Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 45 Aligned Residues 456 % Identity 14% Template c2vncB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:glycogen operon protein glgx; PDBTitle: crystal structure of glycogen debranching enzyme trex from2 sulfolobus solfataricus Resolution 3.0 Å

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		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.			.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.
Query SS confidence																																																												.	.
Query Sequence		P	S	G	Q	Q	E	T	F	K	I	L	I	N	L	E	H	L	R	Q	T	L	E	R	K	S	L	T	A	V	Q	K	S	Q	C	E	I	I	T	P	K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	Y	Q	Q	I	R	.	.	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T
Query Conservation																																																												.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	V	P	L	K	D	T	V	I	Y	E	V	H	V	K	G	F	T	K	L	R	L	D	L	P	E	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	R	G	T	Y	E	G	L	A	S	E	Q	M	I	S	Y	L	K	D	L	G	I	T	T	V	E	L	M	P	V	F
Template Known Secondary structure					T	T	T													S	S			S	S		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	S					T	S	S										T										B
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.								.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	F	R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	.	.	.	.	.	.	.	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	D
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.																	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.
Template Sequence		H	F	I	D	Q	R	F	L	T	D	K	G	L	T	N	Y	W	.	.	G	Y	D	P	I	N	F	F	S	P	E	C	R	Y	S	S	T	G	C	L	G	G	Q	V	L	S	F	K	K	M	V	N	E	L	H	N	A	G	I	E	V	I	I	D	V	V	Y	N	H	T	A	E	G	N	H	L	G	P	T	L	S
Template Known Secondary structure			B								T	T	S					S	.	.				B	S		S	S	S	B		G	G	G		T	T		S	S	S																	T										S			T	T		S	S	S		B		S	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.
Template SS confidence
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.			.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	P	S	A	D	I	R	A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	R	G	I	D	N	T	A	Y	Y	M	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	P	D	N	K	R	Y	Y	L	D	F	T	G	T	G
Template Known Secondary structure							S	T	T	T	B			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T								S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.		.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.
Query SS confidence																									.
Query Sequence		P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	K	.	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	K	H	S	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L
Query Conservation																									.
Alig confidence																									.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	T	L	N	L	S	H	P	R	V	I	Q	M	V	L	D	S	L	R	Y	W	V	T	E	M	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	A	L	A	R	E	L	Y	S	V	N	M	L	N	T	F	F	I	A	L	Q	Q	D	P	I	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W
Template Known Secondary structure				B		T	T	S																	T	T								T	T										T	T	T												S	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.										.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
		484	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520		.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.			.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560
Predicted Secondary structure																																							.																							.	.
Query SS confidence																																							.																							.	.
Query Sequence		V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	S	F	.	G	G	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	I	S	S	I	P	S	E	R	.	.	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N
Query Conservation																																							.																							.	.
Alig confidence								.	.	.	.																												.																							.	.
Template Conservation								.	.	.	.
Template Sequence		D	V	G	Q	G	G	.	.	.	.	Y	Q	V	G	N	F	P	Y	Q	W	A	E	W	N	G	K	Y	R	D	S	I	R	R	F	W	R	G	E	A	L	P	Y	S	E	I	A	N	R	L	L	G	S	P	D	I	N	N	K	T	P	F	A	S	I	N	Y	V	T	S	H	D	G	F	T	L	E	D	L	V	S
Template Known Secondary structure				S	S	S	S	.	.	.	.				S				T	T						T	T									T	T		S				T	T								T		T	T					S	G	G	G					S			T	T	S		S	S	S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.
Template SS confidence
		402	.	.	.	.	.					.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
		561	.	.	.	.	.																											.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.						.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.
Query Sequence		D	F	L	F	N	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	S	T	T	E	I	K	N	.	.	.	.	.	Y	D	G	S	T	R	V
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.																					.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.
Template Sequence		Y	N	H	N	E	A	N	G	F	N	N	Q	D	G	M	N	E	N	Y	S	W	N	C	G	D	Q	N	V	V	I	C	R	E	K	Q	K	R	N	F	M	I	T	L	L	V	S	Q	.	G	T	P	M	I	L	G	G	D	E	L	S	R	T	Q	R	G	N	N	N	A	F	C	Q	D	N	E	I	T	W	F	D
Template Known Secondary structure						S	S	S	T	T	T	T			S		S											T	T	S	T	T					S	S							T	T	S	S	.	S						T	T	T	T	T	T				T	T		S			T	T			S	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																	.
Template SS confidence
		481	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.		.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.						.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	E	A	W	L	N	K	G	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D	K	A	G	I	W	S	A	F	E	G	V	S	A	T	K	N	V	L	A	F	S	R	G	D	S	V	N	I	N	H	.	.	.	.	.	S	P	H	D	G	L	V	I	I	N	K	G	N	E	E	V	E	G	T
Query Conservation																																																										.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.																																	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.
Template Sequence		W	N	L	D	E	R	K	S	K	F	L	E	F	V	K	K	M	I	Q	F	Y	R	.	.	A	H	P	A	F	R	R	E	R	D	V	T	F	Y	T	L	E	G	R	E	V	D	E	K	T	W	S	S	P	T	Q	L	V	I	F	V	L	E	G	D	S	F	L	I	I	L	N	A	N	P	N	N	V	K	V	K
Template Known Secondary structure			S			S	T	T	T	T	T												T	.	.	T		G	G	G	S	S									T	T	T					S	S	T	T	S			S																				S	S					B
Template Predicted Secondary structure																								.	.
Template SS confidence
		568	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.			590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.
		685	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	P	N	K	L	Q	P	G	I	Y	K	N	M	G	S	N	S	V	N	I	I	I	N	N	T	R	K	I	I	P	P	G	K	V	F	T	L	R	G	G	T	L	N	I	N	I	P	G	R	S	A	L	L	L	G	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	F	P	K	G	K	W	E	L	V	I	S	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	R	E	I	K	P	E	E	G	E	K	E	L	E	I	E	G	R	T	A	L	V	Y	R	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.			S	S			B							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S				S						B					S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						674	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.															.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.