Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 68 Aligned Residues 330 % Identity 21% Template d1mxga2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.60

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		214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.								.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	.	.	.	.	.	.	.	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T	F	R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	E	G	G	V	I	M	Q	A	F	Y	W	D	V	P	G	G	G	I	W	W	D	H	I	R	S	K	I	P	E	W	Y	E	A	G	I	S	A	I	W	L	P	P	P	S	K	G	M	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Y	S	M	G	Y	D	P	Y	D	Y	F	D	L	G	E	Y	Y	Q	K
Template Known Secondary structure		G	G	T									T	T				S	S																	T										S			T	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G			S	S	S				T	T		S	S		S		B	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.											.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
			279	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	T	I	H	N	P	M	G	D	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	D	Y	P	S	A	D	I	R	A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D
Query Conservation		.
Alig confidence		.																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	T	V	E	T	R	F	G	S	K	E	E	L	V	R	L	I	Q	T	A	H	A	Y	G	I	K	V	I	A	D	V	V	I	N	H	R	A	G	G	D	L	E	W	N	P	F	V	G	D	Y	T	W	T	D	F	S	K	V	A	S	G	K	Y	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	B	S	S		S	S																T	T										S	B										T	T	T	T								T	T		T	T			S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.					420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.
Query Sequence		P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V	I	M	L	Q	N	.	.	.	.	Q	Y	V	R	E	M	R	K	Y	G	V	R	G	L
Query Conservation																																																																.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	Y	L	D	F	H	P	N	E	L	H	C	C	D	E	G	T	F	G	G	F	P	D	I	C	H	H	K	E	W	D	Q	Y	W	L	W	K	S	N	E	S	Y	A	A	Y	L	R	S	I	G	F	D	G	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			G	G	G	B	S	S	S	S	S		S			S				T	T	S		B	B		T	T	S								T	S	S	T	T	S								T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																											141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.
		434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	Y	D	A	A	K	H	S	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.
Template Sequence		R	F	D	Y	V	K	G	Y	G	A	W	V	V	R	D	W	L	N	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	G	G	W	A	V	G	E	Y	W	D	T	.	.	.	.	N	V	D	A	L	L	S	W	A	Y	E	S	G	A	K	V	F	D	F	P	L	Y	Y	K
Template Known Secondary structure				T	T	G	G	G	S												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												S	.	.	.	.													T	S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.
Template SS confidence
		196	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.					.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
		514	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.			540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.
Predicted Secondary structure																												.	.
Query SS confidence																												.	.
Query Sequence		T	I	K	A	F	S	F	G	G	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	I	S	S	I	P	.	.	S	E	R	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	F	N	H	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G
Query Conservation																												.	.
Alig confidence								.																				.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Conservation								.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Sequence		M	D	E	A	F	D	.	N	N	N	I	P	A	L	V	Y	A	L	Q	N	G	Q	T	V	V	S	R	D	P	F	K	A	V	T	F	V	A	N	H	D	T	D	I	I	W	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	Y	P	A	Y	A	F	I	L	T	Y	E	.	G	Q	P	V	I	F	Y	R	D
Template Known Secondary structure							T	.	T	T											T	T		S	S	T	T	T		T	T	T					S			S	S					S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											S	S	.	S
Template Predicted Secondary structure								.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template SS confidence
		251	.	.	.	.	.		.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.													.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.		.	.	310	.	.	.	.	.	.
		592	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	V	L	K	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	T	R	V	G	G	E	A	W	L	N	K	G	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D	K	A	G	I	W	S	A	F	E	G	V	S	A	T	K	N	V	L	A	F	S	R	G	D	S
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.
Template Sequence		F	E	E	W	L	N	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	K	L	I	N	L	I	W	I	H	D	.	.	.	.	.	H	L	A	G	G	S	T	T	I	V	Y	Y	D	N	D	E	L	I	F	V	R	N	G	D
Template Known Secondary structure				T	T	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.		T			S									S	S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		317	.	.	320	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.						.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.