Job Description P33602 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:52:24 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 675 % Identity 14% Template c1g8jC_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: C: PDB Molecule:arsenite oxidase; PDBTitle: crystal structure analysis of arsenite oxidase from2 alcaligenes faecalis Resolution 2.03 Å

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		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.						.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.						.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.
Query Sequence		N	V	Y	F	G	R	P	E	D	G	T	L	E	S	E	F	S	G	N	L	V	E	I	C	P	T	G	V	F	T	D	K	T	H	S	E	R	Y	N	R	.	.	.	.	.	K	W	D	M	Q	F	A	P	S	I	C	Q	Q	C	S	I	G	C	N	I	S	P	G	E	R	Y	G	E	.	.	.	.	.	L	R
Query Conservation																																										.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.
Alig confidence																																				.						.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.
Template Sequence		D	R	I	T	L	P	P	A	N	A	Q	R	T	N	M	T	C	H	F	C	I	V	G	C	G	Y	H	V	Y	K	W	P	E	L	.	E	E	G	G	R	A	P	E	Q	N	A	L	G	L	D	F	R	K	Q	L	P	P	L	A	S	T	L	T	P	A	M	T	N	V	V	T	E	H	D	G	A	R	Y	D	I
Template Known Secondary structure									T	T									S	S	B	T	T											T	T	.					S	S	G	G	G	S	T	T					S	S				T	T	S					G	G	G							T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																				.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.		.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.						.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	I	E	N	R	Y	N	G	T	V	N	H	Y	F	L	C	D	R	G	R	F	G	Y	G	Y	V	N	L	K	.	.	.	.	.	D	R	P	R	Q	P	V	Q	R	R	G	D	D	F	I	T	L	N	A	E	Q	A	M	Q	G	A	A	D	I	L	R	Q	S	K	K	V	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																															.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	V	V	P	D	K	A	C	V	V	N	S	G	L	S	S	T	R	G	G	K	M	A	S	Y	M	Y	T	P	T	G	D	G	K	E	R	L	S	A	P	R	L	Y	A	A	D	E	W	V	D	T	T	W	D	H	A	M	A	L	Y	A	G	L	I	K	K	T	L	D	S	D	G	P	Q	G	V	F	F	S	C
Template Known Secondary structure							T	T		T	T	T	T	T				T	T	G	G	G	T	G	G	G	S			S	S	S	T	T	T	T				S						T	T																									T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
				315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.			.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure		.	.																																											.	.
Query SS confidence		.	.																																											.	.
Query Sequence		.	.	I	G	S	P	R	A	S	V	E	S	N	F	A	L	R	E	L	V	G	E	E	N	F	Y	T	G	I	A	H	G	E	Q	E	R	L	Q	L	A	L	K	V	L	.	.	R	E	G	G	I	Y	T	P	A	L	R	E	I	E	S	Y	D	A	V	L	V	L	G	E	D	V	T	Q	T	G	A	R	V	A
Query Conservation		.	.																																											.	.
Alig confidence		.	.																																											.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	H	G	G	A	G	G	G	F	E	N	T	W	G	T	G	K	L	M	F	S	A	I	Q	T	P	M	V	R	I	H	N	R	P	A	Y	N	S	E	C	H	A	T	R	E	M	G	I	G	E	L	N	N	A	Y	E	D	A	Q	L	A	D	V	I	W	S	I	G	N	N	P	Y	E	S	Q	T	N	Y	F
Template Known Secondary structure						S	T	T															T	T	S								S	S	S	S	S	S			T	T						T	T			S			S		T	T						S						S							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
																			391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.									.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.						440
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	V	R	Q	A	V	K	G	K	A	R	E	M	A	A	A	Q	K	V	A	D	W	Q	I	A	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	L	N	I	G	Q	R	A	K	H	P	L	F	V	T	N	V	D	D	T	R	L	.	.	.	.	.	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	N	H	W	L	P	N	L	Q	G	A	T	T	S	K	K	K	E	R	F	P	N	E	N	F	P	Q	A	R	I	I	F	V	D	P	R	E	T	P	S	V	A	I	A	R	H	V	A	G	N	D	R	V	L	H	L	A	I	E	P	G	T	D	T	A	L	F	N	G	L	F	T	Y	V	V	E	Q	G	W	I
Template Known Secondary structure				T						T	T	T	T								S	S	S													S	S														G	G	G								T	T																	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
		441	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.				490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.					.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.													.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.													.	.	.	.
Query Sequence		D	I	A	A	W	T	Y	R	A	P	V	E	D	Q	A	R	L	G	F	A	I	A	H	A	L	D	N	S	A	P	A	V	D	G	I	E	P	E	L	Q	S	K	I	D	V	I	V	Q	A	.	.	.	L	A	G	A	K	K	P	L	I	I	S	G	.	.	.	.	T	N	A	G	S	L	E	V	I	Q	A	A
Query Conservation																																																			.	.	.													.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.																														.	.	.													.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.
