Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 79 Aligned Residues 379 % Identity 15% Template d1m53a2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.20

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		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	P	S	G	Q	Q	E	T	F	K	I	L	I	N	L	E	H	L	R	Q	T	L	E	R	K	S	L	T	A	V	Q	K	S	Q	C	E	I	I	T	P	K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	P	A	W	W	K	E	A	V	F	Y	Q	I	Y	P	R	S	F	K	D	T	N	D	D	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	I	R	G	I	I	E	K	L	D	Y	L	K	S	L	G	I	D	A	I	W	I	N	P	H	Y	D
Template Known Secondary structure																G	G	G	T			S	S	S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T								T
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.		.	.	.	.	.	.	330	.
Predicted Secondary structure																																																																									.
Query SS confidence																																																																									.
Query Sequence		F	R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	.	D	Y	P	S	A	D	I	R
Query Conservation																																																																									.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	P	N	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	G	Y	D	I	S	N	Y	R	Q	I	M	K	E	Y	G	T	M	E	D	F	D	S	L	V	A	E	M	K	K	R	N	M	R	L	M	I	D	V	V	I	N	H	T	S	D	Q	H	P	W	F	I	Q	S	K	S	D	K	N	N	P	Y	R
Template Known Secondary structure					T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	S	S		S							G	G	G																T	T										S	B			T	T	S										T	T		T	T	G
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		98	.	100	.													.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Y	Y	F	W	R	D	G	K	D	N	Q	P	P	N	N	Y	P	S	F	F	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	A	W	Q	K	D	A	K	S	G	Q	Y	Y	L	H	Y	F	A	R	Q	Q	P	D	L	N	W	D	N
Template Known Secondary structure		G	G	B						S	S	S	S		S	S			B		T	T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	S					T	T	T							S	S		T	T			B	B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	K	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	K	H	S	K	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	K	V	R	E	D	L	Y	A	M	L	R	F	W	L	D	K	G	V	S	G	M	R	F	D	T	V	A	T	Y	S	K	I	P	G	F	P	N	L	T	P	E	Q	Q	K	N	F	A	E	Q	Y	T	M	G	P	N	I	H	R	Y	I	Q	E	M	N	R	K	V	L	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																	T	T	T							T	T	G	G	G	S	S			T	T											T					T	T			T	T												T	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
		466	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.					.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.
Query Sequence		L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	S	F	G	G	D	.	.	.	.	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	I	S	S	I	P	S	E
Query Conservation																																																												.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																			.																																.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	V	A	T	A	G	E	I	F	G	V	P	L	D	R	S	S	.	Q	F	F	D	R	R	R	H	E	L	N	M	A	F	M	F	D	L	I	R	L	D	R	D	S	N	E	R	W	R	H	K	S	W	S	L	S	Q	F	R	Q	I	I	S	K	M	D	V	T	V	G	K	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	S									T	T			G	G	G	T		.					G	G	G		S		S						T	T	T	T	T	T	B		S	S		T	T		B																				T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Template SS confidence
										288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.		.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
		542		.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.		.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.																						.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.																						.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	.	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	.	F	N	H	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation			.																						.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.																						.																			.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.
Template Sequence		G	W	N	T	F	F	L	D	N	H	D	N	P	R	A	V	S	H	F	G	D	D	R	P	Q	W	R	E	A	S	A	K	A	L	A	T	I	T	L	T	Q	R	.	A	T	P	F	I	Y	Q	G	S	E	L	G	M	T	N	Y	P	F	R	Q	L	N	E	F	D	D	I	E	V	K	G	F	W	Q	D	Y	V
Template Known Secondary structure				B				S			T	T	S								S			S	T	T	T													T	S	S	S	.	S						T	T	T	T	T	T								S	G	G	G														T
Template Predicted Secondary structure																																												.
Template SS confidence
		359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400		.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
																						607	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	V	G	G	E	A	W	L	N	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	S	G	K	V	T	A	T	E	F	L	D	N	V	R	L	T	S	R	D	N	S	R	T	P	F	Q	W	N	D	T	L	N	A	G	F	T	R	G	K	P	W	F	H	I	N	P	N	Y	V	E	I	N	A	E	R	E	E	T	R	E	D	S	V	L	N	Y	Y	K	K	M	I	Q	L	R	H	H	I	P	A
Template Known Secondary structure		T	T	T	S	S														G	G	G	G		S					S	S	S	G	G	G	G	S		S	S			S	S				G	G	G	G	T	S									T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.
		636	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	V
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		518	.