Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 46 Aligned Residues 565 % Identity 13% Template c2e8yA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:amyx protein; PDBTitle: crystal structure of pullulanase type i from bacillus subtilis str.2 168 Resolution 2.11 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.									.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	Q	G	L	K	D	R	E	I	I	S	T	F	H	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	K	V	I	N	D	L	L	K	N	D	Y	K	I	S	L	S	P	D	T	T	Y	R	E	L	N	K	A	A	Q	R	S	I	T	A	P	D	R	I	G	E	R	K	T	W	V	Y	Q	R	D	T	M	I	E	R	G	D
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.
Template Sequence		E	L	G	A	V	Y	T	A	D	H	T	V	F	K	V	W	A	P	A	A	T	S	A	A	V	K	L	S	H	P	N	K	S	G	R	T	F	Q	M	T	R	L	E	K	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	A	.	.	.	.	V	T	V	T	G
Template Known Secondary structure									S	S									T	T		S									T	T	S											G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.					S
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.
Template SS confidence
		105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150																								.	.					.	.	.	.	.
		124	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.		.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
Predicted Secondary structure																																			.
Query SS confidence																																			.
Query Sequence		N	S	G	V	Y	Q	Y	G	R	A	E	H	F	T	H	I	I	S	D	K	P	S	P	K	D	K	Y	V	A	Y	A	I	N	.	I	P	D	Y	E	L	A	A	D	V	Y	N	I	N	V	T	S	P	S	G	Q	Q	E	T	F	K	I	L	I	N	L	E	H	L	R	Q	T	L	E	R	K	S	L	T	A	V
Query Conservation																																			.
Alig confidence																																			.																																									.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.
Template Sequence		D	L	H	G	Y	E	Y	L	F	C	I	C	N	N	S	E	W	M	E	T	V	D	Q	Y	A	K	A	V	T	V	N	G	E	K	G	V	V	L	R	P	D	Q	M	K	W	T	A	P	L	K	P	F	S	H	P	V	D	A	V	I	Y	E	T	H	L	R	D	F	S	I	H	E	N	S	.	.	.	G	M	I
Template Known Secondary structure				T	T										T	T								T	T		S	S	B		G	G	G		S																			S		G	G	G														S	T	T	S	.	.	.			S
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.				.	.	.
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	K	S	Q	C	E	I	I	T	P	K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T	F	R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.												.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.												.	.
Template Sequence		N	K	G	K	Y	L	A	L	T	E	T	D	T	Q	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	N	G	S	S	S	G	L	A	Y	V	K	E	L	G	V	T	H	V	E	L	L	P	V	N	D	F	A	G	V	.	D	E	E	K	P	L	D	A	Y	N	W	.	.	G	Y	N	P	L	H	F	F	A	P	E	G
Template Known Secondary structure		S	T	T	S	G	G	G	G	G		T	T		B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S		B										T		S					S						S	S	S	.		T	T	S	G	G	G					.	.			S									S
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.												.	.
Template SS confidence
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.										250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290			.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
		283	.	.	.									.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	M	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	D	Y	P	S	A	D	I	R	A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Sequence		S	Y	A	S	N	P	H	D	P	Q	T	R	K	T	E	L	K	Q	M	I	N	T	L	H	Q	H	G	L	R	V	I	L	D	V	V	F	N	H	V	Y	K	R	E	N	S	P	F	E	K	T	V	P	G	.	.	.	.	.	Y	F	F	R	H	D	E	C	G	K	P	S	N	G	T	G	V	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	S	S		S	S	S																		T	T									T	T			S	S	G	G	G	S						S	T	T	.	.	.	.	.	T	S	B		B		T	T	S	S	B			T	T	S	S	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.						.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.		.	.	.	430	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.
Query SS confidence																																																																										.
