Job Description P33225 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:51:24 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 570 % Identity 14% Template d1g8ka2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 1.64

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Show / Hide Conservation and Alignment quality

		42	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	T	D	A	V	I	S	K	E	G	I	L	T	G	S	H	W	G	A	I	R	A	T	V	K	D	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	V	A	A	K	P	F	E
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	P	A	N	A	Q	R	T	N	M	T	C	H	F	C	I	V	G	C	G	Y	H	V	Y	K	W	P	E	L	E	E	G	G	R	A	P	E	Q	N	A	L	G	L	D	F	R	K	Q	L	P	P	L	A	V	T	L	T	P	A	M	T	N	V	V	T	E	H	D	G	A	R	Y	D	I	M	V	V	P	D	K
Template Known Secondary structure			B	T	T									S	S	B	T	T											T	T					S	S	G	G	G	B	T	T				T	T	S				T	T	S					G	G	G							T	T	S											T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		79	80	.	.	.					.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.						.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.															.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.															.	.	.	.	.
Query Sequence		L	D	K	Y	P	.	.	.	.	S	K	M	I	A	G	L	P	D	H	V	H	N	A	.	.	.	.	.	A	R	I	R	Y	P	M	V	R	V	D	W	L	R	K	R	H	L	S	D	T	S	Q	R	G	D	N	R	F	V	R	V	S	W	D	E	A	L	D	M	F	Y	E	E	L	E	R	V	Q	K	T	H
Query Conservation							.	.	.	.															.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.															.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	C	V	V	N	S	G	L	S	S	T	R	G	G	K	M	A	S	Y	M	Y	T	P	T	G	D	G	K	E	R	L	S	A	P	R	L	Y	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	W	V	D	T	T	W	D	H	A	M	A	L	Y	A	G	L	I	K	K	T	L	D	K	D
Template Known Secondary structure		T		T	T	T	T	T				T	T	G	G	G	G	G	G	G	S			S	S	S	T	T	T	T				S						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S																								T
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.																.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
		150	.	.	.	.		.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.			.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.																													.	.
Query SS confidence							.																													.	.
Query Sequence		G	P	S	A	L	.	L	T	A	S	G	W	Q	S	T	G	M	F	H	N	A	S	G	M	L	A	K	A	I	A	L	H	G	N	.	.	S	V	G	T	G	G	D	Y	S	T	G	A	A	Q	V	I	L	P	R	V	V	G	S	M	E	V	Y	E	Q	Q	T	S	W	P	L	V	L	Q	N	S	K	T	I	V
Query Conservation							.																													.	.
Alig confidence							.																													.	.																		.						.	.	.	.
Template Conservation																																																							.						.	.	.	.
Template Sequence		G	P	Q	G	V	F	F	S	C	F	D	H	G	G	A	G	G	G	F	E	N	T	W	G	T	G	K	L	M	F	S	A	I	Q	T	P	M	V	R	I	H	N	R	P	A	Y	N	S	E	C	H	A	T	.	R	E	M	G	I	.	.	.	.	G	E	L	N	N	A	Y	E	D	A	Q	L	A	D	V	I	W
Template Known Secondary structure			G	G	G									S	S	T	T		S													T	T	T								T	T	B	S	S	S			T	T				.			T	T		.	.	.	.		S			S									S
Template Predicted Secondary structure																																																							.						.	.	.	.
Template SS confidence
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.		.	.	210	.	.					.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.						.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.									.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	W	G	S	D	L	L	K	N	Q	Q	A	N	W	W	C	P	D	H	D	V	.	.	.	.	.	Y	E	Y	Y	A	Q	L	K	A	K	V	A	A	G	E	I	E	V	I	S	I	D	P	V	V	T	S	T	H	E	Y	L	G	R	E	H	V	.	.	.	.	.	.	.	.	K	H	I	A	V	N	P	Q	T
Query Conservation																							.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.																													.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.
Template Sequence		S	I	G	N	N	P	Y	E	S	Q	T	N	Y	F	L	N	H	W	L	P	N	L	Q	G	A	T	T	S	K	K	K	E	R	F	P	N	E	N	F	P	Q	A	R	I	I	F	V	D	P	R	E	T	P	S	.	.	.	.	V	A	I	A	R	H	V	A	G	N	D	R	V	L	H	L	A	I	E	P	G	T
Template Known Secondary structure				S							S							T							T	T	T									T	T													S	S					.	.	.	.										G	G	G								T	T
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.
