Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 90 Aligned Residues 382 % Identity 16% Template d1bf2a3 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.00

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		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	S	G	Q	Q	E	T	F	K	I	L	I	N	L	E	H	L	R	Q	T	L	E	R	K	S	L	T	A	V	Q	K	S	Q	C	E	I	I	T	P	K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T	F
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	R	A	Q	K	D	D	V	I	Y	E	V	H	V	R	G	F	T	E	Q	D	T	S	I	P	A	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	R	G	T	Y	Y	G	A	G	L	K	A	S	Y	L	A	S	L	G	V	T	A	V	E	F	L	P	V	Q	E	T
Template Known Secondary structure					G	G	G													T	T		T	T	S		G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	T	S							T								T							S			B		B
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
		254	.	.	.	.	.	260	.	.		.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.								.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.																									.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.																									.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	A	D	G	P	E	T	P	E	.	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	.	.	.	.	.	.	.	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	D	Y
Query Conservation											.																									.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.																									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	N	D	A	N	D	V	V	P	N	S	D	A	N	Q	N	Y	W	G	Y	M	T	E	N	Y	F	S	P	D	R	R	Y	A	Y	N	K	A	A	G	G	P	T	A	E	F	Q	A	M	V	Q	A	F	H	N	A	G	I	K	V	Y	M	D	V	V	Y	N	H	T	A	E	G	G	T	W	T	S	S	D	P	T
Template Known Secondary structure		S		T	T	T	T	S	S	T	T			T	T				S				B	S		S	S		B		G	G	G		S			S	T	T																T	T										S	S		T	T		S	B	S	S	S	S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
		326	.	.	.	330	.								.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	S	A	D	I	R	.	.	.	.	.	.	.	A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	A	T	I	Y	S	W	R	G	L	D	N	A	T	Y	Y	E	L	T	S	G	N	Q	Y	F	Y	D	N	T	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			B			S	S										B		B		T	T	S	S	S	B			S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.		.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	.	K	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	K	H	S	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																														.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																								.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	G	A	N	F	N	T	Y	N	T	V	A	Q	N	L	I	V	D	S	L	A	Y	W	A	N	T	M	G	V	D	G	F	R	F	D	L	A	S	V	L	G	N	S	C	L	N	G	A	Y	T	A	S	A	P	N	C	P	N	G	G	Y	N	F	D	A	A	D	S	N	V	A	I	N	R	I	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	S			B		T	T	S																	T	S								T	T	G	G	G	G	G	B			S	S	S	S			T	T	S	T	T		T	T		S			B		T	T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Template SS confidence
							342	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
							468	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																																																						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																																																						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	S	F	G	G	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	I	S	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.																																																																						.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																							.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.
Template Sequence		R	E	F	T	V	R	P	A	A	G	G	S	G	L	D	L	F	A	E	P	W	A	I	G	G	N	S	.	.	.	.	Y	Q	L	G	G	F	P	Q	G	W	S	E	W	N	G	L	F	R	D	S	L	R	Q	A	Q	N	E	L	G	S	M	T	I	Y	V	T	Q	D	A	N	D	F	S	G	S	S	N	L	F
Template Known Secondary structure				S		B			T	T			S	S	B									S	S	T	T		.	.	.	.			T	T		S		T	T																			B	T	T	B												T	T
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.
Template SS confidence
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.					.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
					537	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580
Predicted Secondary structure		.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	S	I	P	S	E	R	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	F	N	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L
Query Conservation		.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	S	S	G	R	S	P	W	N	S	I	N	F	I	D	V	H	D	G	M	T	L	K	D	V	Y	S	C	N	G	A	N	N	S	Q	A	W	P	Y	G	P	S	D	G	G	T	S	T	N	Y	S	W	D	Q	G	M	S	A	G	T	G	A	A	V	D	Q	R	R	A	A	R	T	G	M	A	F	E	M	L	S
Template Known Secondary structure		G	G	G	T			G	G	G					S			S	S	S							T	T		S	S							T	T	S								S							T	T	T	T	T	T	S																				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.
		581	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.		.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.					.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.																					.	.	.	.
Query SS confidence																		.																					.	.	.	.
Query Sequence		P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	S	.	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	T	R	V	G	G	E	A	W	L	N	.	.	.	.	K	G	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D	K
Query Conservation																		.																					.	.	.	.
Alig confidence			.															.																					.	.	.	.
Template Conservation			.
Template Sequence		A	.	G	T	P	L	M	Q	G	G	D	E	Y	L	R	T	L	Q	C	N	N	N	A	Y	N	L	D	S	S	A	N	W	L	T	Y	S	W	T	T	D	Q	S	N	F	Y	T	F	A	Q	R	L	I	A	F	R	K	A	H	P	A	L
Template Known Secondary structure		S	.	S						T	T	G	G	G	T				T	T		S			T	T			S	T	T	T	S																											G	G	G
Template Predicted Secondary structure			.
Template SS confidence
		573		.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.