Template Sequence		D	K	P	F	I	E	A	H	T	K	G	F	D	D	A	V	K	.	.	.	T	N	R	L	S	L	D	E	C	S	N	I	T	G	V	P	V	D	M	L	K	R	A	A	E	W	S	Y	K	P	K	A	S	G	Q	A	P	R	T	M	H	A	Y	E	K	G	I	I	W	G	N	D	N	Y	V	I	Q	S	A	L
Template Known Secondary structure																			.	.	.		T																											S			T	T	S	S														T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340				.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
		514	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.		.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	N	V	A	K	A	L	K	G	R	G	A	D	V	.	G	I	T	M	I	A	R	S	V	N	S	M	G	L	G	I	M	G	G	G	S	L	E	E	A	L	T	E	L	E	T	G	R	A	D	A	V	V	V	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	D	L	V	I	A	T	H	N	V	G	R	R	G	T	G	C	V	R	M	G	G	H	Q	E	G	Y	T	R	P	P	Y	P	G	D	K	K	I	Y	I	D	Q	E	L	I	K	G	K	G	R	I	M	T	W	W	G	C	N	N	F	Q	T	S	N	N	A	Q	A	L	R	E	A	I	L	Q	R	S	A	I	V
Template Known Secondary structure								T	T		S	S	S	T	T								S	B		B								S		S	S											T			S						S							S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
								568	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.		.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																						.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																						.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	E	N	D	L	H	R	H	A	S	A	I	R	V	N	A	A	L	A	K	A	P	.	L	V	M	V	V	D	H	Q	R	T	A	I	M	E	N	A	H	L	V	L	S	A	A	S	F	A	E	S	D	G	T	V	I	N	N	E	G	R	A	Q	R	F	F	Q	V	Y	D	P	A	Y	Y	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																						.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																						.																																															.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.	.	.
Template Sequence		K	Q	A	M	Q	K	A	R	G	A	T	T	E	E	M	V	D	V	I	Y	E	A	T	Q	N	G	G	L	F	V	T	S	I	N	L	Y	P	T	K	L	A	E	A	A	H	L	M	L	P	A	A	H	P	G	E	M	N	L	T	S	M	N	G	E	R	R	I	R	L	S	E	K	F	M	.	.	.	.	.	D
Template Known Secondary structure								T	T	T														T	T	T	T									S	S		T	G	G	G	G	T		S					B			B	T	T	B							T	T										S	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		481	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.						.
		641	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660															.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	K	T	V	M	L	E	S	W	R	W	L	H	S	L	H	S	T	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	R	E	V	D	W	T	Q	L	D	H	V	I	D	A	V	V	A	K	I	P	E	L	A	G	I	K	D	A	A	P	D	A	T	F	R	I	R	G	Q	K	L	A	R	E	P
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation																																																										.
Template Sequence		P	P	G	T	A	M	A	D	C	L	I	A	A	R	I	A	N	A	L	R	D	M	Y	Q	K	D	G	K	A	E	M	A	A	Q	F	E	G	F	D	W	K	T	E	E	D	A	F	N	D	G	F	R	R	A	G	Q	.	P	G	A	P	A	I	D	S	Q	G	G	S	T	G	H	L	V	T	Y	D	R	L	R
Template Known Secondary structure			S	T	T		B																			T	T	T								T		S				S	S								T	T	T	T	T	T		.	T	T							T	T	G	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																										.
Template SS confidence
		556	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.		.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.
		707	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	R	Y	S	G	R	T	A	M	R	A	N	I	S	V	H	E	P	R	Q	P	Q	D	I	D	T	M	F	T	F	S	M	E	G	N	N	Q	P	T	A	H	R	S	Q	V	P	F	A	W	A	P	G	W	N	S	P	Q	A	W	N	K	F	Q	D	E	V	G	G	K	L	R	F	G	D	P	G	V	R	L	F
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	S	G	N	N	G	V	Q	L	P	V	V	S	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	S	K	G	L	V	G	T	E	M	L	Y	T	E	G	K	F	D	T	D	D	G	K	A	H	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P
Template Known Secondary structure				G	G	G				S	S			B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T			B			S		S		T	T	S			S	S	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		635	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.																	.	.
		787	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	T	S	E	N	G	L	D	Y	F	T	S	V	P	A	R	F	Q	P	Q	D	G	K	W	R	I	A	P	Y	Y	H	L	F	G	S	D	E	L	S	Q	R	A	P	V	F	Q	S	R	M	P	Q	P	Y	I	K	L	N	P	A	D	A	A	K	L	G	V	N	A	G	T	R	V	S	F	S	Y	D	G	N	T
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.
Template Sequence		A	P	W	N	G	L	P	A	T	V	Q	Q	Q	K	D	K	Y	R	F	W	L	N	N	G	R	N	N	E	V	W	Q	.	.	.	T	A	Y	H	D	Q	Y	N	S	L	M	Q	E	R	Y	P	M	A	Y	I	E	M	N	P	D	D	C	K	Q	L	D	V	T	G	G	D	I	V	E	V	Y	N	D	F	G	S
Template Known Secondary structure							S												S									S	S			T	.	.	.	T		T	T	G	G	G									S	S														T			T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.
Template SS confidence
		678	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.				.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.
		867	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	T	L	P	V	E	I	A	E	G	L	T	A	G	Q	V	G	L	P	M	G	M	S	G	I	A	P	V	L	A	G	A	H	L	E	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	F	A	M	V	Y	P	V	A	E	I	K	R	G	Q	T	F	M	L	F	G	Y	V	N	G	I	Q	G	D	V	T	T	D	W	T	D
Template Known Secondary structure										T	T	S		T	T							S		S	S	S		G	G	G	G			S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		755	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790