Query Sequence		I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	.	K	Y	G	V	R	G	L
Query Conservation																																																																										.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	D	I	A	S	E	R	R	M	A	R	K	F	I	A	D	C	V	V	Y	W	L	E	E	Y	N	V	D	G	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																			373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
		434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	Y	D	A	A	K	H	S	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	F	D	L	L	G	I	L	D	I	D	T	V	L	Y	M	K	E	K	A	T	K	A	K	P	G	I	L	L	F	G	E	G	W	D	L	A	T	P	L	P	H	E	Q	K	A	A	L	A	N	A	P	R	M	P	G	I	G	F	F	N	D	M	F	R	D	A	V	K	G	N	T	F	H	L	K	A	T	G	F
Template Known Secondary structure				T	T	G	G	G	S	B															S	T	T													S	S		G	G	G	B			G	G	G	G	G	G		T	T																S	S	S	T	T				G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.
					507	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.						.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	S	F	G	G	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	I	S	S	I	P	S	E	R	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	F	N	H	.	.	.	.	.	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A
Query Conservation		.	.	.																																																													.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																			.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	G	N	G	E	S	A	Q	A	V	M	H	G	I	A	G	S	S	G	W	.	.	.	.	.	.	K	A	L	A	P	I	V	P	E	P	S	Q	S	I	N	Y	V	E	S	H	D	N	H	T	F	W	D	K	M	S	F	A	L	P	Q	E	N	D	S	R	K	R	S	R	Q	R	L	A	V	A	I	I	L
Template Known Secondary structure		G	G	T		G	G	G									B	T	T	S		B	.	.	.	.	.	.	T	T	B			S	S	S	S	G	G	G					S			S	S	S	S											T	T
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		484	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.							.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
		579	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.						.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.						.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	.	.	.	.	.	T	R	V	G	G	E	A	W	L	N	K	G	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	.	.	.	.	.	Y	I	D	K	A	G	I	W	S	A	F	E	G	V	S	A
Query Conservation																														.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.
Alig confidence					.																									.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.
Template Conservation					.
Template Sequence		L	A	Q	.	G	V	P	F	I	H	S	G	Q	E	F	F	R	T	K	Q	G	V	E	N	S	Y	Q	S	S	D	S	I	N	Q	L	D	W	D	R	R	E	T	F	K	E	D	V	H	Y	I	R	R	L	I	S	L	R	K	A	H	P	A	F	R	L	R	S	A	A	D	I	Q	R	H	L	E	C	L	T	L
Template Known Secondary structure		T	S	B	.	S						T	T	G	G	G	T				T	T		S			T	T							S									T																		G	G	G	G			S
Template Predicted Secondary structure					.
Template SS confidence
		558	.	560		.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.
		649	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	K	N	V	L	A	F	S	R	G	D	S	V	N	I	N	H	S	P	H	D	G	L	V	I	I	N	K	G	N	E	E	V	E	G	T	W	P	N	K	L	Q	P	G	I	Y	K	N	M	G	S	N	S	V	N	I	I	I	N	N	T	R	K	I	I	P	P	G	K	V	F	T	L	R	G	G	T	L	N	I
Query Conservation
Alig confidence																.																								.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Conservation																.																								.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Sequence		K	E	H	L	I	A	Y	R	L	Y	D	L	D	E	.	V	D	E	W	K	D	I	I	V	I	H	H	A	S	P	D	S	V	E	W	R	L	P	.	.	.	N	D	I	P	Y	R	L	L	C	D	P	S	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	E	D	P	T	E	I	K	K	.	.	T	V
Template Known Secondary structure			S	S										T	T	.	T		S	S	S									S	S	S							S	.	.	.	S		S								T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									S	.	.
Template Predicted Secondary structure																.																								.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template SS confidence
		637	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650		.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.				.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.													.	.	690	.	.	.	.	.	.			.	.
		729	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	I	P	G	R	S	A	L	L	L	G	K	T	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	V	N	G	I	G	T	V	I	L	Y	L	A	S
Template Known Secondary structure					S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		699	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.