Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 101 Aligned Residues 448 % Identity 14% Template c1iv8A_ PDB info PDB header:isomerase Chain: A: PDB Molecule:maltooligosyl trehalose synthase; PDBTitle: crystal structure of maltooligosyl trehalose synthase Resolution 1.90 Å

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		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T	F	R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L	C	T	I	H	N	P	M	G	D	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I
Query Conservation
Alig confidence														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	F	G	D	V	I	D	N	L	W	Y	F	.	D	L	G	V	S	H	L	Y	L	S	P	V	L	M	A	S	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	N	H	G	Y	D	V	I	D	H	S	R	I	N	D	E	L	G	G	E	K	E	Y	R	R	L	I	E	T	A	H	T	I	G	L	G	I	I
Template Known Secondary structure									T	T	T	T		.																	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S			S									T	T	T	T															T	T
Template Predicted Secondary structure														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.		.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.												.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		306	.	.	.	310	.	.	.	.			.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.
Query SS confidence											.	.
Query Sequence		P	D	Y	T	F	N	F	M	G	.	.	I	G	G	S	G	K	N	D	L	D	Y	P	S	A	D	I	R	A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D	P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D
Query Conservation											.	.
Alig confidence											.	.												.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.
Template Sequence		Q	D	I	V	P	N	H	M	A	V	N	S	L	N	W	R	L	M	D	V	L	M	.	.	.	.	G	S	Y	Y	T	Y	F	D	F	F	P	E	D	D	K	I	R	L	P	I	L	G	E	D	L	D	T	V	I	S	K	G	L	L	K	I	V	K	D	G	D	E	Y	F	L	E	Y	F	K	W	K	L	P	L
Template Known Secondary structure							S						T	T										.	.	.	.				G	G	G	B		B		T	T		S	S							S	S								T	T								S	S							T	T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.					.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.											.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.			.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Query Sequence		N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	K	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D	A	A	K	H	S	.	.	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	E	V	G	N	D	I	Y	D	T	L	Q	K	Q	N	Y	T	L	M	S	W	K	N	P	P	S	Y	R	R	F	F	D	V	N	T	L	I	G	V	N	V	E	D	H	V	F	Q	E	S	H	S	I	L	D	L	D	V	D	G	Y	R	I	D	H	I	D	G	L	Y	D	P	E	K	Y	I	N	D	L	R	S
Template Known Secondary structure		S				S	S						T	T	S	S						T	T	S			S	B				T	T							B											T			T	T	S			S					T	T	G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.							.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	.	.	.	.	.	.	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	I	K	N	I	I	I	V	E	K	I	L	G	F	Q	E	E	L	K	L	N	S	D	G	T	T	G	Y	D	F	L	N	Y	S	N	L	L	F	N	F	N	Q	E	I	M	D	S	I	Y	E	N	F	T	A	E	K	I	S	I	S	E	S	I	K	I	K	A	Q	I	I	D	E	L	F	S	Y	E	V	R	L
Template Known Secondary structure															T	T					S	S	S	S			S	S									G	G	G															T																					S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
							509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	S	L	L	M	K	T	I	K	A	F	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	S	Q	L	G	I	S	Y	D	I	L	R	D	Y	L	S	C	I	D	V	Y	R	T	Y	A	N	Q	I	V	K	E	C	D	K	T	N	E	I	E	E	A	T	K	R	N	P	E	A	Y	T	K	L	Q	Q	Y	M	P	A	V	Y	A	A	Y	E	D	T	F	L	F	R	Y	N	R	L	I	S	I	N	E	V
Template Known Secondary structure						T	S														S	S			S	T	T				G	G	G	T	T	T	S																		T	T								T	T	T	T	G	G	G	T			S	S	G	G	G			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.
								520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	F	G	G	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	I	S	S	I	P	S	E	R	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	F	N	H	Q	Q	D	E	Q	L	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	S	D	L	R	Y	Y	K	I	S	P	D	Q	F	H	V	F	N	Q	K	R	.	.	.	.	R	G	K	I	T	L	N	A	T	S	T	H	D	T	K	F	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	V	R	M	K	I	S	V	L	S	E	F	P	E	E	W	K	N	V	E	E	W	H	S	I	I	N
Template Known Secondary structure		T			T	T																	.	.	.	.	T	T							S			S	S		S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									G	G	G	G	S														S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430					.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.											.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	K	V	S	R	N	D	E	Y	R	Y	Y	Q	V	L	V	G	S	F	Y	E	G	F	S	N	D	F	E	R	I	Q	H	M	I	S	V	R	E	A	I	N	T	S	W	R	N	Q	N	K	E	Y	E	N	R	V	M	E	L	V	E	E	T	F	T	N	K	D	F	I	K	S	F	M	K	F	E	S	I	R	R
Template Known Secondary structure			S	S																	T	T		S		S											T	T	T						S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		477	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.
											574	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	A	Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	T	R	V	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	W	L	N	K	G	C	S	T	Y	Q	Q	L	Y	N	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																							.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.																							.
Template Sequence		I	G	M	I	K	S	L	S	L	V	A	L	K	I	M	S	A	.	G	I	P	D	F	Y	Q	G	T	E	I	W	R	Y	L	L	T	D	P	D	N	R	.	V	P	V	D	F	K	K	L	H	E	I	L	E	K	S	K	F	E	K	N	M	L	E	S	M	D	D	G	R	I	K	M	Y	L	T	Y	L	L	S
Template Known Secondary structure																	S	S	.	S						T	T	T	T	S						S	T	T	G	G	G	.														T					T						G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																			.																							.
Template SS confidence
		562	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.		.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		629	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.		.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.
Query SS confidence																																																																		.
Query Sequence		F	H	A	L	Y	I	D	K	A	G	I	W	S	A	F	E	G	V	S	A	T	K	N	V	L	A	F	S	R	G	D	S	V	N	I	N	H	S	P	H	D	G	L	V	I	I	N	K	G	N	E	E	V	E	G	T	W	P	N	K	L	Q	P	G	.	I	Y	K	N	M	G	S	N	S	V	N	I	I	I	N
Query Conservation																																																																		.
Alig confidence											.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.					.										.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.															.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	R	K	Q	L	A	E	D	F	.	L	K	G	E	Y	K	G	L	D	L	E	E	G	L	C	G	F	I	R	F	N	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	L	V	I	I	K	T	K	G	S	V	N	Y	K	L	K	.	.	.	L	E	E	G	A	I	Y	T	D	V	L	T	G	E	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						T					.			S									T	T							T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S		T	T							.	.	.			S	S						T	T	T			.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure											.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.															.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		642	.	.	.	.	.	.	.	650		.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.										.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.				.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.
		708	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	T	R	K	I	I	P	P	G	K	V	F	T	L	R	G	G	T	L	N	I	N	I	P	G	R	S	A	L	L	L	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	K	K	E	.	.	.	V	Q	I	N	E	L	P	R	I	L	V	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S		.	.	.					S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.
Template SS confidence
														703	.	.	.	.				.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.