Job Description P33225 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:51:24 GMT 2012 Rank 21 Aligned Residues 632 % Identity 16% Template d1kqfa2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 1.60

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.								.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.					.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Query Sequence		T	D	A	V	I	S	K	E	G	I	L	T	G	S	H	W	G	A	I	R	A	T	V	.	.	.	.	.	.	.	K	D	G	R	F	V	A	A	K	P	F	E	L	D	K	Y	P	.	.	.	.	S	K	M	I	A	G	L	P	D	H	V	H	N	A	A	R	I	R	Y	P	M	V	R	V	D	W	L	R	K
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.																									.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Template Sequence		L	R	A	K	E	I	R	N	T	C	T	Y	C	S	V	G	C	G	L	L	M	Y	S	L	G	D	G	A	K	N	A	R	E	A	I	Y	H	I	E	G	D	P	D	H	P	V	S	R	G	A	L	C	P	K	G	A	G	L	L	D	Y	V	N	S	E	N	R	L	R	Y	P	E	Y	R	A	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	S								S	S	B	T	T										S		S		T	T	S											T	T		T	T	T	T	T								T	T					T		T	T	B			S						.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		41	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
		113	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.													.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	H	L	S	D	T	S	Q	R	G	D	N	R	F	V	R	V	S	W	D	E	A	L	D	M	F	Y	E	E	L	E	R	V	Q	K	T	H	G	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	A	L	L	T	A	S	G	W	Q	S	T	G	M	F	H	N	A	S	G	M	L	A	K	A	I	A	L	H
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	S	D	K	W	Q	R	I	S	W	E	E	A	F	S	R	I	A	K	L	M	K	A	D	R	D	A	N	F	I	E	K	N	E	Q	G	V	T	V	N	R	W	L	S	T	G	M	L	C	A	S	G	A	S	.	.	.	N	E	T	G	M	L	T	Q	K	F	A	R	S	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		S	S																														T	T	S						B		S							T	T	S		.	.	.														T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.	.
Template SS confidence
										116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170				.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.
		181	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	N	S	V	G	T	G	G	D	Y	S	T	G	A	A	Q	V	I	L	P	R	V	V	G	S	M	E	V	Y	E	Q	Q	T	S	W	P	L	V	L	Q	N	S	K	T	I	V	L	W	G	S	D	L	L	K	N	Q	Q	A	N	W	W	C	P	D	H	D	V	Y	E	Y	Y	A	Q	L	K	A	K	V	A	A
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	M	L	A	V	D	N	Q	A	R	V	H	G	P	T	V	A	S	L	A	P	T	F	G	R	.	.	.	.	G	A	M	T	N	H	W	V	D	I	K	N	A	N	V	V	M	V	M	G	G	N	A	A	E	A	H	P	V	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	W	A	M	E	A	K	N
Template Known Secondary structure		T	B						G	G	G														S		.	.	.	.		S		S	S		T	G	G	G	G	G		S						S							S	T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		185	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.					210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240													.	.	.	.	.	.	.	.
		261		.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure			.																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	.	E	I	E	V	I	S	I	D	P	V	V	T	S	T	H	E	Y	L	G	R	E	H	V	K	H	I	A	V	N	P	Q	T	D	V	P	L	Q	L	A	L	A	H	T	L	Y	S	E	N	L	Y	D	K	N	F	L	A	N	Y	C	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation			.																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.															.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.
Template Sequence		N	N	D	A	T	L	I	V	V	D	P	R	F	T	R	T	.	.	.	.	A	S	V	A	D	I	Y	A	P	I	R	S	G	T	D	I	T	F	L	S	G	V	L	R	Y	L	I	E	N	N	K	I	N	A	E	Y	V	K	H	Y	T	N	A	S	L	L	V	R	D	D	F	A	F	E	D	G	L	F	S	G
Template Known Secondary structure			S									S	S					.	.	.	.			T		S							T	T																T	T		S									B	S	T	T	B	B	B		T	T					T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.
Template SS confidence
		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.					.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
																																					323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	E	Q	F	L	P	Y	L	L	G	E	K	D	G	Q	P	K	D	A	A	W	A	E	K	L	T	G	I	D	A	E	T	I	R	G	L	A	R	Q	M	A	A	N	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.																														.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	D	A	E	K	R	Q	Y	D	K	S	S	W	N	Y	Q	L	D	E	N	G	Y	A	K	R	D	E	T	L	T	H	P	R	C	V	W	N	L	L	K	E	H	V	.	.	.	.	.	.	S	R	Y	T	P	D	V	V	E	N	I	C	G	T	P	K	A	D	F	L	K	V	C	E	V	L	A	S	T	S	A
Template Known Secondary structure				T	T	T	T					T	T	S	S	B		B		T	T	S	S	B		B		T	T	S		S	T	T	B										.	.	.	.	.	.	T	T																										G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.							.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
					366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.
Query SS confidence		.	.	.
Query Sequence		.	.	.	R	T	Q	I	I	A	G	W	C	V	Q	R	M	Q	H	G	E	Q	W	A	W	M	I	V	V	L	A	A	M	L	G	Q	I	G	L	P	G	G	G	F	G	F	G	W	H	Y	N	G	A	G	T	P	G	R	K	G	V	I	L	S	G	F	S	G	S	T	S	I	P	P	V	H	D	N	S	D	Y
Query Conservation		.	.	.
