Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 70 Aligned Residues 392 % Identity 16% Template d1h3ga3 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.1

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		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	S	G	Q	Q	E	T	F	K	I	L	I	N	L	E	H	L	R	Q	T	L	E	R	K	S	L	T	A	V	Q	K	S	Q	C	E	I	I	T	P	K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T	F
Query Conservation
Alig confidence																																														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	G	F	G	P	G	D	A	I	Y	Q	I	X	P	D	R	F	A	N	G	D	P	S	N	D	N	V	A	G	X	R	E	Q	A	D	R	R	H	G	G	G	R	H	G	.	.	.	.	.	.	.	G	D	I	R	G	T	I	D	H	L	D	Y	I	A	G	L	G	F	T	Q	L	W	P	T	P	L	V	E	N
Template Known Secondary structure						T	T														S		G	G	G	S	S		T	T		S	S				T	T	S	T	T	S				.	.	.	.	.	.	.									T								T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		101	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.								.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
		254	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	D	Y	P	S	A	D	I	R	A	K
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	A	A	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Y	H	G	Y	A	A	T	D	H	Y	R	I	D	P	R	Y	G	S	N	E	D	F	V	R	L	S	T	E	A	R	K	R	G	X	G	L	I	Q	D	V	V	L	S	H	I	G	K	H	H	W	W	X	K	D	L	P	T	P	D	W	I	N	Y	G	G
Template Known Secondary structure				S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G			S		S							T	T	T																T	T										S	B			T	T	S	G	G	G	G	S		S	S	T	T	S	B	S			S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		174	.	.	.	.										.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	F	V	P	T	Q	H	H	R	V	A	V	Q	D	P	Y	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	A	D	S	E	N	F	T	K	G	W	F	V	E	G	X	P	D	L	N	Q	T	N	P	L
Template Known Secondary structure		S			B					G	G	G	G	S		T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										S	B	S	S	T	T	S		B	B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.		.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
Predicted Secondary structure																.
Query SS confidence																.
Query Sequence		V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	K	.	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	K	H	S	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q
Query Conservation																.
Alig confidence																.																																																															.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		V	A	N	Y	L	I	Q	N	N	I	W	W	I	E	Y	A	G	L	S	G	L	R	I	D	T	Y	G	Y	S	D	G	A	F	L	T	E	Y	T	R	R	L	X	A	E	Y	P	R	L	N	X	V	G	E	E	W	S	T	R	V	P	V	V	A	R	W	Q	R	G	K	A	N	F	D	G	Y	T	S	.	.	.
Template Known Secondary structure																		T		S					T	T	G	G	G	S																	T	T										S							T	T	S	T	T				T	T					.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
		493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.				.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.
Query Sequence		M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	S	F	G	G	.	.	.	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	I	S	S	I	P	S	E	R	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	F	N	H	Q	Q	D
Query Conservation																																.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.																																							.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																																																																.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	H	L	P	S	L	X	D	F	P	L	V	D	A	X	R	N	A	L	S	K	T	G	E	E	N	G	L	N	E	V	Y	E	T	L	S	L	D	Y	L	Y	P	E	P	Q	N	L	V	L	F	G	G	N	H	D	X	A	R	X	F	S	A	A	G	.	.	.	.	E	D	F	D	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.						B															T	T		S	S	T	T									G	G	G	G	S	S	S	G	G	G	S				S			T	T	S							T	T	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																																																																.	.	.	.
Template SS confidence
										365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.					.	.	430	.	.
		570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.		.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.																.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	.	K	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	T	R	V	G	G	E	A	W	L	N	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y
Query Conservation																											.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.													.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.
Template Sequence		W	R	X	N	L	V	F	L	X	T	X	P	.	R	I	P	Q	F	Y	S	G	D	E	I	L	X	T	S	T	V	K	G	R	D	D	A	S	Y	R	R	D	F	P	G	G	W	A	G	D	K	A	N	A	F	S	G	A	G	L	T	S	Q	Q	R	A	A	Q	D	L	V	R	K	L	A	N	W	R	K	N	Q
Template Known Secondary structure												S	S	.	S						T	T	G	G	G	T						S	S	S		G	G	G	G	S				T	T	S	S	T	T		S	S		T	T	T		T	T																				T	T
Template Predicted Secondary structure														.
Template SS confidence
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.		.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.
		634
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		P
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		512