Job Description P76616 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:01 GMT 2012 Rank 87 Aligned Residues 431 % Identity 16% Template c1ehaA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glycosyltrehalose trehalohydrolase; PDBTitle: crystal structure of glycosyltrehalose trehalohydrolase2 from sulfolobus solfataricus Resolution 3.00 Å

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		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	I	E	R	G	D	N	S	G	V	Y	Q	Y	G	R	A	E	H	F	T	H	I	I	S	D	K	P	S	P	K	D	K	Y	V	A	Y	A	I	N	I	P	D	Y	E	L	A	A	D	V	Y	N	I	N	V	T	S	P	S	G	Q	Q	E	T	F	K	I	L	I	N	L	E	H	L	R	Q	T	L	E	R	K
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.																													.																												.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.																													.																												.	.	.	.
Template Sequence		T	I	T	L	N	N	V	K	V	R	D	R	Y	K	Y	V	L	.	.	.	D	D	A	S	E	I	P	D	P	A	S	R	Y	Q	P	E	G	V	H	G	P	S	Q	I	I	Q	E	S	.	K	E	F	N	N	E	T	F	L	K	K	E	D	L	I	I	Y	E	I	H	V	G	T	F	T	P	E	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						S	S			S									.	.	.	T	T	S						T	T		S			S	S	S	T	T	S									.					S			S			S	S	S								T	T	T	S	S	S	S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.																													.																												.	.	.	.
Template SS confidence
		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60				.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.		.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
		198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	L	T	A	V	Q	K	S	Q	C	E	I	I	T	P	K	K	P	G	E	A	I	L	H	A	F	N	A	T	Y	Q	Q	I	R	E	N	M	S	E	F	A	R	C	H	Y	G	Y	I	Q	I	P	P	V	T	T	F	R	A	D	G	P	E	T	P	E	E	E	K	G	Y	W	F	H	A	Y	Q	P	E	D	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	F	E	G	V	I	R	K	L	D	Y	L	K	D	L	G	I	T	A	I	E	I	M	P	I	A	Q	F	P	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	W	G	Y	D	G	V	Y	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S							T								T										B			S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	T	T				T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																													116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.												.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	T	I	H	N	P	M	G	D	L	Q	D	F	I	A	L	V	K	D	A	K	K	F	G	I	D	I	I	P	D	Y	T	F	N	F	M	G	I	G	G	S	G	K	N	D	L	D	Y	P	S	A	D	I	R	A	K	I	S	K	D	I	E	G	G	I	P	G	Y	W	Q	G	Q	V	L	I	P	F	I	K	D
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Sequence		Y	A	V	Q	N	S	Y	G	G	P	E	G	F	R	K	L	V	D	E	A	H	K	K	G	L	G	V	I	L	D	V	V	Y	N	H	V	G	P	E	G	N	Y	M	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	P	Y	F	S	Q	K	Y	K	T	P	W	G	.	.
Template Known Secondary structure		T	S	B		S	T	T																	T										S				S	S	S			S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S			S		S	S				S	S	S	.	.
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.		.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.
Query SS confidence																																																																							.
Query Sequence		P	V	T	K	E	R	K	Q	I	H	P	E	D	I	H	L	T	A	K	D	F	E	A	S	K	D	N	I	S	K	D	E	W	E	N	L	H	A	L	K	E	K	R	L	N	G	M	P	K	T	T	P	K	S	D	Q	V	I	M	L	Q	N	Q	Y	V	R	E	M	R	.	K	Y	G	V	R	G	L	R	Y	D
Query Conservation																																																																							.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	F	N	F	D	D	A	E	S	D	E	V	R	K	F	I	L	E	N	V	E	Y	W	I	K	E	Y	N	V	D	G	F	R	L	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	S	S	T	T	T	T	T																S								T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																														217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	A	K	H	S	K	H	E	Q	I	E	R	S	I	T	P	P	L	K	N	Y	N	E	R	L	H	N	T	N	L	F	N	P	K	Y	H	K	K	A	V	M	N	Y	M	E	Y	L	V	T	C	Q	L	D	E	Q	Q	M	S	S	L	L	Y	E	R	D	D	L	S	A	I	D	F	S	L	L	M	K	T	I	K
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Sequence		A	V	H	A	I	I	D	T	S	P	K	H	I	L	E	E	I	A	D	V	V	H	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	N	R	I	V	I	A	E	S	D	L	N	D	P	R	V	V	N	P	K	E	K	.	.	V	G	Y	N	I	D	A	Q	W	V	D	D	F	H	H	S	I	H	A
Template Known Secondary structure		T	G	G	G					S	S	S													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T									S			T	T	T	T			T	T	T	.	.	T					S
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template SS confidence
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.															.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.			.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
		517	.	.	520	.	.									.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.		.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.
Query Sequence		A	F	S	F	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	Q	T	L	A	S	K	P	G	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	S	S	I	P	S	E	R	R	I	L	I	N	I	N	H	D	F	P	N	N	G	N	L	F	N	D	F	L	.	F	N	H	Q	Q	D
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.
Template Conservation
Template Sequence		Y	L	T	G	E	R	Q	G	Y	Y	T	D	F	G	N	L	D	D	I	V	K	S	Y	K	D	V	F	V	Y	D	G	K	Y	S	N	F	R	R	K	T	H	G	E	P	V	G	E	L	D	G	C	N	F	V	V	Y	I	Q	N	H	D	Q	V	G	N	R	G	K	G	E	R	I	I	K	L	V	D	R	E	S
Template Known Secondary structure				S				S	G	G	G	G	G													S	S		S							T	T	T	T									S			G	G	G					S								T	T	S	S				S	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
		570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	Q	L	A	M	A	Y	I	A	A	L	P	F	S	R	P	L	V	Y	W	D	G	Q	V	L	K	S	T	T	E	I	K	N	Y	D	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	V	G	G	E	A	W	L	N	K	G	C	S	T
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.
Template Sequence		Y	K	I	A	A	A	L	Y	L	L	S	P	.	Y	I	P	M	I	F	M	G	E	E	Y	G	E	E	N	P	F	Y	F	F	S	D	F	S	D	S	K	L	I	Q	G	V	R	E	G	R	K	K	E	N	G	Q	D	T	D	P	Q	D	E	S	T	F	N	A	S	K	L	S	W	K	I	D	E	E	I	F	S
Template Known Secondary structure											T	S	S	.	S						T	T	G	G	G	T													S	T	T																	S		T	T	S						T	T	S
Template Predicted Secondary structure														.
Template SS confidence
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.		.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
		622	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	Q	Q	L	Y	N	E	F	H	A	L	Y	I	D	K	A	G	I	W	S	A	F	E	G	V	S	A	T	K	N	V	L	A	F	S	R	G	D	S	V	N	I	N	H	S	P	H	D	G	L	V	I	I	N	K	G	N	E	E	V	E	G	T	W	P	N	K	L
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	Y	K	I	L	I	K	M	R	K	E	L	.	.	.	S	I	A	C	D	R	R	V	N	V	V	N	G	E	N	W	L	I	I	K	G	R	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	S	L	Y	V	F	S	K	S	S	I	E	V	K	Y	S	G	T	L
Template Known Secondary structure														.	.	.	T		S	S										S	S							S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	S	S										B
Template Predicted Secondary structure														.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		476	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.				.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.											.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530