Job Description P77619 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:31:10 GMT 2012 Rank 16 Aligned Residues 323 % Identity 19% Template d2dcfa1 SCOP info beta-lactamase/transpeptidase-like beta-lactamase/transpeptidase-like beta-Lactamase/D-ala carboxypeptidase Resolution 1.40

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		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	V	S	A	A	K	Y	P	V	L	T	E	S	S	P	E	K	A	G	F	N	V	E	R	L	N	Q	M	D	R	W	I	S	Q	Q	V	D	V	G	Y	P	S	V	N	L	L	I	I	K	D	N	Q	I	V	Y	R	K	A	W	G	A	A	K	K	Y	D	G	S	V	L	M	E	Q	P	V	K	A	T	T	G
Query Conservation
Alig confidence																																								.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	V	P	S	A	A	V	S	R	R	P	G	H	A	L	A	R	L	G	A	I	A	A	Q	L	P	D	L	E	Q	R	L	E	Q	T	Y	T	D	.	.	.	.	.	A	F	L	V	L	R	G	T	E	V	V	A	E	Y	Y	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	A	P	D
Template Known Secondary structure		T	S							S										T	T						T	T								T	T			.	.	.	.	.							T	T									T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T			T	T
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		42	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.						80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.																.	.	.	100	.
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Query SS confidence																																																																														.	.	.	.
Query Sequence		T	L	Y	D	L	A	S	N	T	K	M	Y	A	T	N	F	A	L	Q	K	L	M	S	E	G	K	L	H	P	D	D	R	I	A	K	Y	I	P	G	F	A	D	S	P	N	D	T	I	K	G	K	N	T	L	R	I	S	D	L	L	H	H	S	G	G	F	P	A	D	P	Q	Y	P	N	K	A	.	.	.	.
Query Conservation																																																																														.	.	.	.
Alig confidence														.																													.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.
Template Conservation														.																													.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	R	H	L	L	M	A	V	S	K	S	L	.	C	G	T	V	V	G	A	L	V	D	E	G	R	I	D	P	A	Q	P	V	T	E	Y	V	P	E	L	A	.	.	.	.	.	.	G	S	V	Y	D	G	P	S	V	L	Q	V	L	D	M	Q	I	S	I	D	Y	N	E	D	Y	V	D	P	A	S	E	V	Q
Template Known Secondary structure							T	T						.											T	T	S			T	T	S	B	G	G	G	T		G	G	G	T	.	.	.	.	.	.	T	S	T	T	S	S		B						T	T		B			S					S	S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure														.																													.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		106	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.		.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.							.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
							172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	V	A	G	A	L	Y	S	Q	D	K	G	Q	T	L	E	M	I	K	R	T	P	L	E	Y	Q	P	G	S	K	H	I	Y	S	D	V	D	Y	M	L	L	G	F	I	V	E	S	V	T	G	Q	P	L	D	R	Y	V	E	E	S	I	Y	R	P	L	G	L	T	H	T	V	F	N	P	L	L
Query Conservation		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	H	D	R	S	A	G	W	R	T	R	R	H	G	D	P	A	D	T	Y	E	F	L	T	T	L	R	G	D	G	S	T	G	E	F	Q	Y	C	S	A	N	T	D	V	L	A	W	I	V	E	R	V	T	G	L	R	Y	V	E	A	L	S	T	Y	L	W	A	K	L	D	A	D	R	D	A	T	I	T	V	D
Template Known Secondary structure								T	S	S				T	T			S	S							T					S		B	S	S																					S										T	G	G	G	T	T		S	S						B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	G	F	K	P	Q	Q	I	A	A	T	E	L	N	G	N	T	R	D	G	V	I	H	F	P	N	I	R	T	S	T	L	W	G	Q	V	H	D	E	K	A	F	Y	S	M	G	G	V	S	G	H	A	G	L	F	S	N	T	G	D	I	A	V	L	M	Q	T	M	L	N	G	G	G	Y	G	D	V	Q	L	F
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	G	F	A	N	G	G	V	S	C	T	A	R	D	L	A	R	V	G	R	M	M	L	D	G	G	V	A	P	G	G	R	V	V
Template Known Secondary structure		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			B		T	T	T																		T	T	T			T	T				S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		259	260																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340														.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	A	E	T	V	K	M	F	T	T	S	S	K	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	T	F	G	L	G	W	R	V	N	G	N	A	T	M	T	P	T	F	G	T	L	A	S	P	Q	T	Y	G	H	T	G	W	T	G	T	V	T	V	I	D	P	V	N	H	M	T	I	V	M	L	S
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	E	D	W	V	R	R	V	L	A	G	G	S	H	E	A	M	T	D	K	G	F	T	N	T	F	P	D	G	S	Y	T	R	Q	W	W	C	T	G	N	E	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	V	S	G	I	G	I	H	G	Q	N	L	W	L	D	P	L	T	D	S	V	I	V	K	L	S
Template Known Secondary structure															T	T	T											T	T					T	T							T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T	T							G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.												.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	K	P	H	S	P	V	A	D	P	Q	K	N	P	N	M	F	E	S	G	Q	L	P	I	A	T	Y	G	W	V	V	D	Q	V	Y	A	A	L	K
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	W	P	D	P	D	T	E	H	W	H	R	L	Q	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	L	L	D	V	S	R	A	L	D
Template Known Secondary structure				S	S	S	S										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	S
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.														380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390