Job Description P76616 Confidence 96.47% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 157 Aligned Residues 345 % Identity 17% Template c3a24A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of bt1871 retaining glycosidase Resolution 2.30 Å

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		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.																.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	S	Q	C	E	I	I	T	P	K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T	F	R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	S	R	M	S	D	L	S	W	I	K	P	G	K	V	.	.	.	A	W	D	W	W	N	D	W	N	L	D	G	V	D	F	V	T	G	V	N	N	P	T	Y	K	A	Y	I	D	F	A	S	A	N	G	I	E	Y	V	I	L	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G
Template Known Secondary structure						S			T	T							.	.	.			S	T	T	T	T	T				S		S	S			S	S	S														T	T								T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.				.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.																			.
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	D	Y	P	S	A	D	I	R	A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	A	V	N	L	Q	A	D	L	M	Q	V	V	K	E	I	D	.	.	.	.	L	K	E	L	V	D	Y	A	A	S	K	N	V	G	I	I	L	W	A	G	Y	H	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	B		T	T	S			T	T		B		T	T			.	.	.	.											T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		353	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.					370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	K	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	E	R	D	M	E	N	V	C	R	H	Y	A	E	M
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																			393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	K	H	S	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F
Query Conservation
Alig confidence																		.
Template Conservation																		.
Template Sequence		G	V	K	G	F	K	V	D	F	M	D	R	D	D	Q	E	.	M	T	A	F	N	Y	R	A	A	E	M	C	A	K	Y	K	L	I	L	D	L	H	G	T	H	K	P	A	G	L	N	R	T	Y	P	N	V	L	N	F	E	G	V	N	G	L	E	Q	M	K	W	S	S	P	S	V	D	Q	V	K	Y	D	V
Template Known Secondary structure		T													S			.															T	T							S					T	T						T	T							S			G	G	G	G	G	T			T	T	S							T
Template Predicted Secondary structure																		.
Template SS confidence
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.		.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	S	F	G	G	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	I	S	S	I	P	S	E	R	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	F	N	H	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.											.		.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.											.		.	.	.
Template Sequence		M	I	P	F	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Q	V	S	G	P	M	D	Y	T	Q	G	A	M	R	N	A	S	K	G	N	Y	Y	P	C	Y	S	E	P	M	S	Q	G	T	R	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Q	L	A	L	Y	V	V	F	E	.	S	.	.	.	P	F	N	M
Template Known Secondary structure		T	G	G	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S									S	S				T	T						S	S	S					S				.	.	.	.	.	.	.	.	.									S		.		.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.											.		.	.	.
Template SS confidence
		487	.	.	490	.												.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.										.	.	530	.	.	.	.	.	.	.		.				.	540	.	.
		589	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.		650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.
Query SS confidence																																																															.
Query Sequence		W	D	G	Q	V	L	K	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	T	R	V	G	G	E	A	W	L	N	K	G	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D	K	A	G	I	W	S	A	F	E	G	V	S	A	T	.	K	N	V	L	A	F	S	R	G	D	S	V	N	I	N	H	S	P
Query Conservation																																																															.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	D	T	P	S	N	Y	M	R	E	P	E	S	T	A	F	I	A	E	I	P	T	V	W	D	E	S	I	V	L	D	G	K	M	G	E	Y	I	V	T	A	R	R	K	.	.	.	.	.	.	.	G
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S							T											S		S	S		S									T	T	T									.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		543																												.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.								.
		668	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.		.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.					.	.	720	.		.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.																														.	.	.	.					.
Query SS confidence																							.																														.	.	.	.					.
Query Sequence		H	D	G	L	V	I	I	N	K	G	N	E	E	V	E	G	T	W	P	N	K	.	L	Q	P	G	I	Y	K	N	M	G	S	N	S	V	N	I	I	I	N	N	T	R	K	I	I	P	P	G	K	.	.	.	.	V	F	T	L	.	R	G	G	T	L	N	I	N	I	P	G	R	S	A	L	L	L	G
Query Conservation																							.																														.	.	.	.					.
Alig confidence																							.								.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.					.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	W	Y	V	G	G	I	T	D	W	S	A	R	D	I	E	V	D	C	S	F	L	G	D	K	S	Y	H	.	.	.	.	.	.	A	T	L	F	K	D	G	V	N	A	H	R	A	G	R	D	Y	K	C	E	S	F	P	I	K	K	D	G	K	L	K	V	H	L	A	P	G	G	G	F	A	L	K
Template Known Secondary structure		T										S	S									T	T	S		S	S				.	.	.	.	.	.								T	T	T	T	T		T	T											T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		589	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.							.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660