Alig confidence		.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	D	R	T	T	T	F	L	Y	A	L	G	W	T	Q	H	T	V	G	A	Q	N	I	R	T	M	A	M	I	Q	L	L	L	G	N	M	G	M	A	G	G	G	V	N	A	L	R	G	H	S	N	I	Q	G	L	T	D	L	G	L	L	S	T	S	L	P	G	Y	L	T	L	P	S	E	K	Q	V	D	L	Q
Template Known Secondary structure		T	T								S					S	S	T	T																T		T	T		T	T		S							B	T	T							T	T		S	T	T			G	G	G					B	T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		443	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	Y	S	S	T	I	P	I	A	R	F	I	D	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	P	G	K	V	I	N	W	N	G	K	S	V	K	L	P	P	L	K	M	C	I	F	A	G	T	N	P
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	Y	L	E	A	N	T	P	K	A	T	L	A	D	Q	V	N	Y	W	S	N	Y	P	K	F	F	V	S	L	M	K	S	F	Y	G	D	A	A	Q	K	E	N	N	W	G	Y	D	W	L	P	K	W	D	Q	T	Y	D	V	I	K	Y	F	N	M	M	D	E	G	K	V	T	G	Y	F	C	Q	G	F	N	P
Template Known Secondary structure								S				S	S	S	S				G	G	G	G														G	G	G			G	G	G	G	G	G	G	G	G	S			B	S	S													T	T									S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		488	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	H	R	H	Q	Q	I	N	R	I	I	E	G	L	R	K	L	E	T	V	I	A	I	D	N	Q	W	T	S	T	C	R	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	V	L	P	A	T	T	Q	F	E	R	N	D	L	D	Q	Y	G	N	H	S	N	R	G	I	I	A	M
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.
Template Sequence		V	A	S	F	P	D	K	N	K	V	V	S	C	L	S	K	L	K	Y	M	V	V	I	D	P	L	V	T	E	T	S	T	F	W	Q	N	H	G	E	S	N	D	V	D	P	A	S	I	Q	T	E	V	F	R	L	P	S	T	C	F	A	E	E	D	.	.	.	G	S	I	A	N	S	G	R	W	L	Q	W	H
Template Known Secondary structure					S	S	S									T	T		S							S	B			T	T	T	T	T	T	S			G	G	G	G				G	G	G										B			G	G	G	S		.	.	.						T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.
Template SS confidence
		560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.				.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.
		551	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	Q	V	V	P	P	Q	F	E	A	R	N	D	F	D	I	F	R	E	L	C	R	R	F	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	E	A	F	T	E	G	L	D	E	M	G	W	L	K	R	I	W	Q	E	G	V	Q	Q	G	K	G	R	G	V	H	L	P	A	F	D	D
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	K	G	Q	D	A	P	G	E	A	R	N	D	G	E	I	L	A	G	I	Y	H	H	L	R	E	L	Y	Q	S	E	G	G	K	G	V	E	P	L	M	K	M	S	W	N	Y	K	Q	P	H	E	P	Q	S	D	E	V	A	K	E	N	N	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	E	D
Template Known Secondary structure					S			S	T	T		B																							S	S							S					S	S	T	T	S														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		637	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700													.	.	.	.
		614	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	W	N	N	K	E	Y	V	E	F	D	H	P	Q	M	F	V	R	H	Q	A	F	R	E	D	P	D	L	E	P	L	G	T	P	S	G	L	I	E	I	Y	S	K	T	I	A	D	M	N	Y	D	D	C	Q	G	H	P	M	W	F	E	K	I	E	R	S	H	G	G	P	G	S	Q	K	Y	P	L	H	L	Q
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.	.							.															.	.	.	.	.	.																					.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.							.															.	.	.	.	.	.																					.	.
Template Sequence		L	Y	D	A	N	G	V	L	I	A	K	K	G	Q	L	L	S	S	F	A	H	L	R	D	D	.	.	.	.	.	G	T	T	A	S	S	.	C	W	I	Y	T	G	S	W	T	E	Q	G	N	Q	.	.	.	.	.	.	M	A	N	R	D	N	S	D	P	S	G	L	G	N	T	L	G	W	A	W	.	.	A
Template Known Secondary structure					T	T	S						T	T		B		S		G	G	G			S	S	.	.	.	.	.	S	S				S	.		G	G	G	T	T	S			T	T			G	.	.	.	.	.	.	G	G		B					T	T	S	S	S			T	T	B	S		.	.
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.							.															.	.	.	.	.	.																					.	.
Template SS confidence
		705	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.						730	.	.	.	.	.		.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.							750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.			770
		694	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	V	H	P	D	F	R	L	H	S	Q	L	C	E	S	E	T	L	R	Q	Q	Y	T	V	A	G	K	E	P	V	F	I	N	P	Q	D	A	S	A	R	G	I	R	N	G	D	V	V	R	V	F	N	A	R	G
Query Conservation
Alig confidence																		.	.
Template Conservation																		.	.
Template Sequence		W	P	L	N	R	R	V	L	Y	N	R	A	S	A	D	I	.	.	N	G	K	P	W	D	P	K	R	M	L	I	Q	W	N	G	S	K	W	T	G	N	D	I	P	D	F	G	N	A	A	P	G	T	P	T	G
Template Known Secondary structure		T	T	T	T		S	S	T	T	G	G	G	G	B		T	.	.	T	S		B	S	S	T	T	S							S	S	S				S	S			S	S		S			T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																		.	.
Template SS confidence
		771	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.			.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.