Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 78 Aligned Residues 463 % Identity 16% Template c2x4bA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:limit dextrinase; PDBTitle: barley limit dextrinase in complex with beta-cyclodextrin Resolution 2.10 Å

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		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.								.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	Q	E	T	F	K	I	L	I	N	L	E	H	L	R	Q	T	L	E	R	K	S	L	T	A	V	Q	K	S	Q	C	E	I	I	T	P	K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	Y	Q	Q	I	R	E	N	.	.	.	.	.	.	.	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	S	D	I	T	I	Y	E	L	H	I	R	D	F	S	A	H	D	G	T	V	D	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	R	G	G	F	R	A	F	A	Y	Q	A	S	A	G	M	E	H	L	R	K	L	S	D	A	G	L	T	H	V	H	L	L	P
Template Known Secondary structure		G	G	G														T		T	T	S		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	S	G	G	G	G	G		T	T	S													T
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.								.	.	.	290	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	T	T	F	R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	.	.	.	.	.	.	.	L	Q	D	F	I	A	L	V
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.
Template Sequence		S	F	H	F	A	G	V	D	D	I	K	S	N	W	K	F	V	D	E	C	E	L	A	T	F	P	P	G	S	D	M	Q	Q	A	A	V	V	A	I	Q	E	E	D	P	Y	N	W	.	.	G	Y	N	P	V	L	W	G	V	P	K	G	S	Y	A	S	D	P	D	G	P	S	R	I	I	E	Y	R	Q	M	V
Template Known Secondary structure						S	S	S		S		G	G	G										T	T	S		T	T		S										T	T	S	S	S				.	.												G	G	G	S	S		S	S	S	T
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.
Template SS confidence
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.			.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	D	Y	P	S	A	D	I	R	A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T
Query Conservation
Alig confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	A	L	N	R	I	G	L	R	V	V	M	D	V	V	Y	N	H	L	D	S	S	G	P	C	G	I	S	S	V	L	D	K	I	V	P	G	Y	Y	V	R	R	D	T	N	G	Q	I	E	N	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	T										S	B		S			S	S		S	T	T							S	T	T	T	S	B		B		T	T	S		B			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.		.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.
Query SS confidence																																																						.
Query Sequence		A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	.	K	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	K	H	S	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P
Query Conservation																																																						.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	M	N	N	T	A	S	E	H	F	M	V	D	R	L	I	V	D	D	L	L	N	W	A	V	N	Y	K	V	D	G	F	R	F	D	L	M	G	H	I	M	K	R	T	M	M	R	A	K	S	A	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	B	B		T	T	S																		S								T	T	G	G	G	S	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																														439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490
		454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.					.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	.	.	.	.	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																				.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	S	L	T	T	D	A	H	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	D	G	S	K	I	Y	L	Y	G	E	G	W	D	F	A	E	V	A	R	N	Q	R	G	I	N	G	S	Q	L	N	M	S	G	T	G	I	G	S	F	N	D	R	I	R	D	A	I	N	G	G	N	P	F	G	N	P	L	Q	Q	G	F	N
Template Known Secondary structure			T							.	.	.	.	.	.	.	.	S	S		G	G	G											G	G	G	G	G	G	T	T	S	S	B			T	T	T	T	T	T	T	T															S		T	T	S		T	T				T	T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		491	.	.	.	.	.	.	.									.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.
										517	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	A	F	S	F	G	G	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	I	S	S	I	P	S	E	R	R	I	L	I	N	I	N	H	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	G	L	F	L	E	P	N	G	F	Y	Q	G	N	E	A	D	T	R	R	S	L	A	T	Y	A	D	Q	I	Q	I	G	L	A	G	N	L	R	D	Y	V	L	I	S	H	T	G	E	A	K	K	G	S	E	I	H	T	F	D	G	L	P	V	G	Y	T	A	S	P	I	E	T	I	N	Y	V	S	A	H	D
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	T	S			S	S																								B	T		B	S	S						T	T	S					T	T	T	S	B		T	T	S		B	S			B	S	S	G	G	G					S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		563	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.
		552	.	.	.	.	.	.	.							560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.		.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.																																					.																						.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.																																					.																						.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	P	N	N	G	N	L	F	.	.	.	.	.	.	N	D	F	L	F	N	H	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	.	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	T	R	V	G	G	E	A	W	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation										.	.	.	.	.	.																																					.																						.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.																							.														.																						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.
Template Sequence		N	E	T	L	F	D	V	I	S	V	K	T	P	M	I	L	S	V	D	E	R	C	R	I	N	H	L	A	S	S	M	M	A	L	S	Q	.	G	I	P	F	F	H	A	G	D	E	I	L	R	S	K	S	I	D	R	D	S	Y	N	S	G	D	W	F	N	K	L	D	F	T	Y	E	T	N	N	W	G	V	G
Template Known Secondary structure		S											S		T	T	S																		T	S	B	.	S						T	T	G	G	G	T				T	T		S		G	G	G	S									T	T	S	S					S	S
Template Predicted Secondary structure																																						.
Template SS confidence
		643	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.		.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.
																																617	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.												.	.	.	650	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D	K	A	G	I	W	S	A	F	E	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	A	T	K	N	V	L	A	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.
Template Sequence		L	P	P	S	E	K	N	E	D	N	W	P	L	M	K	P	R	L	E	N	P	S	F	K	P	A	K	G	H	I	L	A	A	L	D	S	F	V	D	I	L	K	I	R	Y	.	.	S	S	P	L	F	R	L	S	T	A	N	D	I	K	Q	R	V	R	F	H	N	T	G	P	S	L	V	P	G	V	I	V	M
Template Known Secondary structure									G	G	G											G	G	G	S																					T	.	.	T		G	G	G	G			S												S		S	T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure																																															.	.
Template SS confidence
		722	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.			.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		656	.	.	.	660	.	.	.	.								.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.		.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.																													.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.																													.
Query Sequence		S	R	G	D	S	V	N	I	N	.	.	.	.	.	.	.	H	S	P	H	D	G	L	V	I	I	N	K	G	N	E	E	V	E	G	T	W	P	N	K	L	Q	P	G	.	I	Y	K	N	M	G	S	N	S	V	N	I	I	I	N	N	T	R	K	I	I	P	P	G	K	V	F	T	L	R	G	G	T	L	N
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.																													.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.																													.																.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Sequence		G	I	E	D	A	R	G	E	S	P	E	M	A	Q	L	D	T	N	F	S	Y	V	V	T	V	F	N	V	C	P	H	E	V	S	M	D	I	P	A	L	A	S	M	G	F	E	L	H	P	V	Q	V	N	S	S	D	T	L	V	R	.	.	.	.	.	.	.	.	K	S	A	Y	E	A	A	T	G	.	.	R
Template Known Secondary structure								S	S	S		S	S					S	S											S	S	S							G	G	G		S	S										T		S		T	T	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	G					T	T	T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template SS confidence
		800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.									860	.	.	.	.	.	.	.	.			.
		728	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	N	I	P	G	R	S	A	L	L	L	G	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		F	T	V	P	G	R	T	V	S	V	F	V	E
Template Known Secondary structure						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.