Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 30 Aligned Residues 542 % Identity 15% Template c2wskA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glycogen debranching enzyme; PDBTitle: crystal structure of glycogen debranching enzyme glgx from2 escherichia coli k-12 Resolution 2.25 Å

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		47	.	.	50		.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.									.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.																.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.																.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	C	G	V	.	Y	P	Q	G	L	K	D	R	E	I	I	S	T	F	H	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	K	V	I	N	D	L	L	K	N	D	Y	K	I	S	L	S	P	D	T	T	Y	R	E	L	N	K	A	A	Q	R	S	I	T	A	P	D	R	I	G	E	R	K	T	W	V	Y	Q	R	D	T
Query Conservation						.																.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.																.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.								.										.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.								.										.
Template Sequence		A	I	G	K	P	A	P	L	G	A	H	Y	D	G	Q	G	V	N	F	T	L	F	S	A	H	A	E	R	V	E	L	C	V	F	D	A	N	G	Q	E	H	R	Y	D	L	P	G	H	S	G	D	I	.	.	.	.	.	.	.	W	H	G	Y	L	P	D	.	A	R	P	G	L	R	Y	G	Y	.	R	V	H
Template Known Secondary structure		B				S		S	S	S					S	S									S	S		S									T	T													T	T		.	.	.	.	.	.	.							T	.			T	T						.
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.								.										.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.								.	.	.	60	.	.	.		.	.	.	.	.	.	70	.	.		.	.	.
		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.						.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	I	E	R	G	D	N	S	G	V	Y	Q	Y	G	R	A	E	H	F	T	H	I	I	S	D	K	P	S	P	K	D	K	Y	V	A	Y	A	I	N	I	P	D	Y	E	L	A	A	D	.	.	.	.	.	V	Y	N	I	N	V	T	S	P	S	G	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	P	W	Q	P	A	E	G	H	R	F	N	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	L	L	I	D	P	C	A	R	Q	I	D	G	E	F	K	D	N	P	L	L	H	A	G	H	N	E	P	D	Y	R	D	N	A	A	I	A	P	K	C	V	V	V	V	D	H
Template Known Secondary structure						G	G	G	T					T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S		B			T	T		S				S						G	G	G	B			S	S	S							G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
															178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230			.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	E	T	F	K	I	L	I	N	L	E	H	L	R	Q	T	L	E	R	K	S	L	T	A	V	Q	K	S	Q	C	E	I	I	T	P	K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	Y	Q	Q	I	.	.	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	D	W	E	D	D	A	P	P	R	T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I
Template Known Secondary structure					T	T								G	G	G													T	T		T	T	S		G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	T	S					T	S											T
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.						.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.
Query Sequence		G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T	F	R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	.	.	.	.	.	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G
Query Conservation																																														.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.																	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.
Template Sequence		T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	.	.	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D
Template Known Secondary structure							S													T	T	T				S	S	.	.												G	G	G		S	S	G	G	G															T	T										S			T	T		S
Template Predicted Secondary structure																												.	.
Template SS confidence
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.			220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	G	K	N	D	L	D	Y	P	S	A	D	I	R	A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K
Query Conservation
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	S	B			S										B		B		T	T	S	S	B			S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.		.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.
Query SS confidence																																.
Query Sequence		E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	K	.	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	K	H	S	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V
Query Conservation																																.
Alig confidence		.	.	.	.																											.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	S	S	S			B		T	T	S																	T	T								T	T	T					B	S	S	S	B		T	T											T	T	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.											.	.
		477	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520		.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.						.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
Predicted Secondary structure																																														.														.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.														.	.	.	.	.
Query Sequence		M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	S	F	.	G	G	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	.	.	.	.	.	T	I	S	S	I	P	S	E	R	R	I	L	I	N	I	N	H
Query Conservation																																														.														.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.																												.														.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.
Template Sequence		K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	.	.	.	.	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H
Template Known Secondary structure								B		S	S	T	T		.	.	.	.	B		T	T		S		T	T																		T	S		S										B	T	T					S	S	T	T			G	G	G					S			S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.
Template SS confidence
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.					380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.
		551	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	F	N	H	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	S
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation																																																																			.
Template Sequence		D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	.	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S
Template Known Secondary structure		S	S							T	T		S	S				G	G	G	S	S	T	T		S	S		S							T	T	S	S	S	S																								S	B	.	S						T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																			.
Template SS confidence
		443	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.		.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.
			597	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.			.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	650	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																					.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																					.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	T	R	V	G	G	E	A	W	L	N	.	.	K	G	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D	K	A	G	I	W	S	A	F	E	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	A	T	K	N	V	L	A	F
Query Conservation		.																					.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																					.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I
Template Known Secondary structure			T	T		S			T	T			S	T	T	T	S			G	G	G																	T	T						S						T	T	S	S	S						T	T	S	S	B									S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		522	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.
		656	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	R	G	D	S	V	N	I	N	H	S	P	H	D	G	L	V	I	I	N	K	G	N	E	E	V	E	G	T	W	P	N	K	L	Q	P	G	I	Y	K	N	M	G	S	N	S	V	N	I	I	I	N	N	T	R	K	I	I	P	P	G	K	V	F	T	L	R	G	G	T	L	N	I	N	I	P	G	R	S	A
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	L	S	D	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	.	.	.	.	L	P	A	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	D	N	P	V	I	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L
Template Known Secondary structure				T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S	S	S						.	.	.	.			S	S						T	T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T						S						T	T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		602	.	.	.	.										.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.					.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.
		736	.	.	.	740
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	L	G	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		C	V	F	Q	R
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		653	.	.	.	.