Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 64 Aligned Residues 456 % Identity 16% Template c1zjaB_ PDB info PDB header:isomerase Chain: B: PDB Molecule:trehalulose synthase; PDBTitle: crystal structure of the trehalulose synthase mutb from2 pseudomonas mesoacidophila mx-45 (triclinic form) Resolution 1.60 Å

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		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	P	S	G	Q	Q	E	T	F	K	I	L	I	N	L	E	H	L	R	Q	T	L	E	R	K	S	L	T	A	V	Q	K	S	Q	C	E	I	I	T	P	K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	A	P	W	W	K	S	A	V	F	Y	Q	V	Y	P	R	S	F	K	D	T	N	G	D	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	F	K	G	L	T	E	K	L	D	Y	L	K	G	L	G	I	D	A	I	W	I	N	P	H	Y	A
Template Known Secondary structure																G	G	G	T			S	S	S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T								T
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.		.	.	.	.	.	.	330	.
Predicted Secondary structure																																																																									.
Query SS confidence																																																																									.
Query Sequence		F	R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	.	D	Y	P	S	A	D	I	R
Query Conservation																																																																									.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	P	N	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	G	Y	D	I	S	D	Y	R	E	V	M	K	E	Y	G	T	M	E	D	F	D	R	L	M	A	E	L	K	K	R	G	M	R	L	M	V	D	V	V	I	N	H	S	S	D	Q	H	E	W	F	K	S	S	R	A	S	K	D	N	P	Y	R
Template Known Secondary structure					T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	S	S		S							G	G	G																T	T										S	B			T	T	S								T		S	S	S	T	T	G
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		57	.	.	60													.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Y	Y	F	W	R	D	G	K	D	G	H	E	P	N	N	Y	P	S	F	F	G	G	S	A	W	E	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	P	V	T	G	Q	Y	Y	L	H	Y	F	G	R	Q	Q	P	D	L	N	W	D	T
Template Known Secondary structure		G	G	B						B	T	T	B		S	S			B		T	T	S	S	B	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T	T						S	S		T	T			B	B		T	T
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	K	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	K	H	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	K	L	R	E	E	L	Y	A	M	L	R	F	W	L	D	K	G	V	S	G	M	R	F	D	T	V	A	T	Y	S	K	T	P	G	F	P	D	L	T	P	E	Q	M	K	N	F	A	E	A	Y	T	Q	G	P	N	L	H	R	Y	L	Q	E	M	H	E	K	V	F	D	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																	T	T	T							T	T	G	G	G	S	S			T	T											T					T	T			T	T												T	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
		466	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.					.	540	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.
Query SS confidence																																																																											.	.	.	.
Query Sequence		L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	S	F	G	G	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	I	S	S	I	.	.	.	.	P	S	E
Query Conservation																																																																											.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																											.																																							.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																											.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	A	V	T	A	G	E	I	F	G	A	P	L	N	Q	V	P	L	F	I	D	S	R	R	K	.	E	L	D	M	A	F	T	F	D	L	I	R	Y	D	R	A	L	D	R	W	H	T	I	P	R	T	L	A	D	F	R	Q	T	I	D	K	V	D	A	I	A	G	E	Y	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	S										S			G	G	G							G	G	G		.	S		S					S	T	T	T	T	T	T	B		T	T	S	S		B																				T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																											.
Template SS confidence
										247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.		.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
		542	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.		.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	.	F	N	H	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																								.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.																			.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.
Template Sequence		W	N	T	F	F	L	G	N	H	D	N	P	R	A	V	S	H	F	G	D	D	R	P	Q	W	R	E	A	S	A	K	A	L	A	T	V	T	L	T	Q	R	.	G	T	P	F	I	F	Q	G	D	E	L	G	M	T	N	Y	P	F	K	T	L	Q	D	F	D	D	I	E	V	K	G	F	F	Q	D	Y	V	E
Template Known Secondary structure			B				S			T	T	S								S			S	T	T	T													T	T	S	S	.	S						T	T	G	G	G	T								S	G	G	G														T	T
Template Predicted Secondary structure																																											.
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.		.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
																						608	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	V	G	G	E	A	W	L	N	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template Conservation																																																																													.	.
Template Sequence		T	G	K	A	T	A	E	E	L	L	T	N	V	A	L	T	S	R	D	N	A	R	T	P	F	Q	W	D	D	S	A	N	A	G	F	T	T	G	K	P	W	L	K	V	N	P	N	Y	T	E	I	N	A	A	R	E	I	G	D	P	K	S	V	Y	S	F	Y	R	N	L	I	S	I	R	H	.	.	E	T	P
Template Known Secondary structure		T	T	S	S														G	G	G	G	T	S					S	S	S	G	G	G	G	S		S	S			S	S				G	G	G	G	T	S							T		T	T	S														.	.	T		T
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.
Template SS confidence
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.			.	.	.
		637	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650		.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.
Query SS confidence																.
Query Sequence		A	G	I	W	S	A	F	E	G	V	S	A	T	K	.	N	V	L	A	F	S	R	G	D	S	V	N	I	N	H	S	P	H	D	G	L	V	I	I	N	K	G	N	E	E	V	E	G	T	W	P	N	K	L	Q	P	G	I	Y	K	N	M	G	S	N	S	V	N	I	I	I	N	N	T	R	K	I	I	P	P
Query Conservation																.
Alig confidence																.								.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	S	T	G	S	Y	R	D	I	D	P	S	N	A	D	V	Y	A	Y	T	R	.	.	.	.	.	.	S	Q	D	G	E	T	Y	L	V	V	V	N	F	K	A	E	P	R	S	F	T	L	P	D	G	M	H	I	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	I	E	S
Template Known Secondary structure						S					S		T	T		S	S							.	.	.	.	.	.			T	T										S	S	S								T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		475	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.							.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	530	.
		716	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	K	V	F	T	L	R	G	G	T	L	N	I	N	I	P	G	R	S	A	L	L	L	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	S	P	A	A	P	A	A	G	A	A	S	L	E	L	Q	P	W	Q	S	G	I	Y	K
Template Known Secondary structure		S		S	S				T	T		S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		532	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.