Job Description P33602 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:52:24 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 619 % Identity 15% Template c2vpyE_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: E: PDB Molecule:thiosulfate reductase; PDBTitle: polysulfide reductase with bound quinone inhibitor,2 pentachlorophenol (pcp) Resolution 2.50 Å

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		218	.				220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.							.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.																																																																				.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.																																																																				.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	W	.	.	.	D	M	Q	F	A	P	S	I	C	Q	Q	C	S	I	G	C	N	I	S	P	G	E	R	Y	G	E	L	R	R	I	E	N	R	Y	N	G	T	V	N	H	Y	F	L	C	D	R	G	R	F	G	Y	G	Y	V	N	L	K	D	R	P	R	Q	P	V	Q	R	R	.	.	.	.	.	.	G	D
Query Conservation				.	.	.																																																																				.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.																																																																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	W	Y	A	Q	E	V	K	S	V	Y	Q	I	C	E	G	C	F	W	R	C	G	I	V	A	H	A	V	G	N	R	V	Y	K	V	E	G	Y	E	A	N	P	K	S	R	G	R	L	C	P	R	G	Q	G	A	P	Q	T	T	Y	D	P	D	R	L	K	R	P	L	I	R	V	E	G	S	Q	R	G	E	G
Template Known Secondary structure			T	T	S	S											S	S	T	T									S	S	S									T	T	S	T	T	T	T	T									G	G	G	G	G	G		T	T	S			S						T	T			S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		31	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110
		289	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.							.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	F	I	T	L	N	A	E	Q	A	M	Q	G	A	A	D	I	L	R	Q	S	K	K	V	I	G	.	.	.	.	.	.	I	G	S	P	R	A	S	V	E	S	N	F	A	L	R	E	L	V	G	E	E	N	F	Y	T	G	I	A	H	G	E	Q	E	R	L	Q	L	A	L	K	V	L	R	E	G	G	I	Y
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	Y	R	V	A	T	W	E	E	A	L	D	H	I	A	K	K	M	L	E	I	R	E	K	Y	G	P	E	A	I	A	F	F	G	H	G	T	G	D	Y	W	F	V	D	F	L	P	A	A	W	G	S	P	N	A	A	K	P	S	V	S	L	C	T	A	P	R	E	V	A	S	Q	W	V	F	G	R	P	I	G
Template Known Secondary structure																												G	G	G	S						S	T	T					T	T	T					T	T											T	T	T											S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.		.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.																																																						.	.
Query SS confidence																										.																																																						.	.
Query Sequence		T	P	A	L	R	E	I	E	S	Y	D	A	V	L	V	L	G	E	D	V	T	Q	T	G	.	A	R	V	A	L	A	V	R	Q	A	V	K	G	K	A	R	E	M	A	A	A	Q	K	V	A	D	W	Q	I	A	A	I	L	N	I	G	Q	R	A	K	H	P	L	F	V	T	N	V	D	D	T	R	L	.	.
Query Conservation																										.																																																						.	.
Alig confidence																										.																																																						.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	H	E	P	I	D	W	E	N	A	R	Y	I	V	L	I	G	H	H	I	G	E	D	T	H	N	T	Q	L	Q	D	F	A	L	A	L	K	N	G	A	K	V	V	V	V	D	P	R	F	S	T	A	A	A	K	A	H	R	W	L	P	I	K	P	G	T	D	T	A	L	L	L	A	W	I	H	V	L	I	Y
Template Known Secondary structure		S	S			B		G	G	G		S						S			B	T	T	B															T	T								S	B			T	T	G	G	G		S							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		191	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
					440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.			.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																																																					.	.
Query SS confidence		.	.	.																																																					.	.
Query Sequence		.	.	.	D	D	I	A	A	W	T	Y	R	A	P	V	E	D	Q	A	R	L	G	F	A	I	A	H	A	L	D	N	S	A	P	A	V	D	G	I	E	P	E	L	Q	S	K	I	D	V	I	V	Q	A	L	A	.	.	G	A	K	K	P	L	I	I	S	G	T	N	A	G	S	L	E	V	I	Q	A	A	A
Query Conservation		.	.	.																																																					.	.
Alig confidence		.	.	.															.	.																																					.	.
Template Conservation																			.	.
Template Sequence		E	D	L	Y	D	K	E	Y	V	A	K	Y	T	V	G	F	E	.	.	E	L	K	A	H	V	K	D	F	T	P	E	W	A	E	K	H	T	E	I	P	A	Q	V	I	R	E	V	A	R	E	M	A	A	H	K	P	R	A	V	L	P	P	T	R	H	N	V	W	Y	G	D	D	T	Y	R	V	M	A	L	L
Template Known Secondary structure		T	T		S												T	T	.	.	T					T	T	T												S															T	T	T	S							S				S	T	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.
