Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 375 % Identity 16% Template d3dhpa2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.50

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.		.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
Predicted Secondary structure																								.
Query SS confidence																								.
Query Sequence		K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	.	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T	F	R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	L	Q	D	F	I
Query Conservation																								.
Alig confidence																								.																							.	.	.	.	.																	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.																	.
Template Sequence		Q	Q	G	R	T	S	I	V	H	L	F	E	W	R	W	V	D	I	A	L	E	C	E	R	Y	L	A	P	K	G	F	G	G	V	Q	V	S	P	P	N	E	N	V	A	I	.	.	.	.	.	H	N	P	F	R	P	W	W	E	R	Y	Q	P	V	S	Y	.	K	L	C	T	R	S	G	N	E	D	E	F	R
Template Known Secondary structure			T	T								T	T													T	T	T	T	T	T										S		B	B			.	.	.	.	.	T	T	T	T	S		G	G	G	G	G	S	B	S		S	.		S		B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.																	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.						.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.		.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	D	Y	P	S	A	D	I	R	A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I
Query Conservation
Alig confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	M	V	T	R	C	N	N	V	G	V	R	I	Y	V	D	A	V	I	N	H	M	C	G	N	A	V	S	A	G	T	S	S	T	C	G	S	Y	F	N	P	G	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	P	A	V	P	Y	S
Template Known Secondary structure										T	T										S					T	T	S		S	B	S		B	T	T				B	B	G	G	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	B	T	T	T	T	B
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	130	.	.
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	K	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	K	H	S	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	A	D	F	N	D	G	K	C	K	T	G	S	G	D	I	E	N	Y	N	D	A	T	Q	V	R	D	C	R	L	S	G	L	L	D	L	A	L	G	K	D	Y	V	R	S	K	I	A	E	Y	M	N	H	L	I	D	I	G	V	A	G	F	R	I	D	A	S	K	H	M	A	P	G	D	I	K	A	I	L	D
Template Known Secondary structure		G	G	G	B		T	T	T			S	S	S	S	B				T	T								S	B	G	G	G				B		T	T	S																		T							T	T	G	G	G	S										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
		452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.
Query SS confidence																																																																							.	.
Query Sequence		P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	S	F	.	.	G	G	D	L	Q	T	L	A	S
Query Conservation																																																																							.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.																												.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.
Template Sequence		K	L	H	N	L	N	S	N	W	F	P	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	P	F	I	Y	Q	E	V	I	D	L	G	G	E	P	.	.	.	.	I	K	S	S	D	Y	F	G	N	G	R	V	T	E	F	K	Y	G	A	K	L	G	T	V	I	R	K	W	N	G	E	K	M	S	A	L	K	N
Template Known Secondary structure		T						T	T	T	S		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.													S	S	S	S	.	.	.	.			G	G	G	G	T	T	T	S																	T		T	T			G	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.
Template SS confidence
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.										.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.					.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560			.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	P	G	S	T	I	S	S	I	P	S	E	R	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	.	.	D	F	L	F	N	H	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.																									.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.
Template Sequence		W	G	E	G	A	G	.	F	M	P	S	D	R	A	L	V	F	V	D	N	H	D	N	Q	R	G	H	G	A	G	G	A	S	I	L	T	F	A	D	A	R	L	Y	K	M	A	V	G	F	M	L	A	H	P	Y	G	F	T	R	V	M	S	S	Y	R	W	P	R	Y	F	E	N	G	K	D	V	N	D	W	V
Template Known Secondary structure			S	G	G	G	T	.				T	T	T					S			T	T	G	G	G	T		T	T			T	T				G	G	G														S		S	S								B								T	T			T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure								.
Template SS confidence
		280	.	.	.	.	.		.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
							596	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	T	R	V	G	G	E	A	W	L	N	K	G	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D
Query Conservation		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	P	P	N	D	N	G	V	T	K	E	V	T	I	N	P	D	T	T	C	G	N	D	W	V	C	E	H	R	A	R	Q	I	R	N	M	V	N	F	R	N	V	V	D	G
Template Known Secondary structure			S	S			T	T							B		T	T	S		B		T	T	B			G	G	G	S													T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.