Job Description P32674 Confidence 99.45% Date Thu Jan 5 11:50:01 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 384 % Identity 17% Template c1hk8A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:anaerobic ribonucleotide-triphosphate reductase; PDBTitle: structural basis for allosteric substrate specificity2 regulation in class iii ribonucleotide reductases:3 nrdd in complex with dgtp Resolution 2.45 Å

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		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	K	P	Q	T	F	W	Q	A	C	Q	L	F	W	Y	M	N	I	I	L	Q	Y	E	S	N	A	S	S	L	S	L	G	R	F	D	Q	Y	M	L	P	F	Y	Q	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	Q	G	E	D	A	A	F	L	K	E	L	L	E	S	L
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.
Template Sequence		E	T	P	K	S	I	G	V	A	T	A	I	M	A	Q	I	T	A	Q	V	A	S	H	Q	Y	G	G	.	T	T	F	A	N	V	D	K	V	L	S	P	Y	V	K	R	T	Y	A	K	H	I	E	D	A	E	K	W	Q	I	A	D	A	L	N	Y	A	Q	S	K	T	E	K	D	V	Y	D	A	F	Q	A	Y
Template Known Secondary structure					S	S																	T	T	S	S	S		.				T	T																							T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure																													.
Template SS confidence
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.		.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.						.	.	.	.	.		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.						.														.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.	.						.														.	.
Query Sequence		W	V	K	C	N	D	I	V	L	L	R	S	T	S	S	A	R	Y	F	A	G	F	P	T	G	Y	T	A	L	L	G	G	L	T	E	N	G	R	S	A	V	N	V	L	S	F	L	C	L	D	A	Y	Q	S	.	.	.	.	.	V	Q	L	P	Q	.	P	N	L	G	V	R	T	N	A	L	I	D	T	.	.
Query Conservation																																																								.	.	.	.	.						.														.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.																					.	.	.	.	.						.														.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.
Template Sequence		E	Y	E	V	N	T	L	F	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	Q	T	P	F	V	T	I	T	F	G	.	.	.	T	G	T	D	W	T	E	R	M	I	Q	K	A	I	L	K	N	R	I	K	G	L	G	R	D	G	I	T	P	I	F	P	K	L	V	M	F	V	E	E	G	V	N	L	Y	K
Template Known Secondary structure											T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	S										.	.	.				S																		B	T	T	T	T	B			S		S								T	T	T	T	S	S	T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.
Template SS confidence
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.										.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200				.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
							373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420												.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	P	F	L	M	K	T	A	E	T	I	R	F	G	T	G	I	P	Q	I	F	N	D	E	V	V	V	P	A	F	L	N	R	G	V	S	L	E	D	A	R	D	Y	S	V	V	G	C	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	S	I	P	G	R	T	Y	G	L	H	D	I	A	M
Query Conservation		.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.													.																					.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.
Template Conservation																			.																					.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template Sequence		D	D	P	N	Y	D	I	K	Q	L	A	L	E	C	A	S	K	.	R	M	Y	P	D	I	I	S	A	K	N	N	K	A	I	T	G	S	S	V	.	.	.	.	.	.	.	P	V	S	P	M	G	C	R	S	F	L	S	V	W	K	D	S	T	G	N	E	I	L	D	G	.	.	R	N	N	L	G	V	V	T
Template Known Secondary structure		T	S	T	T														.																	T		S	S	.	.	.	.	.	.	.					B	T	T	T	B						B		T	T	S		B			T	T	.	.		B
Template Predicted Secondary structure																			.																					.	.	.	.	.	.	.																										.	.
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.		.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.								.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.			.	310	.	.	.	.	.	.
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.			.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.																																																																				.
Query SS confidence												.	.																																																																				.
Query Sequence		F	N	L	L	K	V	M	E	I	C	.	.	L	H	E	N	E	G	N	A	A	L	T	Y	E	G	L	L	E	Q	I	R	A	K	I	S	H	Y	I	T	L	M	V	E	G	S	N	I	C	D	I	G	H	R	D	W	A	P	V	P	L	L	S	S	F	I	S	D	C	L	E	K	G	R	D	I	T	D	G	.
Query Conservation												.	.																																																																				.
Alig confidence												.	.							.	.	.	.	.	.																																																								.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	N	L	P	R	I	A	L	D	S	Y	I	G	T	Q	F	N	E	.	.	.	.	.	.	Q	K	F	V	E	L	F	N	E	R	M	D	L	C	F	E	A	L	M	C	R	I	S	S	L	K	G	V	K	A	T	V	A	P	I	L	Y	Q	E	G	A	F	G	V	R	L	K	P	D	D	D	I	I	E	L	F
Template Known Secondary structure										T	T			T	T					.	.	.	.	.	.																									T	T	T		B	G	G	G						T	S	S	T	T	S	S				T	T	S	B	T
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.							.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
		514	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	A	R	Y	N	F	S	G	V	Q	G	I	G	I	A	N	L	S	D	S	L	H	A	L	K	G	M	V	F	E	Q	Q	R	L	S	F	D	E	L	L	S	V	L	K	A	N	F	A	T	P	E	G	E	K	V	R	A	R	L	I	N	R	F	E	K	Y	G	N	D	I	D	E	V	D	N	I	S	A	E	L
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	N	G	R	S	S	V	S	L	G	Y	I	G	I	H	E	L	N	I	L	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	D	.	.	.	.	.	.	I	G	R	E	I
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	S																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S		.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.																																														.	.	.							.	.	.	.	.
		594	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.										.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	R	H	Y	C	K	E	V	E	K	Y	Q	N	P	R	G	G	Y	F	T	P	G	S	Y	T	V	S	A	H	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	G	S	V	V	G	A	T	P	D	G	R	F	A	G	E	Q	L	A	D	G	G	L	S	P	M	L	G	Q	D	A	Q	G	P	T	A	V	L	K	S
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.					.		.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.					.		.
Template Sequence		L	T	K	M	N	A	H	L	K	Q	W	T	E	R	T	G	F	A	F	S	L	Y	S	T	P	A	E	N	L	C	Y	R	F	C	K	L	D	T	E	K	Y	G	S	V	K	D	V	T	D	K	G	.	.	.	.	.	W	Y	T	N	.	S	.	F	H	V	S	V	E	E	N	I	T	P	F	E	K	I	S	R
Template Known Secondary structure																	S											T	T																	T	T	T	T	T	T	S	.	.	.	.	.					.	T	.	T				T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.					.		.
Template SS confidence
		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470						.	.	.	.		.		.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
		665	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	S	K	L	D	N	T	L	L	S	N	G	T	L	L	N	V	K	F	T	P	A	T	L	E	G	E	A	G	L	R	K	L	A	D	F	L	R	A	F	T	Q	L	K	L	Q	H	I	Q	F	N
Query Conservation
Alig confidence						.																			.	.	.	.																.
Template Conservation						.																			.	.	.	.																.
Template Sequence		E	A	P	Y	.	H	F	I	A	T	G	G	H	I	S	Y	V	E	L	P	D	M	K	.	.	.	.	N	N	L	K	G	L	E	A	V	W	D	Y	A	A	Q	.	H	L	D	Y	F	G	V	N
Template Known Secondary structure						.		T	T		T	T	B											T	.	.	.	.	T															.			S
Template Predicted Secondary structure						.																			.	.	.	.																.
Template SS confidence
		493	.	.	.		.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.					.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.		530	.	.	.	.	.	.	.