Template SS confidence
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.					.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	V	P	L	Q	L	A	L	A	H	T	L	Y	S	E	N	L	Y	D	K	N	F	L	A	N	Y	C	V	G	F	E	Q	F	L	P	Y	L	L	G	E	K	D	G	Q	P	K	D	A	A	W	A	E	K	L	T	G	I	D	A	E	T	I	R	G	L	A	R	Q	M	A	A	N	R	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	T	A	L	F	N	G	L	F	T	Y	V	V	E	Q	G	W	I	D	K	P	F	I	E	A	H	T	K	G	F	D	D	A	V	K	T	N	.	.	.	.	.	.	.	R	L	S	L	D	E	C	S	N	I	T	G	V	P	V	D	M	L	K	R	A	A	E	W	S	Y	K	P	K	A	S	G	Q	A	P	R
Template Known Secondary structure																	T		S																			T	.	.	.	.	.	.	.																											S			T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.								.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	Q	I	I	A	G	W	C	V	Q	R	M	Q	H	G	E	Q	W	A	W	M	I	V	V	L	A	A	M	L	G	Q	I	G	L	P	G	G	G	F	G	F	G	W	H	Y	N	G	A	G	T	P	G	R	K	G	V	I	L	S	G	F	S	G	S	T	S	I	P	P	V	H	D	N	S	D	Y	K	G	Y	S
Query Conservation
Alig confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	M	H	A	Y	E	K	G	I	I	W	G	N	D	N	Y	V	I	Q	S	A	L	L	D	L	V	I	A	T	H	N	V	G	R	R	G	T	G	C	V	R	M	G	G	H	Q	E	G	Y	T	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	P	Y	P	G	D	K	K	I	Y	I	D	Q	E	L	I	K	G	K
Template Known Secondary structure												T	S	T	T															T	T		S	S	S	T	T								S	B		B					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S		S	S										T	T
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.											430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
		447	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.		.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.
Query SS confidence																																																													.
Query Sequence		S	T	I	P	I	A	R	F	I	D	A	I	L	E	P	G	K	V	I	N	W	N	G	K	S	V	K	L	P	P	L	K	M	C	I	F	A	G	T	N	P	F	H	R	H	Q	Q	I	N	R	I	I	E	G	L	R	K	L	E	.	T	V	I	A	I	D	N	Q	W	T	S	T	C	R	F	A	D	I	V	L
Query Conservation																																																													.
Alig confidence																																																													.
Template Conservation
Template Sequence		G	R	I	M	T	W	W	G	C	N	N	F	Q	T	S	N	N	A	Q	A	L	R	E	A	I	L	Q	R	S	A	I	V	K	Q	A	M	Q	K	A	R	G	A	T	T	E	E	M	V	D	V	I	Y	E	A	T	Q	N	G	G	L	F	V	T	S	I	N	L	Y	P	T	K	L	A	E	A	A	H	L	M	L
Template Known Secondary structure			S						S							S	T	T																					T		S	S															T	T	T									S	S			G	G	G	G	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		449	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.
		526	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.									590	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	A	T	T	Q	F	E	R	N	D	L	D	Q	Y	G	N	H	S	N	R	G	I	I	A	M	K	Q	V	V	P	P	Q	F	E	A	R	N	D	F	D	I	F	R	E	L	C	R	R	F	N	R	E	E	A	F	T	E	G	L	D	E	M	G	W	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	R	I	W	Q	E	G
Query Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.
Template Sequence		P	A	A	H	P	G	E	M	N	.	.	.	L	T	S	M	N	G	E	R	R	I	R	L	S	E	K	F	M	D	P	P	G	T	A	M	A	D	C	L	I	A	A	R	I	A	N	A	L	R	D	M	Y	Q	K	D	G	K	A	E	M	A	A	Q	F	E	G	F	D	W	K	T	E	E	D	A	F	N	D	G
Template Known Secondary structure			B			B	T	T	B		.	.	.						T	T										S			S	T	T		B																				T	T								T		S				S	S								T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.
Template SS confidence
		529	530	.	.	.	.	.	.	.				.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.
		598	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.												.	610	.	.	.	.	.	.	.	.			.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.		.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.																										.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.																										.
Query Sequence		V	Q	Q	G	K	G	R	G	V	H	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	F	D	D	F	W	N	N	K	.	.	E	Y	V	E	F	D	H	P	Q	M	F	V	R	H	Q	A	F	R	E	D	P	D	L	E	P	.	L	G	T	P	S	G	L	I	E	I	Y	S
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.																										.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.																										.
Template Conservation
Template Sequence		F	R	R	A	G	Q	P	G	A	P	A	I	D	S	Q	G	G	S	T	G	H	L	V	T	Y	D	R	L	R	K	S	G	N	N	G	V	Q	L	P	V	V	S	W	D	E	S	K	G	L	V	G	T	E	M	L	Y	T	E	G	K	F	D	T	D	D	G	K	A	H	F	K	P
Template Known Secondary structure		G	G	G	T	T		T	T							T	T	G	G	G	G	G	G										G	G	G				S	S						T	T	T						S		S		T	T	S			S	S	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		606	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.