Job Description P33225 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:51:24 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 710 % Identity 22% Template c2vpyE_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: E: PDB Molecule:thiosulfate reductase; PDBTitle: polysulfide reductase with bound quinone inhibitor,2 pentachlorophenol (pcp) Resolution 2.50 Å

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		43	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.					.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.
Query Sequence		A	T	D	A	V	I	S	K	E	G	I	L	T	G	S	H	W	G	A	I	R	A	T	V	K	D	G	R	F	V	A	A	K	P	F	E	L	D	K	Y	P	.	.	.	.	S	K	M	I	A	G	L	P	D	H	V	H	N	A	A	R	I	R	Y	P	M	V	R	V	D	W	L	R	K	R	H	L	S	D	T
Query Conservation																																											.	.	.	.
Alig confidence																																											.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	Q	E	V	K	S	V	Y	Q	I	C	E	G	C	F	W	R	C	G	I	V	A	H	A	V	G	N	R	V	Y	K	V	E	G	Y	E	A	N	P	K	S	R	G	R	L	C	P	R	G	Q	G	A	P	Q	T	T	Y	D	P	D	R	L	K	R	P	L	I	R	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G
Template Known Secondary structure		S	S											S	S	T	T									S	S	S									T	T	S	T	T	T	T	T									G	G	G	G	G	G		T	T	S			S						T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.										.
		119	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.			.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.
Query SS confidence																																																																		.	.
Query Sequence		S	Q	R	G	D	N	R	F	V	R	V	S	W	D	E	A	L	D	M	F	Y	E	E	L	E	R	V	Q	K	T	H	G	P	S	A	L	L	T	A	S	G	W	Q	S	T	G	M	F	H	N	A	S	G	M	L	A	K	A	I	A	L	H	G	N	.	.	S	V	G	T	G	G	D	Y	S	T	G	A	A	Q
Query Conservation																																																																		.	.
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	Q	R	G	E	G	K	Y	R	V	A	T	W	E	E	A	L	D	H	I	A	K	K	M	L	E	I	R	E	K	Y	G	P	E	A	I	A	F	F	G	H	G	.	.	.	.	.	.	T	G	D	Y	W	F	V	D	F	L	P	A	A	W	G	S	P	N	A	A	K	P	S	V	S	L	C	T	A	P	R	E
Template Known Secondary structure				S	S	S																												G	G	G	S						S	.	.	.	.	.	.	T	T					T	T	T					T	T											T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.							.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	I	L	P	R	V	V	G	S	M	E	V	Y	E	Q	Q	T	S	W	P	L	V	L	Q	N	S	K	T	I	V	L	W	G	S	D	L	L	K	N	Q	Q	A	N	W	W	C	P	D	H	D	V	Y	E	Y	Y	A	Q	L	K	A	K	V	A	A	G	E	I	E	V	I	S	I	D	P	V	V	T	S	T	H
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.
Template Conservation											.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.
Template Sequence		V	A	S	Q	W	V	F	G	R	.	.	.	.	P	I	G	G	H	E	P	I	D	W	E	N	A	R	Y	I	V	L	I	G	H	H	I	G	E	D	T	H	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Q	L	Q	D	F	A	L	A	L	K	N	G	A	K	V	V	V	V	D	P	R	F	S	T	A	.
Template Known Secondary structure								S	S	S	.	.	.	.				S	S			B		G	G	G		S						S			B	T	T	B				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T								S	B			T	T	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.
Template SS confidence
		179	180	.	.	.	.	.	.	.					.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.												.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Y	L	G	R	E	H	V	K	H	I	A	V	N	P	Q	T	D	V	P	L	Q	L	A	L	A	H	T	L	Y	S	E	N	L	Y	D	K	N	F	L	A	N	Y	C	V	G	F	E	Q	F	L	P	Y	L	L	G	E	K	D	G	Q	P	K	D	A	A	W	A	E	K	L	T	G	I	D	A	E	T	I	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	A	A	K	A	H	R	W	L	P	I	K	P	G	T	D	T	A	L	L	L	A	W	I	H	V	L	I	Y	E	D	L	Y	D	K	E	Y	V	A	K	Y	T	V	G	F	E	E	L	K	A	H	V	.	.	.	.	.	.	K	D	F	T	P	E	W	A	E	K	H	T	E	I	P	A	Q	V	I	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	G	G	G		S							T	T																T	T		S												T	T	T					T	.	.	.	.	.	.	T	T												S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.							.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.			.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.
Query SS confidence																	.	.
Query Sequence		G	L	A	R	Q	M	A	A	N	R	T	Q	I	I	A	.	.	G	W	C	V	Q	R	M	Q	H	G	E	Q	W	A	W	M	I	V	V	L	A	A	M	L	G	Q	I	G	L	P	G	G	G	F	G	F	G	W	H	Y	N	G	A	G	T	P	G	R	K	G	V	I	L	S	G	F	S	G	S	T	S	I	P
Query Conservation																	.	.
Alig confidence																	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	V	A	R	E	M	A	A	H	K	P	R	A	V	L	P	P	T	R	H	N	V	W	Y	G	D	D	T	Y	R	V	M	A	L	L	Y	V	N	V	L	L	G	N	Y	G	R	P	G	G	F	Y	I	A	Q	S	P	Y	L	E	K	Y	P	L	P	P	L	P	L	E	P	A	A	G	G	C	S	G	P	S	G
Template Known Secondary structure										T	T	T	S							S				S	T	T																T	T		B	T	S	T	T	S	B				B													S						S			S	S		S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	V	H	D	N	S	D	Y	K	G	Y	S	S	T	I	P	I	A	R	F	I	D	A	I	L	E	P	G	K	V	I	N	W	N	G	K	S	V	K	L	P	P	L	K	M	C	I	F	A	G	T	N	P	F	H	R	H	Q	Q	I	N	R	I	I	E	G	L	R	K	L	E	T	V	I	A	I	D	N	Q	W
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.
