Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 100 Aligned Residues 405 % Identity 14% Template d1gjwa2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.1

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		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	V	T	S	P	S	G	Q	Q	E	T	F	K	I	L	I	N	L	E	H	L	R	Q	T	L	E	R	K	S	L	T	A	V	Q	K	S	Q	C	E	I	I	T	P	K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P
Query Conservation
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	E	K	T	P	D	W	I	K	R	S	V	V	Y	G	S	L	P	R	T	T	A	A	Y	N	H	K	G	S	G	Y	Y	E	E	N	D	V	L	G	F	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	T	F	F	K	M	M	L	L	L	P	F	V	K	S	L	G	A	D	A	I	Y	L	L	P
Template Known Secondary structure		T			S	G	G	G	G	G	G												T				T	T	S	S	S				S	B		T	T	S		B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S									T								T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.													.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.									.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	T	T	F	R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	S	R	M	S	D	L	.	.	.	.	.	.	F	K	K	G	D	A	P	S	P	Y	S	V	K	N	P	M	E	L	D	E	R	Y	H	D	P	L	L	E	P	F	K	V	D	E	E	F	K	A	F	V	E	A	C	H	I	L	G	I	R	V	I	L	D	F	I	P	R	T	A	A	R	D	S	D	L	I	R
Template Known Secondary structure								S	.	.	.	.	.	.	S		S	S	S	S			T	T	S									G	G	G	S		G	G	G	T	T	S																T	T									T	T				T	T		G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		142	.	.	.	.	.	.							.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	L	D	Y	P	S	A	D	I	R	A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	H	.	.	.	.	.	.	P	D	W	F	Y	W	I	K	V	E	E	L	A	D	Y	T	P	P	R	A	E	E	L	P	F	K	V	P	D	E	D	E	L	E	I	I	Y	N	K	E	N	V	K	R	H	L	K	K	F	T	L	P	P	N	L	I	D	P	Q	K	W	E	K	I	K	R	E	E	G	N	I	L
Template Known Secondary structure		T		.	.	.	.	.	.	G	G	G	S					G	G	G	S	T	T							T	T	S		S	B												T	S								T	T	B																	T		S	S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		216	.							.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																																														402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	L	I	V	K	E	F	G	I	I	T	P	P	G	F	S	D	L	I	N	D	P	Q	P	T	W	D	D	V	T	F	L	R	L	Y	L	D	H	P	E	A	S	K	R	F	L	D	P	N	Q	P	P	Y	V	L	Y	D	V	I	K	A	S	K	F	P	G	K	E	P	N	R	E	L	W	E	Y	L	A	G	V
Template Known Secondary structure									S						B			S	S	B	T			S			B	T	T							B	S	S			G	G	G	G	G	G	S		T	T												T	T	T	S			S	S	B									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		422	.	.	.	.		.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
Predicted Secondary structure							.
Query SS confidence							.
Query Sequence		V	R	E	M	R	.	K	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	K	H	S	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R
Query Conservation							.
Alig confidence							.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	P	H	Y	Q	K	K	Y	G	I	D	G	A	R	L	D	M	G	H	A	L	P	K	E	L	L	D	L	I	I	K	N	V	K	E	Y	D	P	A	F	V	M	I	A	E	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	M	E	K	D	K	A	S	K	E	A
Template Known Secondary structure																	S	S	G	G	G	S																	T	T									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	D	L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	S	F	G	G	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	I	S	S	I	P	S	E	R	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	F	N	H	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.
Template Sequence		G	Y	D	V	I	L	G	S	S	W	Y	F	A	G	R	V	E	E	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	L	P	D	I	A	E	E	L	V	L	P	F	L	A	S	V	E	T	P	D	T	P	R	I	A	T	R	K	Y	.	.	.	.	A	S	K	M	K	K	L	A	P	F	V	T	Y	F	L	P
Template Known Secondary structure		T		S											T		T	T	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G							T		S	S						S			T	T	S			G	G	G	S	T	T	.	.	.	.														T	S	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.
Template SS confidence
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.											.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.					.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.
		581	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	T	R	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	E	A	W	L	N	K	G	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.
Template Sequence		N	.	S	I	P	Y	V	N	T	G	Q	E	I	G	E	K	Q	P	M	N	L	G	L	D	T	D	P	N	L	R	K	V	L	S	P	T	D	E	F	F	G	K	L	A	F	F	D	H	Y	V	L	H	W	D	S	P	D	R	G	V	L	N	F	I	K	K	L	I	K	V	R	H	E	F	L	D
Template Known Secondary structure		T	.							T	T	G	G	G	T			S		S				S	S			G	G	G	G	G		S		T	T	S	T	T	T	T			T	T	T	S						T	T	S																			T
Template Predicted Secondary structure			.
Template SS confidence
		494		.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.