Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 65 Aligned Residues 458 % Identity 12% Template c3faxA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:reticulocyte binding protein; PDBTitle: the crystal structure of gbs pullulanase sap in complex with2 maltotetraose Resolution 2.40 Å

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		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	V	T	S	P	S	G	Q	Q	E	T	F	K	I	L	I	N	L	E	H	L	R	Q	T	L	E	R	K	S	L	T	A	V	Q	K	S	Q	C	E	I	I	T	P	K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	I	A	N	F	K	G	R	Q	D	A	V	I	Y	E	A	H	V	R	D	F	T	S	D	Q	S	L	D	G	K	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	L	G	T	F	A	A	F	S	E	K	L	D	Y	L	Q	K	L	G	V	T	H	I	Q	L	L	P
Template Known Secondary structure				T	T			S	G	G	G															G	G	G					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S							T								T		S					S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		603	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.									.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.									.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	T	T	F	R	A	D	G	P	E	T	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.							.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.
Template Sequence		V	L	S	Y	F	Y	V	N	E	M	D	K	S	R	S	T	A	Y	T	S	S	D	N	N	Y	N	W	.	.	G	Y	D	P	Q	S	Y	F	A	L	S	G	M	Y	S	E	K	P	K	D	P	S	A	R	I	A	E	L	K	Q	L	I	H	D	I	H	K	R	G	M	G	V	I	L	D	V	V	Y	N	H	T
Template Known Secondary structure			B		B	S	S		B	T	T							S			S	S	S		S				.	.	S		S	B	S		S	S	S	B		G	G	G		S		T	T	S																		T	T										S
Template Predicted Secondary structure																													.	.
Template SS confidence
		663	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.			690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	D	Y	P	S	A	D	I	R	A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	K	T	Y	L	F	E	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	P	N	Y	Y	H	F	M	N	E	D	G	S	P	R	E	S	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S		T					T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T	T	S	B		B		T	T	S		B		B	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		741	.	.	.	.	.	.	.	.																				750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.		.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure																																			.
Query SS confidence																																			.
Query Sequence		H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	.	K	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	K	H	S	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H
Query Conservation																																			.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	R	L	G	T	T	H	A	M	S	R	R	V	L	V	D	S	I	K	Y	L	T	S	E	F	K	V	D	G	F	R	F	D	M	M	G	D	H	D	A	A	A	I	E	L	A	Y	K	E	A	K	A	I	N	P	N	M	I	M	I	G	E	G	W	R	T	F	Q	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	B		B		T	T	S																		S								T	T	G	G	G	S	B																T	T									S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											768	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.
		473	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.											.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.				.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Query Sequence		K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	F	G	G	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	I	S	.	.	.	S	I	P
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Q	G	K	P	V	K	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	Q	D	W	M	K	S	T	D	T	V	G	V	F	S	D	D	I	R	N	S	L	K	S	G	F	P	N	E	G	T	P	A	F	I	T	G	G	P	Q	S	L	Q	G	I	F	K	N	I	K	A	Q	P	G	N	F	E	A	D	S
Template Known Secondary structure		B	T	T	B				B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	G	G	G	G	G	G		S	S																T	T	S	T	T				T	T	T	T													T	T			T	T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		839	840	.	.	.	.	.	.												.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.
		540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.									.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	E	R	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	F	N	H	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	T	R	V	G	G
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Conservation																																																				.
Template Sequence		P	G	D	V	V	Q	Y	I	A	A	H	D	N	L	T	L	H	D	V	I	A	K	S	I	N	K	D	P	K	V	A	E	E	D	I	H	R	R	L	R	L	G	N	V	M	I	L	T	S	Q	.	G	T	A	F	I	H	S	G	Q	E	Y	G	R	T	K	R	L	L	N	P	D	Y	M	T	K	V	S	D	K
Template Known Secondary structure		G	G	G					S			S	S	S	S											T			T	T	T	T																	T	S	S	.	S						T	T	T	T	T	T				B				G	G	G	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																				.
Template SS confidence
		908	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.		.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.
		612	.	.	.																																									.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Query Sequence		E	A	W	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	K	G	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D	K	A	G	I	W	S	A	F	E	G	V	.	.	.	.	.
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.														.	.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.
Template Sequence		L	P	N	K	A	T	L	I	E	A	V	K	E	Y	P	Y	F	I	H	D	S	Y	D	S	S	D	A	I	N	H	F	D	W	A	A	A	T	D	N	N	K	H	P	I	S	T	K	T	Q	A	Y	T	A	G	L	I	T	L	R	R	.	.	S	T	D	A	F	R	K	L	S	K	A	E	I	D	R	E	V	S
Template Known Secondary structure				T	T					S	S			S	S					S		G	G	G																T	T	T																				.	.	T		T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.
Template SS confidence
		988	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.			.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.
												647	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	A	T	K	N	V	L	A	F	S	R	G	D	S	V	N	I	N	H	S	P	H	D	G	L	V	I	I	N	K	G	N	E	E	V	E	G	T	W	P	N	K	L	Q	P	G	I	Y	K	N	M	G	S	N	S	V	N	I	I	I	N	N	T	R	K	I	I	P	P	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.
Template Sequence		L	I	T	E	V	G	Q	G	D	I	K	E	K	D	L	V	I	A	Y	Q	T	.	.	.	.	.	.	I	D	S	G	D	I	Y	A	V	F	V	N	A	D	S	K	A	R	N	V	L	L	G	E	K	Y	K	H	L	L	K	G	Q	V	I	V	D	A	D	Q	A	.	.	.	.	G	I	K	P	I	S	T	P
Template Known Secondary structure			S	S		T	T	S	T	T			S			S							.	.	.	.	.	.														S	S	S											G	G	G	G	G	S						S	S		B	.	.	.	.	S	S	S			S	S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.
Template SS confidence
		1066	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.							.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.					.	.	1130	.	.	.	.	.
		717	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	V	F	T	L	R	G	G	T	L	N	I	N	I	P	G	R	S	A	L	L	L	G
Query Conservation
Alig confidence										.	.
Template Conservation										.	.
Template Sequence		R	G	V	H	F	E	K	D	.	.	S	L	L	I	D	P	L	T	A	I	V	I	K
Template Known Secondary structure		S	S					S	S	.	.						T	T
Template Predicted Secondary structure										.	.
Template SS confidence
		1137	.	.	1140	.	.	.	.			.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.