Template Sequence		G	D	H	E	P	E	G	F	K	P	R	A	D	K	G	K	F	F	A	R	S	.	.	.	.	T	A	I	Q	E	L	I	E	P	M	I	T	G	E	P	Y	P	I	K	G	L	F	A	Y	G	I	N	L	F	H	S	I	P	N	V	P	R	T	K	E	A	L	K	N	L	D	L	Y	V	A	I	D	V	L	P
Template Known Secondary structure		T	T	T	S	S	S	S	S	S			T	T	T	T	S	S	S	S	S	S	.	.	.	.			G	G	G	T	T	S							S	S									S							S	S													S							S	S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.
Template SS confidence
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.					.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	S	T	C	R	F	A	D	I	V	L	P	A	T	T	Q	F	E	R	N	D	L	D	Q	Y	G	N	H	S	N	R	G	I	I	A	M	K	Q	V	V	P	P	Q	F	E	A	R	N	D	F	D	I	F	R	E	L	C	R	R	F	N	R	E	E	A	F	T	E	G	L	D	E	M	G	W	L	K	R	I	W
Query Conservation
Alig confidence																																																																							.
Template Conservation																																																																							.
Template Sequence		Q	E	H	V	M	W	A	D	V	I	L	P	E	A	T	Y	L	E	R	Y	D	D	F	V	L	V	A	H	K	T	P	F	I	Q	L	R	T	P	A	H	E	P	L	F	D	T	K	P	G	W	W	I	A	R	E	L	G	L	R	L	G	L	E	Q	Y	F	P	W	K	.	T	I	E	E	Y	L	E	T	R	L
Template Known Secondary structure							T	S	S					B			G	G	G										B	S	S									S	S				S	S		B												T	T	T		T	T	T				S	.
Template Predicted Secondary structure																																																																							.
Template SS confidence
		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.		.	540	.	.	.	.	.	.	.	.
		595	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	E	G	V	Q	Q	G	K	G	R	G	V	H	L	P	A	F	D	D	F	W	N	N	K	E	Y	V	E	F	D	H	P	Q	M	F	V	R	H	Q	A	F	R	E	D	P	D	L	E	P	L	G	T	P	S	G	L	I	E	I	Y	S	K	T	I	A	D	M	N	Y	D	D	C	Q	G	H	P	M	W	F	E
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.																																		.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.																																		.	.	.
Template Sequence		Q	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	D	L	E	T	M	K	G	M	G	T	L	V	Q	R	G	K	P	.	.	.	.	.	W	L	E	D	W	E	K	E	G	R	L	P	F	G	T	A	S	G	K	I	E	L	Y	C	Q	R	F	K	E	A	G	H	Q	.	.	.	P	L	P	V	F	T	P
Template Known Secondary structure		T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T										S									.	.	.	.	.	S						T	T	T				S	S	S	S	S			S	S							S	S	S	S			.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.																																		.	.	.
Template SS confidence
		549	550	.											.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570						.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.				.	.	.	.	.	.	610
		675	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.			.	750	.	.
Predicted Secondary structure																																																																												.	.
Query SS confidence																																																																												.	.
Query Sequence		K	I	E	R	S	H	G	G	P	G	S	Q	K	Y	P	L	H	L	Q	S	V	H	P	D	F	R	L	H	S	Q	L	C	E	S	E	T	L	R	Q	Q	Y	T	V	A	G	K	E	P	V	F	I	N	P	Q	D	A	S	A	R	G	I	R	N	G	D	V	V	R	V	F	N	A	R	G	.	.	Q	V	L	A
Query Conservation																																																																												.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.																																	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Template Sequence		P	E	E	P	P	.	.	.	.	.	.	.	E	G	F	Y	R	L	L	Y	G	R	S	P	V	H	T	F	A	R	T	Q	N	N	W	V	L	M	E	.	.	.	M	D	P	E	N	E	V	W	I	H	K	E	E	A	K	R	L	G	L	K	E	G	D	Y	V	M	L	V	N	Q	D	G	V	K	E	G	P	V
Template Known Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	T	T							B			T	T			G	G	G	G	T	T							.	.	.				S													T	T			T	T								T	T	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.
Template SS confidence
		611	.	.	.	.								.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.				.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680
		753	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.		.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.
Query SS confidence																																																																							.
Query Sequence		G	A	V	V	S	D	R	Y	A	P	G	V	A	R	I	H	E	G	A	W	Y	D	P	D	K	G	G	E	P	G	A	L	C	K	Y	G	N	P	N	V	L	T	I	D	I	G	T	S	Q	L	A	Q	A	T	S	A	H	T	T	L	V	E	I	E	K	Y	N	G	T	.	V	E	Q	V	T	A
Query Conservation																																																																							.
Alig confidence																															.	.																																							.
Template Conservation																															.	.
Template Sequence		R	V	K	P	T	A	R	I	R	K	D	C	V	Y	I	V	H	G	F	G	H	K	A	P	L	M	R	L	A	.	.	H	G	R	G	A	S	D	N	Y	L	Q	T	R	Y	K	L	D	P	I	S	G	G	A	G	L	R	V	N	F	V	R	L	E	K	A	E	R	P	R	L	P	S	L	T	G
Template Known Secondary structure							S	S	B		T	T	B		B		B	T	T						T	T	S	T	T	T	.	.	T	T		S														S	S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure																															.	.
Template SS confidence
		681	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.			710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.