Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 49 Aligned Residues 417 % Identity 14% Template c3dhuC_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: C: PDB Molecule:alpha-amylase; PDBTitle: crystal structure of an alpha-amylase from lactobacillus2 plantarum Resolution 2.00 Å

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		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	Q	E	T	F	K	I	L	I	N	L	E	H	L	R	Q	T	L	E	R	K	S	L	T	A	V	Q	K	S	Q	C	E	I	I	T	P	K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T	F	R	A	D
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	R	N	E	M	I	Y	S	V	F	V	R	N	Y	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	N	F	A	G	V	T	A	D	L	Q	R	I	K	D	L	G	T	D	I	L	W	L	L	P	I	N	P	I	G	E	V
Template Known Secondary structure		G	G	G												S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		S						T	T								T		S								S		B			T
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	D	Y	P	S	A	D	I	R	A	K	I	S	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	N	R	K	G	T	L	G	S	P	Y	A	I	K	D	Y	R	G	I	N	P	E	Y	G	T	L	A	D	F	K	A	L	T	D	R	A	H	E	L	G	M	K	V	M	L	D	I	V	Y	N	H	T	S	P	D	S	V	L	A	T	E	.	.	.	.	.	.	.	H	P	E	W	F	Y	H
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	T			T	T	T			T	T	S	B	S		T	T	S			G	G	G																T	T										S				T	T	S						.	.	.	.	.	.	.		G	G	G	B		B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																																													.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								58	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.								.	.	120	.	.	.	.
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V	I	M
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	A	D	G	Q	L	T	N	K	V	G	D	W	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	D	L	D	Y	G	H	H	E	L	W	Q
Template Known Secondary structure			T	T	S		B			S		T	T		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				B		T	T		T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	K	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	K	H	S	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L
Query Conservation
Alig confidence													.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	Q	I	D	T	L	L	Y	W	S	Q	.	F	V	D	G	Y	R	C	D	V	A	P	L	V	P	L	D	F	W	L	E	A	R	K	Q	V	N	A	K	Y	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	W	L	A	E	S	A	G	S	G	F	I	E	E	L	R	S	Q	G	Y	T	G	L	S	D	S
Template Known Secondary structure											T	T	.	T		S					T	T	G	G	G	S																	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			T	T
Template Predicted Secondary structure													.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.		.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.											.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
		497	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.		.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.
Query SS confidence																																																.
Query Sequence		L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	S	F	G	G	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	I	S	S	I	P	S	E	R	.	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	F	N	H	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A
Query Conservation																																																.
Alig confidence																																																.																			.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																			.	.	.	.	.
Template Sequence		E	L	Y	Q	A	F	D	M	T	Y	D	Y	D	V	F	G	D	F	K	D	Y	W	Q	G	R	S	T	V	E	R	Y	V	D	L	L	Q	R	Q	D	A	T	F	P	G	N	Y	V	K	M	R	F	L	E	N	H	D	N	A	R	M	M	S	L	M	H	.	.	.	.	.	S	K	A	E	A	V	N	N	L	T
Template Known Secondary structure				T	T	T		S				G	G	G	T									T	T	S	S																S		T	T							S			T	T	S									.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.						.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
		576	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	T	R	V	G	G	E	A	W	L	N	K	G	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D	K	A	G	I	W	S	A	F	E	G	V	S	A	T	K	N	V	L	A	F
Query Conservation
Alig confidence								.																														.	.	.	.																	.	.	.
Template Conservation								.																														.	.	.	.																	.	.	.
Template Sequence		W	I	F	M	Q	R	.	G	I	P	L	I	Y	N	G	Q	E	F	L	A	E	H	Q	P	S	L	F	D	R	D	T	M	V	A	D	R	.	.	.	.	H	G	D	V	T	P	L	I	Q	K	L	V	T	I	K	Q	.	.	.	L	P	L	L	R	A	A	D	Y	Q	L	A	V	V	E	E	G	I	V	K	I
Template Known Secondary structure						S	S	.	S						T	T	G	G	G	T			S				S	S	S					T	T			.	.	.	.																T	.	.	.	S	G	G	G	G		S								G	G	G
Template Predicted Secondary structure								.																														.	.	.	.																	.	.	.
Template SS confidence
		297	.	.	300	.	.		.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.					.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.				.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
		656	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	R	G	D	S	V	N	I	N	H	S	P	H	D	G	L	V	I	I	N	K	G	N	E	E	V	E	G	T	W	P	N	K	L	Q	P	G	I	Y	K	N	M	G	S	N	S	V	N	I	I	I	N	N	T	R	K	I	I	P	P	G	K	V	F	T	L	R	G	G	T	L	N	I	N	I	P	G	R	S	A
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.																				.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.																				.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Sequence		T	Y	.	.	.	.	.	.	R	A	A	G	E	A	L	T	A	W	I	P	L	K	G	Q	V	T	A	.	.	V	A	T	K	L	A	A	G	S	Y	Q	N	L	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	P	T	E	V	V	D	G	K	.	.	L	T	V	D	G	Q	P	V
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.			T	T									T	T						.	.							S						T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T							T	T		.	.					S	S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.																				.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template SS confidence
		369	370							.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.			390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.			.	.	.	.	.	420	.	.
		736	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	L	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	I	K	Y
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		423	.	.	.