Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 28 Aligned Residues 390 % Identity 17% Template c1jdaA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:1,4-alpha maltotetrahydrolase; PDBTitle: maltotetraose-forming exo-amylase Resolution 2.20 Å

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		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.										.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	K	S	Q	C	E	I	I	T	P	K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T	F	R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.
Template Conservation					.																																																												.	.	.
Template Sequence		G	K	S	.	P	N	A	V	R	Y	H	G	G	D	E	I	I	L	Q	G	F	H	W	N	V	V	R	E	A	P	N	D	W	Y	N	I	L	R	Q	Q	A	A	T	I	A	A	D	G	F	S	A	I	W	M	P	V	P	W	R	D	F	S	S	.	.	.	W	S	D	G	S	K	S	G	G	G	E	G	Y	F
Template Known Secondary structure					.	T	T					G	G	G										T	T					S	T	T	T															T	T		S								S						.	.	.	B		S	S	S			B			S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure					.																																																												.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.		.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.				.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	D	Y	P	S	A	D	I	R	A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P
Query Conservation
Alig confidence						.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	H	D	F	.	N	K	N	G	R	Y	G	S	D	A	Q	L	R	Q	A	A	S	A	L	G	G	A	G	V	K	V	L	Y	D	V	V	P	N	H	M	N	R	G	Y	P	D	K	E	I	N	L	P	A	G	Q	G	F	W	R	N	D	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					S	.				S	S	S																T	T									T	T	B			T	T		S	S		S					S	S	S	S		B	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		80	.	.	.		.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.		.	.	.	430	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.
Query SS confidence																																																																											.
Query Sequence		F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	.	K	Y	G	V	R	G
Query Conservation																																																																											.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	P	G	N	Y	P	N	D	C	D	D	G	D	R	F	I	G	G	D	A	D	L	N	T	G	H	P	Q	V	Y	G	M	F	R	D	E	F	T	N	L	R	S	Q	Y	G	A	G	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S	S		B	T	T	B	S	S			S	T	T	S	S	S	B	B		T	T	S																		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																	141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.											.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	R	Y	D	A	A	K	H	S	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	R	F	D	F	V	R	G	Y	A	P	E	R	V	N	S	W	M	T	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	A	D	N	S	F	C	V	G	Q	L	W	K	G	P	S	E	Y	P	N	W	D	W	R	N	T	A	S	W	Q	Q	I	I	K	D	W	S	D	R	A	K
Template Known Secondary structure					S		G	G	G	S												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	S										G	G	G	S		T	T	S	G	G	G	S	S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
		503	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.			.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580
Predicted Secondary structure																																																																.	.
Query SS confidence																																																																.	.
Query Sequence		L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	S	F	G	G	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	I	S	S	I	P	S	E	R	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	F	.	.	N	H	Q	Q	D	E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L
Query Conservation																																																																.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.																																									.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.
Template Sequence		C	P	V	F	D	F	A	L	K	E	R	M	Q	N	G	S	I	.	.	.	.	.	A	D	W	K	H	G	L	N	G	N	P	D	P	R	W	R	E	V	A	V	T	F	V	D	N	H	D	T	G	Y	S	P	G	Q	N	G	G	Q	H	H	W	A	L	Q	D	G	L	I	R	Q	A	Y	A	Y	I	L	T	S
Template Known Secondary structure		S														S		G	.	.	.	.	.	G	G	G	G	G	S	G	G	G		S	S					T	T					S			T	T	T	S			S	S	G	G	G				S	S				G	G	G											S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.						.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
		581	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	T	R	V	G	G	E	A	W	L	N	K	G	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D	K	A	G	I	W	S	A	F	E	G	V	S	A	T	K	N	V	L	A	F	S	R	G	D	S
Query Conservation
Alig confidence			.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template Conservation			.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template Sequence		P	.	G	T	P	V	V	Y	W	D	H	M	Y	D	W	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	D	F	I	R	Q	L	I	Q	V	R	R	.	.	A	A	G	V	R	A	D	S	A	I	S	F	H	S	G	Y	S	G	L	V	A	T	V	S	G	S	Q
Template Known Secondary structure		S	.	S											T	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.			T			T	T							T	T	S	S	S								S	S
Template Predicted Secondary structure			.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Template SS confidence
		326		.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.			.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
		661	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	N	I	N	H	S	P	H	D	G	L	V	I	I	N	K	G	N	E	E	V	E	G	T	W	P	N	K	L	Q	P	G	I	Y	K	N	M	G	S	N	S	V	N	I	I	I	N	N	T	R	K	I	I	P	P	G	K	V	F	T	L	R	G	G	T	L	N	I
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	T	L	.	.	.	.	.	.	.	V	V	A	L	N	S	D	L	G	N	.	.	.	.	.	P	G	Q	V	A	S	G	S	F	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	N	A	S	N	G	Q	V	R	V
Template Known Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.					S						.	.	.	.	.	G	G	G	T			S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		381	.	.								.	.	.	.	.	.	390	.	.	.						.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.