G	T	N	A	G	S	L	E	V	I	Q	A	A	A	N	V	A	K	A	L	K	G	R	G	A	D	.	V	G	I	T	M
Query Conservation																																													.	.	.	.	.																											.
Alig confidence																																													.	.	.	.	.																											.
Template Conservation
Template Sequence		K	K	H	Y	E	R	Y	D	L	D	K	I	S	A	I	C	G	T	P	K	E	L	I	L	K	V	Y	D	A	Y	C	A	T	G	K	P	D	K	A	G	T	I	M	Y	A	M	G	W	T	Q	H	T	V	G	V	Q	N	I	R	A	M	S	I	N	Q	L	L	L	G	N	I	G	V	A	G	G	G	V	N	A
Template Known Secondary structure						T	T																										G	G	G	S	T	T												S	S																		T	T		S	S	S	T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
		532	.	.	.	.	.	.	.	540
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	A	R	S	V	N	S	M	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	R	G	E	A	N	V	Q	G	S	T	D	H	G	L	L	M	H	I	Y	P	G	Y	L	G	T	A	R	A	S	I	P	T	Y	E	E	Y	T	K	K	F	T	P	V	S	K	D	P	Q	S	A	N	W	W	S	N	F	P	K	Y	S	A	S	Y	I	K	S	M	W	P	D	A	D	L	N	E	A	Y	G	Y
Template Known Secondary structure				S	B	T	T							T	T		B	T	T			T	T	T					B	T	T			S															T	T				G	G	G	G														T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.
					541	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.		.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																													.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																													.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	L	G	I	M	G	G	G	S	L	E	E	A	L	T	E	L	E	T	G	R	A	D	A	V	V	V	L	E	.	N	D	L	H	R	H	A	S	A	I	R	V	N	A	A	L	A	K	A	P	L	V	M	V	V	D	H	Q	R	T	A	I	M	E	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.																													.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																													.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	P	K	G	E	D	G	K	D	Y	S	W	L	T	L	F	D	D	M	F	Q	G	K	I	K	G	F	F	A	W	G	Q	N	P	A	C	S	G	A	N	S	N	K	T	R	E	A	L	T	K	L	D	W	M	V	N	V	N	I	F	D	N	E	T	G	S	F	W	R	G	P	D	M	D	P	K	K	I	K	T
Template Known Secondary structure		S			B		T	T				S										T	T									S							S	S	S									T	T		S							S	S			T	T	T	T	G	G	G	S	T	T			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		486	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
		604	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660																							.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	H	L	V	L	S	A	A	S	F	A	E	S	D	G	T	V	I	N	N	E	G	R	A	Q	R	F	F	Q	V	Y	D	P	A	Y	Y	D	S	K	T	V	M	L	E	S	W	R	W	L	H	S	L	H	S	T	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	V	F	F	L	P	C	A	V	A	I	E	K	E	G	S	I	S	N	S	G	R	W	M	Q	W	R	Y	V	G	P	.	.	.	.	.	E	P	R	K	N	A	I	P	D	G	D	L	I	V	E	L	A	K	R	V	Q	K	L	L	A	K	T	P	G	K	L	A	A	P	V	T	K	L	K	T	D	Y	W	V
Template Known Secondary structure								B			G	G	G								T	T									S	S	.	.	.	.	.				T	T		B																				S		T	T								S		G	G	G	G	B
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		566	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.						.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640
		662	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	E	V	D	W	T	Q	L	D	H	V	I	D	A	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	I	P	E	L	A	G	I	K	D	A	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	T	F	R	I	R	G	Q	K	L	A	R	E	P	H
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	D	H	G	H	F	D	P	H	K	I	A	K	L	I	N	G	F	A	L	K	D	F	K	V	G	D	V	E	Y	K	A	G	Q	Q	I	A	T	F	G	H	L	Q	A	D	G	S	T	T	S	G	C	W	I	Y	T	G	S	Y	T	E	K	G	N	M	A	A	R	R	D	K	T	Q	T	D	M	Q	A	K	I
Template Known Secondary structure			T	T	S		B												B	B	S	S					T	T					T	T		B		S		G	G	G			T	T	S		B			S	S	G	G	G	T	T	S			T	T			G	G	G		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		641	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
		708	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.										.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	Y	S	G	R	T	A	M	R	A	N	I	S	V	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	P	R	Q	P	Q	D	I	D	T	M	F	T	F	S	M	E	G	N	N	Q	P	T	A	H	R	S	Q	V	P	F	A	W	A	P	G	W	N	S	P	Q	A	W	N	K	F	Q	D	E	V	G	G	K	L	R	F
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.
Template Conservation																																																		.	.
Template Sequence		G	L	Y	P	G	W	T	W	A	W	P	V	N	R	R	I	I	Y	N	R	A	S	V	D	L	N	G	K	P	Y	A	P	E	K	A	V	V	E	W	N	A	A	E	K	K	W	V	G	.	.	D	V	P	D	G	P	W	P	P	Q	A	D	K	E	K	G	K	R	A	F	I	M	K	P	E	G	Y	A	Y	L
Template Known Secondary structure		T			T	T	B	S			T	T	T	T		S	S	T	T	G	G	G	G	B		T	T	S		B	S		G	G	G		S					T	T	T	T					.	.	S			S	S		S			T	T		T	T	T				S		T	T	S	S	S	S		B		S
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.
Template SS confidence
		721	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.			.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.
		779	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	D	P	G	V	R	L	F	E	T	S	E	N	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Y	G	P	G	R	E	D	G	P	L	P	E	Y	Y
Template Known Secondary structure		S		T	T	S	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		799	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.