Job Description P33225 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:51:24 GMT 2012 Rank 28 Aligned Residues 410 % Identity 14% Template d2fug32 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 3.30

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		45	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.					.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.
Query Sequence		D	A	V	I	S	K	E	G	I	L	T	G	S	H	W	G	A	I	R	A	T	V	K	D	G	R	F	V	A	A	K	P	F	E	L	D	K	Y	P	.	.	.	.	S	K	M	I	A	G	L	P	D	H	V	H	N	A	A	R	I	R	Y	P	M	V	R	V	D	W	L	R	K	R	H	L	S	D	T	S	Q
Query Conservation																																									.	.	.	.
Alig confidence																																									.	.	.	.											.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	M	E	E	T	P	T	T	C	A	L	C	P	V	G	C	G	I	T	A	D	T	R	S	G	E	L	L	R	I	R	A	R	E	V	P	E	V	N	E	I	W	I	C	D	A	G	R	F	G	H	E	W	.	A	D	Q	N	R	L	K	T	P	L	V	R	K	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S									S	S	T	T										T	T											T	T	S	S		S									T	T			.			S	S				S						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																							.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	G	D	N	R	F	V	R	V	S	W	D	E	A	L	D	M	F	Y	E	E	L	E	R	V	Q	K	T	H	G	P	S	A	L	L	T	A	S	G	W	Q	S	T	G	M	F	H	N	A	S	G	M	L	A	K	A	I	A	L	H	G	N	S	V	G	T	G	G	D	Y	S	T	G	A	A	Q	V	I	L	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.																							.	.	.	.															.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																							.	.	.	.															.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	G	R	L	V	E	A	T	W	E	E	A	F	L	A	L	K	E	G	L	K	E	A	.	.	.	.	R	G	E	E	V	G	L	Y	L	A	H	D	A	T	.	.	.	L	E	E	G	L	L	A	S	E	L	A	K	A	L	K	T	.	.	.	.	.	P	H	L	D	F	Q	G	R	T	A	A	P	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	S	S																		T	T	S	.	.	.	.	S	S	S	S							T	T			.	.	.														S	S	S	.	.	.	.	.						T	T			S	S		G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																							.	.	.	.															.	.	.																	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.					.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350				.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.						.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	V	V	G	S	M	E	V	Y	E	Q	Q	T	S	W	P	L	V	L	Q	N	S	K	T	I	V	L	W	G	S	D	L	L	K	N	Q	Q	A	N	W	W	C	P	D	H	D	V	Y	E	Y	Y	A	Q	L	K	A	K	V	A	A	G	E	I	E	V	I	S	I	D	P	V	V	T	S	T	H	E	Y	L	G
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template Sequence		S	L	F	P	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	S	L	E	D	L	L	Q	A	D	F	A	L	V	L	G	D	P	T	E	E	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	I	L	H	L	R	L	S	E	F	V	R	D	L	K	P	P	H	R	Y	N	H	G	.	.	.	.	T
Template Known Secondary structure		G	G	S		.	.	.	.	.	.	.	.	B										S						S						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T	T							B	T	T	B	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.
Template SS confidence
		380	.	.	.									.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.					430
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.		.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.
Query SS confidence																													.
Query Sequence		R	E	H	V	K	H	I	A	V	N	P	Q	T	D	V	P	L	Q	L	A	L	A	H	T	L	Y	S	.	E	N	L	Y	D	K	N	F	L	A	N	Y	C	V	G	F	E	Q	F	L	P	Y	L	L	G	E	K	D	G	Q	P	K	D	A	A	W	A	E	K	L	T	G	I	D	A	E	T	I	R	G	L	A
Query Conservation																													.
Alig confidence																													.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	F	A	D	L	Q	I	K	E	R	M	P	R	R	T	D	K	M	A	L	F	A	P	Y	R	A	P	L	M	K	W	A	A	I	H	E	V	H	R	P	G	E	E	R	E	I	L	L	A	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	K	E	G	S	E	M	V	A	K	A	K
Template Known Secondary structure			S			T	T			S	S					G	G	G						S	S			G	G	G	T	T		S							T	T											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
		360	.	.	.	.	.	.		.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.
Query SS confidence									.
Query Sequence		R	Q	M	A	A	N	R	.	T	Q	I	I	A	G	W	C	V	Q	R	M	Q	H	G	E	Q	W	A	W	M	I	V	V	L	A	A	M	L	G	Q	I	G	L	P	G	G	G	F	G	F	G	W	H	Y	N	G	A	G	T	P	G	R	K	G	V	I	L	S	G	F	S	G	S	T	S	I	P	P	V	H	D
Query Conservation									.
Alig confidence									.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	A	W	E	K	A	K	N	P	V	L	I	L	G	A	G	V	L	Q	D	T	V	A	A	E	R	A	R	L	L	A	E	R	A	K	V	L	A	M	T	P	A	A	N	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								S	S							S	G	G	G																							S	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		495	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	S	D	Y	K	G	Y	S	S	T	I	P	I	A	R	F	I	D	A	I	L	E	P	G	K	V	I	N	W	N	G	K	S	V	K	L	P	P	L	K	M	C	I	F	A	G	T	N	P	F	H	R	H	Q	Q	I	N	R	I	I	E	G	L	R	K	L	E	T	V	I	A	I	D	N	Q	W	T	S	T	C
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	G	L	E	A	M	G	V	L	P	G	A	K	G	A	S	W	D	E	P	G	A	L	Y	A	Y	Y	G	F	V	P	P	E	E	A	L	K	G	K	R	F	V	V	M	H	L	S	H	L	H	P	L	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	T		S			S	S	S			T	T					S	S				S	S								T	T		S							S	S			T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																													542	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.
			519	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	R	F	A	D	I	V	L	P	A	T	T	Q	F	E	R	N	D	L	D	Q	Y	G	N	H	S	N	R	G	I	I	A	M	K	Q	V	V	P	P	Q	F	E	A	R	N	D	F	D	I	F	R	E	L	C	R	R	F	N	R	E	E	A	F	T	E	G	L	D	E	M	G	W	L	K	R
Query Conservation		.
Alig confidence		.																	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.
Template Sequence		E	R	Y	A	H	V	V	L	P	A	P	T	F	Y	E	K	R	.	.	.	G	H	L	V	N	L	E	G	R	V	L	P	L	S	P	A	P	I	E	N	G	E	A	E	G	A	L	Q	V	L	A	L	L	A	E	A	L	G	V	R	P	P	F	R	L	H	L	E	A	Q	K	A	L	K	A
Template Known Secondary structure						S								G	G	G			.	.	.						T	T	S	B																													S				S		S	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.
Template SS confidence
		595	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.				.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.