Template SS confidence
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.			.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.		.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	550	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	V	A	K	A	L	K	G	R	G	A	D	.	V	G	I	T	M	I	A	R	S	V	N	S	M	G	L	G	I	M	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	E	A	L	T	E	L	E
Query Conservation														.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	V	N	V	L	L	G	N	Y	G	R	P	G	G	F	Y	I	A	Q	S	P	Y	L	E	K	Y	P	L	P	P	L	P	L	E	P	A	A	G	G	C	S	G	P	S	G	G	D	H	E	P	E	G	F	K	P	R	A	D	K	G	K	F	F	A	R	S	T	A	I	Q	E	L	I	E	P	M	I	T	G	E
Template Known Secondary structure							T	T		B	T	S	T	T	S	B				B													S						S			S	S		S	T	T	T	T	S	S	S	S	S	S			T	T	T	T	S	S	S	S	S	S			G	G	G	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
		558	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.		.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.
Query SS confidence													.
Query Sequence		T	G	R	A	D	A	V	V	V	L	E	.	N	D	L	H	R	H	A	S	A	I	R	V	N	A	A	L	A	K	A	P	L	V	M	V	V	D	H	Q	R	T	A	I	M	E	N	A	H	L	V	L	S	A	A	S	F	A	E	S	D	G	T	V	I	N	N	E	G	R	A	Q	R	F	F	Q	V	Y	D	P
Query Conservation													.
Alig confidence													.																																																																.	.
Template Conservation																																																																													.	.
Template Sequence		P	Y	P	I	K	G	L	F	A	Y	G	I	N	L	F	H	S	I	P	N	V	P	R	T	K	E	A	L	K	N	L	D	L	Y	V	A	I	D	V	L	P	Q	E	H	V	M	W	A	D	V	I	L	P	E	A	T	Y	L	E	R	Y	D	D	F	V	L	V	A	H	K	T	P	F	I	Q	.	.	L	R	T
Template Known Secondary structure		S	S									S							S	S													S							S	S							T	S	S					B			G	G	G										B	S	S					.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.
Template SS confidence
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.			.	.	.
		637	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.		.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.
Query SS confidence																													.
Query Sequence		A	Y	Y	D	S	K	T	V	M	L	E	S	W	R	W	L	H	S	L	H	S	T	L	L	S	R	E	.	V	D	W	T	Q	L	D	H	V	I	D	A	V	V	A	K	I	P	E	L	A	G	I	K	D	A	A	P	D	A	T	F	R	I	R	G	Q	K	L	A	R	E	P	H	R	Y	S	G	R	T	A	M
Query Conservation																													.
Alig confidence																													.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	A	H	E	P	L	F	D	T	K	P	G	W	W	I	A	R	E	L	G	L	R	L	G	L	E	Q	Y	F	P	W	K	T	I	E	E	Y	L	E	T	R	L	Q	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	D	L	E	T	M	K	G	M	G	T	L	V	Q	R	G	K	P	W
Template Known Secondary structure			S	S				S	S		B												T	T	T		T	T	T				S											T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T										S									S
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		507	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.																.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.
		716	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	A	N	I	S	V	H	E	P	R	Q	P	Q	D	I	D	T	M	F	T	F	S	M	E	G	N	N	Q	P	T	A	H	R	S	Q	V	P	F	A	W	A	P	G	W	N	S	P	Q	A	W	N	K	F	Q	D	E	V	G	G	K	L	R	F	G	D	P	G	V	R	L	F	E	T	S	E	N	G	L	D	Y
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	E	D	W	E	K	E	G	R	L	P	F	G	T	A	S	G	K	I	E	L	Y	C	Q	R	F	K	E	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	Q	P
Template Known Secondary structure							T	T	T				S	S	S	S	S			S	S							S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		572	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.																																																.	.	.
		796	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.			.	.	.	.	870	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.
Query SS confidence																																																																								.	.
Query Sequence		F	T	S	V	P	A	R	F	Q	P	Q	D	G	K	W	R	I	A	P	Y	Y	H	L	F	G	S	D	E	L	S	Q	R	A	P	V	F	Q	S	R	M	P	Q	P	Y	I	K	L	N	P	A	D	A	A	K	L	G	V	N	A	G	T	R	V	S	F	S	Y	D	G	N	.	.	T	V	T	L	P	V	E	I
Query Conservation																																																																								.	.
Alig confidence																																																																								.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	P	V	F	T	P	P	E	E	P	P	E	G	F	Y	R	L	L	Y	G	R	S	P	V	H	T	F	A	R	T	Q	N	N	W	V	L	M	E	M	D	P	E	N	E	V	W	I	H	K	E	E	A	K	R	L	G	L	K	E	G	D	Y	V	M	L	V	N	Q	D	G	V	K	E	G	P	V	R	V	K	P
Template Known Secondary structure													T	T							B			T	T			G	G	G	G	T	T										S													T	T			T	T								T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		605	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.
		874	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	G	L	T	A	G	Q	V	G	L	P	M	G	M	S	G	I	A	P	V	L	A	G	A	H	L	E	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	A	R	I	R	K	D	C	V	Y	I	V	H	G	F	G	H	K	A	P	L	M	R	L	A	H	G	R	G
Template Known Secondary structure			S	S	B		T	T	B		B		B	T	T						T	T	S	T	T	T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		685	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.