Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 53 Aligned Residues 455 % Identity 15% Template c1uokA_ PDB info PDB header:glucosidase Chain: A: PDB Molecule:oligo-1,6-glucosidase; PDBTitle: crystal structure of b. cereus oligo-1,6-glucosidase Resolution 2.00 Å

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		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	S	G	Q	Q	E	T	F	K	I	L	I	N	L	E	H	L	R	Q	T	L	E	R	K	S	L	T	A	V	Q	K	S	Q	C	E	I	I	T	P	K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T	F
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	Q	W	W	K	E	S	V	V	Y	Q	I	Y	P	R	S	F	M	D	S	N	G	D	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	L	R	G	I	I	S	K	L	D	Y	L	K	E	L	G	I	D	V	I	W	L	S	P	V	Y	E	S
Template Known Secondary structure															G	G	G	T			S	S	S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T								T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.
		254	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.		.	.	.	.	.	.	330	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.
Query SS confidence																																																																								.
Query Sequence		R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	.	D	Y	P	S	A	D	I	R	A
Query Conservation																																																																								.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	N	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	G	Y	D	I	S	D	Y	C	K	I	M	N	E	F	G	T	M	E	D	W	D	E	L	L	H	E	M	H	E	R	N	M	K	L	M	M	D	L	V	V	N	H	T	S	D	E	H	N	W	F	I	E	S	R	K	S	K	D	N	K	Y	R	D
Template Known Secondary structure				T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	S	S		S							G	G	G																T	T										S	B			T	T	S							T	T		T	T		T	T	G	G
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		57	.	.													60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.
		333	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	Y	I	W	R	P	G	K	E	G	K	E	P	N	N	W	G	A	A	F	S	G	S	A	W	Q	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	M	T	D	E	Y	Y	L	H	L	F	S	K	K	Q	P	D	L	N	W	D	N	E
Template Known Secondary structure		G	B						S	S	S	S		S	S		B	B		T	T	S	S	B	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T	T						S	S		T	T	S		B	B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		413	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	K	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	K	H	S	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	V	R	Q	D	V	Y	E	M	M	K	F	W	L	E	K	G	I	D	G	F	R	M	D	V	I	N	F	I	S	K	E	E	G	L	P	T	V	E	T	E	E	E	G	Y	V	S	G	H	K	H	F	M	N	G	P	N	I	H	K	Y	L	H	E	M	N	E	E	V	L	S	H	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																	T	T							T	T	G	G	G	S				T	T									S	S		B			G	G	G	T	T	T		T	T												T	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
		465	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.					.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.
Query Sequence		N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	.	.	.	.	S	F	G	G	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	I	S	S	I	P	S
Query Conservation																																																								.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																																			.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	I	M	T	V	G	E	M	P	.	G	V	T	T	E	E	A	K	L	Y	T	G	E	E	R	K	E	L	Q	M	V	F	Q	F	E	H	M	D	L	D	S	G	E	G	G	K	W	D	V	K	P	C	S	L	L	T	L	K	E	N	L	T	K	W	Q	K	A	L	E	H
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	S									T	.	T												G	G	G		S		S						G	G	G	S	T	T			T	T																								T	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template SS confidence
											248	.	250	.	.	.	.	.	.	.		.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
		541	.		.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	R	.	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	F	N	H	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation				.																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.																																								.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.
Template Sequence		T	G	W	N	S	L	Y	W	N	N	H	D	Q	P	R	V	V	S	R	F	G	N	D	G	M	Y	R	I	E	S	A	K	M	L	A	T	V	L	H	M	M	K	.	G	T	P	Y	I	Y	Q	G	E	E	I	G	M	T	N	V	R	F	E	S	I	D	E	Y	R	D	I	E	T	L	N	M	Y	K	E	K	V
Template Known Secondary structure		S	S						S			T	T	S							T	S		S	S	T	T														T	S	S	.	S						T	T	G	G	G	T							S	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																												.
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
																						607	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	V	G	G	E	A	W	L	N	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template Conservation																																																																														.	.
Template Sequence		M	E	R	G	E	D	I	E	K	V	M	Q	S	I	Y	I	K	G	R	D	N	A	R	T	P	M	Q	W	D	D	Q	N	H	A	G	F	T	T	G	E	P	W	I	T	V	N	P	N	Y	K	E	I	N	V	K	Q	A	I	Q	N	K	D	S	I	F	Y	Y	Y	K	K	L	I	E	L	R	K	.	.	N	N
Template Known Secondary structure			T	S																G	G	G	G	T	S						S	S	T	T	T	T	S		S	S			S	S				G	G	G	G	T	S	S								T	T	S														.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.
Template SS confidence
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.			.	.
		636	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650		.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.
Query SS confidence																	.
Query Sequence		K	A	G	I	W	S	A	F	E	G	V	S	A	T	K	.	N	V	L	A	F	S	R	G	D	S	V	N	I	N	H	S	P	H	D	G	L	V	I	I	N	K	G	N	E	E	V	E	G	T	W	P	N	K	L	Q	P	G	I	Y	K	N	M	G	S	N	S	V	N	I	I	I	N	N	T	R	K	I	I	P
Query Conservation																	.
Alig confidence																	.								.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	I	V	V	Y	G	S	Y	D	L	I	L	E	N	N	P	S	I	F	A	Y	V	R	.	.	.	.	.	.	T	Y	G	V	E	K	L	L	V	I	A	N	F	T	A	E	E	C	I	F	E	L	P	E	D	I	S	Y	S	E	V	E	L	L	I	H	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													S	T	T		S	S							.	.	.	.	.	.			T	T										S	S	S								T	T				S								S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		475	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.							.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.
		715	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	G	K	V	F	T	L	R	G	G	T	L	N	I	N	I	P	G	R	S	A	L	L	L	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	D	V	E	N	G	P	I	E	N	I	T	L	R	P	Y	E	A	M	V	F	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.								S						T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Template SS confidence
						536	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.