Job Description P76616 Confidence 98.47% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 119 Aligned Residues 342 % Identity 14% Template c3a5vA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of alpha-galactosidase i from mortierella vinacea Resolution 2.00 Å

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		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.						240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270				.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.																																.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.																																.	.	.
Query Sequence		T	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	.	.	.	.	.	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T	F	R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	.	.	.	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A
Query Conservation																.	.	.	.	.																																.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.																	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Sequence		D	E	Q	L	I	L	D	A	A	K	A	I	A	S	S	G	L	K	D	L	G	Y	N	Y	V	I	I	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	W	Q	K	N	E	R	E	S	S	K	T	L	L	A	D	P	T	K	F	P	R	.	.	G	I	K	P	L	V	D	D	I
Template Known Secondary structure																	T					T								S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		B		S	S			T	T	S				B		T	T	T		T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template SS confidence
		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.			.	.	.	.	.	80	.	.	.
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	D	Y	P	S	A	D	I	R	A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	N	L	G	L	K	A	G	I	Y	S	S	A	G	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T									S	S	S	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.									.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	K	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	K	H	S	K	H	E	Q	I	E	R	S
Query Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	C	G	G	H	I	A	S	L	G	Y	E	D	I	D	A	K	T	W	A	K	W	G	I	D	Y	L	K	Y	D	N	C	Y	N	Q	G	Q	S	G	T	P	K	L	S	Y	D	R	Y	K	A	M
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S		B			T	T													T									T	T		T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																															100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
		450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	S	F	G	G	D	L	Q	T	L	A	S
Query Conservation
Alig confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	N	A	L	N	K	T	G	R	P	M	L	Y	S	L	C	N	W	G	E	D	G	P	W	N	F	A	S	T	I	S	N	S	W	R	I	S	G	D	V	Y	D	N	F	N	R	P	D	P	A	C	P	C	T	T	Y	D	C	V	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	G	F	R	C	S	V	M	N	I	I	N
Template Known Secondary structure								T		S								S	T	T	T	T						S	T	T	T		S					S	S		B		S		S	S				T	T	S				S	S			S	.	.	.	.	.	.	.	.				S		B
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.									210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	P	G	S	T	I	S	S	I	P	S	E	R	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	F	N	H	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	T	R	V
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	A	V	A	V	S	Q	K	A	R	.	.	.	.	.	.	.	S	G	G	W	N	D	L	D	M	L	E	V	G	N	G	G	M	N	Q	E	E	Y	R	V	H	Y	T	I	W	A	A	L	.	.	.	.	K	S	P	L	I	L	G	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							G	G	G		B	.	.	.	.	.	.	.	T	T	B							B		T	T	S	S	S	S															T	.	.	.	.	T							S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.								.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.					.	.	.	.	.	270	.	.	.
		610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	G	E	A	W	L	N	K	G	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D	K	A	G	I	W	S	A	F	E	G	V	S	A	T	K	N	V	L	A	F	S	R	G	D	S	V	N	I	N	H	S	P	H	D	G	L	V	I	I	N	K	G	N	E	E	V	E	G	T	W	P	N	K	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	V	T	N	I	T	N	T	T	K	E	I	I	M	N	K	E	V	I	A	V	N	Q	D	S	S	F	S	P	A	N	R	I	W	V	K	G	D	Q	Q	L	F	S	G	.	.	.	.	.	N	L	A	N	N	T	Q	V	V	I	L	L	N	A	G	D	S	A	A	K	M	T	A	T	W	D	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	S	S	S																			T		T	T											T	T							.	.	.	.	.			T	T	T										S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.
Template SS confidence
							274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.						.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		690	.	.													.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	Y	K	N	M	G	S	N	S	V	N	I	I	I	N	N	T	R	K	I	I	P	P	G	K	V	F	T	L	R	G	G	T	L	N	I	N	I	P	G	R	S	A	L	L	L	G	K	T	G	E
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	W	V	Y	N	L	P	N	V	D	S	S	R	S	I	E	V	R	D	L	W	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	K	S	L	G	N	F	S	N	H	I	T	L	D	V	P	A	H	G	V	R	L	L	K	F	M	D	S
Template Known Secondary structure			T	G	G	G	T	T	S	B		T	T								T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T								S								T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.