Job Description P76616 Confidence 96.43% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 158 Aligned Residues 406 % Identity 12% Template c2qmjA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:maltase-glucoamylase, intestinal; PDBTitle: crystral structure of the n-terminal subunit of human maltase-2 glucoamylase in complex with acarbose Resolution 1.90 Å

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		220	.	.	.	.	.				.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.			.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.																		.	.
Query SS confidence								.	.	.																		.	.
Query Sequence		L	H	A	F	N	A	.	.	.	T	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	.	.	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T	F	R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	L	Q	D	F	I	A	L	V
Query Conservation								.	.	.																		.	.
Alig confidence								.	.	.																		.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	H	L	S	R	Y	E	Y	G	T	L	D	N	M	R	E	V	V	E	R	N	R	A	A	Q	L	P	Y	D	V	Q	H	A	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	M	D	E	R	R	D	F	T	Y	D	S	V	D	F	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	P	E	F	V
Template Known Secondary structure							S				S														T	T										G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S	B	T	T	B	T	T				T	T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.													.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.											.	.	.	.	350	.
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.		.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.
Query SS confidence																															.
Query Sequence		K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	.	D	Y	P	S	A	D	I	R	A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L
Query Conservation																															.
Alig confidence																		.													.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	E	L	H	N	N	G	Q	K	L	V	I	I	V	D	P	.	A	I	S	N	N	S	S	S	S	K	P	Y	G	P	Y	D	R	G	S	D	M	K	I	W	V	N	S	S	D	G	V	T	P	L	I	G	E	V	W	P	G	Q	T	V	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	T									S	.								S	S	S												T		B		B		T	T	S	S	S	B						T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.		.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.		.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	.	K	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																							.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	Y	T	N	P	N	C	A	V	W	W	T	K	E	F	E	L	F	H	N	Q	V	E	F	D	G	I	W	I	D	M	N	E	V	S	N	F	V	D	G	S	V	S	G	C	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B		T	T	S																T	T	S			S						S	T	T	T			S	S	S	B	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																			413	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																							440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	S	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	N	N	L	N	N	P	P	F	T	P	R	I	L	D	G	Y	L	F	C	K	T	L	C	M	D	A	V	Q	H	W	G	K	Q	Y	D	I	H	N	L	Y	G	Y	S	M	A	V	A	T	A	E	A	A	K	T	V	F	P	N	K	R	S	F	I	L	T	R	S	T	F	A	G	S	G	K	F	A	A	H	W
Template Known Secondary structure			S	T	T	T	S		S				S		G	G	G		T	T	T	T	S	B		T	T				T	T							G	G	G																	S	T	T	B							S	S			T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	S	F	G	G	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	I	S	S	I	P	S	E	R	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F
Query Conservation
Alig confidence																																							.																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	G	D	N	T	A	T	W	D	D	L	R	W	S	I	P	G	V	L	E	F	N	L	F	G	I	P	M	V	G	P	D	I	C	G	F	A	.	L	D	T	P	E	E	L	C	R	R	W	M	Q	L	G	A	F	Y	P	.	.	.	.	.	.	F	S	R	N	H	N	G	Q	G	Y	K	D	Q	D	P	A	S
Template Known Secondary structure				S		B	S	S																	T	T			S						T		S	B	.	S															T	T	S	S	.	.	.	.	.	.	S							S	S	S				S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																							.																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.		.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.							.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.
		563	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	F	N	H	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	T	R	V	G	G	E	A	W	L	N	K	G	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D	K	A	G	I	W	S	A
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	G	A	D	S	L	L	L	N	S	S	R	H	Y	L	N	I	R	Y	T	L	L	P	Y	L	Y	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	F	F	R	A	H	S	R	G	D	T	V	A	R	P	L	L	H	E	F	Y	E
Template Known Secondary structure		G		T	T																	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T				S									T	T
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		613	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.
		643	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		F	E	G	V	S	A	T	K	N	V	L	A	F	S	R	G	D	S	V	N	I	N	H	S	P	H	D	G	L	V	I	I	N	K	G	N	E	E	V	E	G	T	W	P	N	K	L	Q	P	G	I	Y	K	N	M	G	S	N	S	V	N	I	I	I	N	N	T	R	K	I	I	P	P	G	K	V	F	T	L	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.																																		.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Sequence		D	N	S	T	W	D	V	H	Q	Q	F	L	W	G	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	I	T	P	V	L	D	E	G	A	E	K	V	M	A	Y	.	.	V	P	D	A	V	W	Y	D	Y	E	T	G	S	Q	V	R	W	R	K	Q	K	V	E	M	E	L	P	G	D	K	I	G	L	H
Template Known Secondary structure			G	G	G	T	T			S					T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S	T	T		S						.	.			S	S					T	T	T			B		S			S									T	T
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template SS confidence
		662	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.												.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.			.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.
			722	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.													.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750
Predicted Secondary structure		.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	R	G	G	T	L	N	I	N	I	P	G	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	L	L	G	K	T	G	E	P	P	N	Y	L	Y	L
Query Conservation		.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	R	G	G	Y	I	F	P	T	Q	Q	P	N	T	T	T	L	A	S	R	K	N	P	L	G	L	I	I	A	L	D	E	N	K	E	A	K	G	E	L	F	W
Template Known Secondary structure				T	T										S	S					T	T	S										T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		729	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770