Job Description P25527 Confidence 99.51% Date Thu Jan 5 11:41:58 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 436 % Identity 10% Template c2xq2A_ PDB info PDB header:transport protein Chain: A: PDB Molecule:sodium/glucose cotransporter; PDBTitle: structure of the k294a mutant of vsglt Resolution 2.73 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	G	L	K	S	R	H	V	T	M	L	S	I	A	G	V	I	G	A	S	L	F	V	G	S	S	V	A	I	A	E	A	G	P	A	V	L	L	A	Y	L	F	A	G	L	L	V	V	M	I	M	R	M	L	A	E	M	A	V	A	T	P	D	T	G	S	F	S	T	Y	A	D	K	A	I	G	R	W	A	G
Query Conservation
Alig confidence																																																															.
Template Conservation																																																															.
Template Sequence		V	S	L	P	W	W	A	V	G	A	S	L	I	A	A	N	I	S	A	E	Q	F	I	G	M	S	G	S	G	Y	S	I	G	L	A	I	A	S	Y	E	W	M	S	A	I	T	L	I	I	V	G	K	Y	F	L	P	I	F	I	E	K	.	G	I	Y	T	I	P	E	F	V	E	K	R	F	N	K	K	L	K
Template Known Secondary structure															G	G	G	S	S														T		G	G	G	G																T								T	.	T			S									T
Template Predicted Secondary structure																																																															.
Template SS confidence
		30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90		.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.		.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
Predicted Secondary structure																.
Query SS confidence																.
Query Sequence		Y	T	I	G	W	L	Y	W	W	F	W	V	L	V	.	I	P	L	E	A	N	I	A	A	M	I	L	H	S	W	V	P	G	I	P	I	W	L	F	S	L	V	I	T	L	A	L	T	G	S	N	L	L	S	V	K	N	Y	G	E	F	E	F	W	L	A	L	C	K	V	I	A	I	L	A	F	I	F	L	G
Query Conservation																.
Alig confidence																.
Template Conservation
Template Sequence		T	I	L	A	V	F	W	I	S	L	Y	I	F	V	N	L	T	S	V	L	Y	L	G	G	L	A	L	E	T	I	L	G	I	P	L	M	Y	S	I	L	G	L	A	L	F	A	L	V	Y	S	I	Y	G	G	V	V	W	T	D	V	I	Q	V	F	F	L	V	L	G	G	F	M	T	T	Y	M	A	V	S	F
Template Known Secondary structure															T																																						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		171	.	.	.	.	.	.	.										.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	V	A	I	S	G	F	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Y	A	E	V	S	G	I	S	R	L	W	D	S	G	G	F	M	P	N	G	F	G	A	V	L	S	A	M	L	I	T	M	F	S	F	M	G	A	E	I	V	T	I	A	A	A	E	S	D	T	P	E	K	H	I	V	R	A	T	N	S	V
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	G	G	T	D	G	W	F	A	G	V	S	K	M	V	D	A	A	P	G	H	F	E	M	I	L	D	Q	S	N	P	Q	Y	M	N	L	P	G	I	A	V	L	I	G	G	L	W	V	A	N	L	Y	Y	W	G	F	N	Q	Y	I	I	Q	R	T	L	A	A	K	S	V	S	E	A	Q	K	G	I	V	F	A
Template Known Secondary structure				G	G	G														G	G	G	S		S	S			S	S	S	G	G	G	G	T	S		T	T					S	T										T	T	T		S							T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.												.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	W	R	I	S	I	F	Y	L	C	S	I	F	V	V	V	A	L	I	P	W	N	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	L	K	A	V	G	S	Y	R	S	V	L	E	L	L	N	I	P	H	A	K	L	I	M	D	C	V	I	L	L	S	V	T	S	C	L	N	S	A	L	Y	T	A	S	R
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	F	L	A	L	I	V	P	F	L	V	V	L	P	G	I	A	A	Y	V	I	T	S	D	P	Q	L	M	A	S	L	G	N	L	P	S	A	A	N	A	D	K	A	Y	P	W	L	T	Q	F	L	P	V	G	V	K	G	V	V	F	A	A	L	A	A	A	I	V	S	S	L	A	S	M	L	N	S	T	A	T
Template Known Secondary structure					T	T	T						T											T														S	T	B	G	G	G								T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.			.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.
Query SS confidence																																														.	.
Query Sequence		M	L	Y	S	L	S	R	R	G	D	A	P	A	V	M	G	K	I	N	R	S	K	T	P	Y	V	A	V	L	L	S	T	G	A	A	F	L	T	V	V	V	N	Y	Y	.	.	A	P	A	K	V	F	K	F	L	I	D	S	S	G	A	I	A	L	L	V	Y	L	V	I	A	V	S	Q	L	R	M	R	K	I
Query Conservation																																														.	.
Alig confidence			.	.	.																																									.	.
Template Conservation			.	.	.
Template Sequence		I	.	.	.	F	T	M	D	I	Y	K	E	Y	I	S	P	D	S	G	D	H	K	L	V	N	V	G	R	T	A	A	V	V	A	L	I	I	A	A	L	I	A	P	M	L	G	G	I	G	Q	C	F	Q	Y	I	Q	E	Y	T	G	L	V	S	P	G	I	L	A	V	F	L	L	G	L	F	W	K	K	T	T
Template Known Secondary structure			.	.	.					T					T		S																										G	G	G	G	G	G		B											T	T	T															T	T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.
Template SS confidence
		376				.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	A	E	G	S	E	I	R	L	R	M	W	L	Y	P	W	L	T	W	L	V	I	G	F	I	T	F	V	L	V	V	M	L	F	R	P	A	Q	Q	L	E	V	I	S	T	G	L	L	A	I	G	I	I	C	T	V	P	I	M	A	R	W	K	K	L	V	L	W	Q	K	T	P	V	H	N	T	R
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	I	I	G	V	V	A	S	I	P	F	A	L	F	L	K	F	M	P	L	S	M	P	F	M	D	Q	M	L	Y	T	L	L	F	T	M	V	V	I	A	F	T	S	L	S	T	S	I	N	D	D	D	P	K	G	I	S	V	T	S
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			S	S																													S	S	S	S		T	T						S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		453	.																.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.