Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 89 Aligned Residues 426 % Identity 16% Template c2gdvA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:sucrose phosphorylase; PDBTitle: sucrose phosphorylase from bifidobacterium adolescentis2 reacted with sucrose Resolution 2.00 Å

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		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	Q	E	T	F	K	I	L	I	N	L	E	H	L	R	Q	T	L	E	R	K	S	L	T	A	V	Q	K	S	Q	C	E	I	I	T	P	K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T	F	R	A	D
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	K	N	K	V	Q	L	I	T	Y	A	D	R	L	G	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	I	K	S	M	T	D	I	L	R	T	R	F	D	G	V	Y	D	G	V	H	I	L	P	F	F	T	P	F	D	G
Template Known Secondary structure				S	S							S	S	S	B	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S												S	T	T	T		S											S	S	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.			.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.	.
Query SS confidence																																																																					.	.
Query Sequence		G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	.	.	D	Y	P	S	A	D	I	R	A	K	I
Query Conservation																																																																					.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.																									.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	A	G	F	D	P	I	D	H	T	K	V	D	E	R	L	G	S	W	D	D	V	A	E	L	S	.	.	.	.	.	K	T	H	N	I	M	V	D	A	I	V	N	H	M	S	W	E	S	K	Q	F	Q	D	V	L	A	K	G	E	E	S	E	Y	Y	P	M	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	T	T	S	S		S							T	T	T										T	.	.	.	.	.	T	T	S									S				T	T	S										G	G	G	S	T	T	G	G	G	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Template SS confidence
													49	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.						.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V
Query Conservation
Alig confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	T	M	S	S	V	F	P	N	G	A	T	E	E	D	L	A	G	I	Y	R	P	R	P	G	L	P	F	T	H	Y	K	F	A	G	K	T	R	L	V	W	V	S	F	T	P	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	V	D	I	D	T	D	S	D	K	G
Template Known Secondary structure			B						T	T									T	S			S	S	S	S		S							T	T								S	S	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		113	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
		415	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.										.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	K	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	K	H	S	K	H	E	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	E	Y	L	M	S	I	F	D	Q	M	A	A	S	H	V	S	Y	I	R	L	D	A	V	G	Y	G	A	K	E	A	G	T	S	C	F	M	T	P	K	T	F	K	L	I	S	R	L	R	E	E	G	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	L	E	I	L	I	E	V	H	S	Y
Template Known Secondary structure															T	T								T	G	G	G	S				T	T	S		S	S	S																	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T									S
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.															.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
		486	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	S	F	G	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	K	.	.	.	.	.	.	K	Q	V	E	I	A	S	K	V	D	R	V	Y	D	F	A	L	P	P	L	L	L	H	A	L	S	T	G	H	V	E	P	V	A	H	W	T	D	I	R	P	N	N	A	V	T	V	L	D	T	H	D	G	I	G	V	I	D	I	G	S	D	Q	L	D	R	S	L	K	G	L	V
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.						G	G	G	S	S						S																								S		S	S					S			S	S		B		S	T	T	T	S			S	S		T	T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		237	.							.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
						524	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																																																									.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																																																																									.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	I	S	S	I	P	S	E	R	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	F	N	H	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.																																																																									.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																																											.														.	.	.	.
Template Conservation																																																																.
Template Sequence		P	D	E	D	V	D	N	L	V	N	T	I	H	A	N	T	H	G	E	S	Q	A	A	T	G	A	A	A	S	N	L	D	L	Y	Q	V	N	S	T	Y	Y	S	A	L	G	C	N	D	Q	H	Y	I	A	A	R	A	V	Q	F	F	L	P	.	G	V	P	Q	V	Y	Y	V	G	A	L	A	G	K	N	D	M
Template Known Secondary structure																	T	T	T						S	G	G	G	S	B		S		S	S	S	B		S						T	T	T															S	S	.	S										T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																.
Template SS confidence
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.		.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
								596	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	T	R	V	G	G	E	A	W	L	N	K	G	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D	K	A	G	I	W	S	A	F	E	G	V	S	A	T	K	N	V	L	A	F	S	R	G	D	S	V	N	I	N	H	S	P	H	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																										.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	L	L	R	K	T	N	N	G	R	D	I	N	R	H	Y	Y	S	T	A	E	I	D	E	N	L	K	R	P	V	V	K	A	L	N	A	L	A	K	F	R	N	E	L	D	A	F	.	.	.	D	G	T	F	S	Y	T	T	D	D	D	T	S	I	S	F	T	W	.	.	.	.	.	.	R	G	E	T	S	Q
Template Known Secondary structure									B	G	G	G	G	G				B									T	T	S																	G	G	G	.	.	.	G	S								T	T	T							.	.	.	.	.	.			S	S
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.				.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.							.	.	.	.	.	460
		670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	L	V	I	I	N	K	G	N	E	E	V	E	G	T	W	P	N	K	L	Q	P	G	I	Y	K	N	M	G	S	N	S	V	N
Query Conservation
Alig confidence									.
Template Conservation									.
Template Sequence		A	T	L	T	F	E	P	.	K	R	G	L	G	V	D	N	T	T	P	V	A	M	L	E	W	E	D	S	A	G	D	H	R	S
Template Known Secondary structure								G	.	G	G	G		S	T	T			S										T	T
Template Predicted Secondary structure									.
Template SS confidence
		461	.	.	.	.	.	.		.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.