Job Description P23908 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:40:32 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 337 % Identity 23% Template c2qyvB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:xaa-his dipeptidase; PDBTitle: crystal structure of putative xaa-his dipeptidase (yp_718209.1) from2 haemophilus somnus 129pt at 2.11 a resolution Resolution 2.11 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.						.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.	.	.
Query Sequence		P	P	F	I	E	I	Y	R	A	L	I	A	T	P	S	I	S	A	T	E	E	A	L	D	Q	S	N	A	D	L	I	T	L	L	A	D	W	F	K	D	L	G	F	N	V	E	V	Q	P	V	P	G	T	R	N	K	F	N	M	L	A	S	I	G	Q	G	A	.	.	.	.	.	G	G	L	L	L	A	G	H
Query Conservation																																																																					.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	L	L	W	Q	W	F	D	Q	I	C	A	I	P	H	P	S	Y	K	E	.	.	.	.	.	.	.	E	Q	L	A	Q	F	I	I	N	W	A	K	T	K	G	F	F	A	E	R	D	E	V	.	.	.	.	.	.	G	N	V	L	I	R	K	P	A	T	V	G	X	E	N	R	K	P	V	V	L	Q	A	H
Template Known Secondary structure														S			B	T	T			.	.	.	.	.	.	.														T	T							T	T	.	.	.	.	.	.											T	T		T	T	B
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.								30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.							.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130		.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.
Query SS confidence																																																				.
Query Sequence		T	D	T	V	P	F	D	D	G	R	W	T	R	D	P	F	T	L	T	E	H	D	G	K	L	Y	G	L	G	T	A	D	M	K	G	F	F	A	F	I	L	D	A	L	R	D	V	D	V	T	.	K	L	K	K	P	L	Y	I	L	A	T	A	D	E	E	T	S	M	A	G	A	R	Y	F	A	E	T	T	A
Query Conservation																																																				.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.																																						.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	D	X	V	P	Q	Q	.	.	.	.	.	.	D	P	I	L	P	Y	I	D	G	D	W	V	K	A	K	G	T	T	L	G	A	D	N	G	I	G	X	A	S	A	L	A	V	L	E	S	N	D	I	A	H	P	E	L	E	V	L	L	T	X	T	E	E	R	G	X	E	G	A	I	G	L	R	P	N	W	L
Template Known Secondary structure		S		B					.	.	.	.	.	.									S	S					T	T	B																				S	S				S	S							S		T	T	T	T						T			S	S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.							.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.																			.	.	.	.	.	.	.			.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Query Sequence		L	R	P	D	C	A	I	I	G	E	P	T	S	L	Q	P	V	R	A	H	K	G	H	I	S	N	A	I	R	I	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	S	G	H	S	S	D	.	.	P	A	R	G	V	N	A	I	E	L	M	H	D	A	I	G	H	I	L	Q	L
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.																					.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		R	S	E	I	L	I	N	T	D	T	E	E	N	G	E	I	Y	I	G	C	A	G	G	E	N	A	D	L	E	L	P	I	E	Y	Q	V	N	N	F	E	H	C	Y	Q	V	V	L	K	G	L	R	G	G	H	S	G	V	D	I	H	T	G	R	A	N	A	I	K	V	L	L	R	F	L	A	E	L	Q	Q	.
Template Known Secondary structure				S										T	T																										S														B	T	T	T	T	T	T	S	S																		.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	D	N	L	K	E	R	Y	H	Y	E	A	F	T	V	P	Y	P	T	L	N	L	G	H	I	H	G	G	D	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Q	P	H	F	D	F	T	L	A	N	I	R	G	G	S	I	R	N	A	I	P	R	E	S	V	A	T	L	V	F	N	G	D	I	T	V	L	Q	S	A	V	Q	K	F	A	D	V	I	K	A	E	L	A	L	T	E	P	N	L	I	F	T	L	E	K	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T												S		T	T	B													S																					T	T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
																																																251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	R	I	C	A	C	C	E	L	H	M	D	I	R	P	L	P	G	M	T	L	N	E	L	N	G	L	L	N	D	A	L	A	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		E	K	P	Q	Q	V	F	S	S	Q	C	T	K	N	I	I	H	C	L	N	V	L	P	N	G	V	V	R	N	S	D	V	I	E	N	V	V	E	T	S	L	S	I	G	V	L	K	T	E	D	N	F	V	R	S	T	X	L	V	R	S	L	I	E	S	G	K	S	Y	V	A	S	L	L	K	S	L	.	.	.
Template Known Secondary structure					S																											S	S	S	T	T															T	T											S	S															.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.		.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.			.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.				340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.																														.	.													.	.	.
Query SS confidence																.																														.	.													.	.	.
Query Sequence		V	S	E	R	W	P	G	R	L	T	V	D	E	L	.	H	P	P	I	P	G	Y	E	C	P	P	N	H	Q	L	V	E	V	V	E	K	L	L	G	A	K	T	E	V	.	.	V	N	Y	C	T	E	A	P	F	I	Q	T	.	.	.	L	C	P	T	L	V	L	G	P	G	S	I	N	Q	A	H	Q	P	D
Query Conservation																.																														.	.													.	.	.
Alig confidence		.														.																														.	.													.	.	.											.
Template Conservation		.																																																																							.
Template Sequence		.	A	S	L	A	Q	G	N	I	N	L	S	G	D	Y	P	G	W	E	P	Q	S	H	S	D	I	L	D	L	T	K	T	I	Y	A	Q	V	L	G	T	D	P	E	I	K	V	I	H	A	G	L	E	C	G	L	L	K	K	I	Y	P	T	I	D	X	V	S	I	G	P	T	.	I	R	N	A	H	S	P	D
Template Known Secondary structure		.				T	T												B				S																	S	S								S	S			T									T	T	S									.			S	T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.																																																																							.
Template SS confidence
			384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.		.	.	.	.	.	.	460	.
		359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Y	L	E	T	R	F	I	K	P	T	R	E	L	I	T	Q	V	I	H	H	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	K	V	H	I	P	A	V	E	T	Y	W	K	V	L	T	G	I	L	A	H	I
Template Known Secondary structure																						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.