Job Description P77619 Confidence 93.64% Date Thu Jan 5 12:31:10 GMT 2012 Rank 74 Aligned Residues 159 % Identity 11% Template d1nrfa_ SCOP info beta-lactamase/transpeptidase-like beta-lactamase/transpeptidase-like beta-Lactamase/D-ala carboxypeptidase Resolution 2.50

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		47	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.			.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.
Query SS confidence																				.	.
Query Sequence		I	S	Q	Q	V	D	V	G	Y	P	S	V	N	L	L	I	I	K	.	.	D	N	Q	I	V	Y	R	K	A	W	G	A	A	K	K	Y	D	G	S	V	L	M	E	Q	P	V	K	A	T	T	G	T	L	Y	D	L	A	S	N	T	K	M	Y	A	T	N	F	A	L	Q	K	L	M	S	E	G	K	L	H	P
Query Conservation																				.	.
Alig confidence																				.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.					.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.					.	.	.
Template Sequence		Y	S	T	F	F	D	K	F	S	A	S	G	G	F	V	L	F	N	S	N	R	K	K	Y	T	I	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	K	E	S	T	S	R	F	A	P	A	S	T	Y	K	V	F	.	S	A	L	L	.	.	.	A	L	E	S	G	I	I	T	K
Template Known Secondary structure								T	T	T										T	T	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S		B			G	G	G	G				.					.	.	.					T	S	S		S
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.					.	.	.
Template SS confidence
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.		.	.	410	.				.	.	.	.	.	.	.	.	420
		125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	D	R	I	A	K	Y	I	P	G	F	A	D	S	P	N	D	T	I	K	G	K	N	T	L	R	I	S	D	L	L	H	H	S	G	G	F	P	A	D	P	Q	Y	P	N	K	A	V	A	G	A	L	Y	S	Q	D	K	G	Q	T	L	E	M	I	K	R	T	P	L	E	Y	Q	P	G	S	K	H	I	Y	S
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	D	S	.	.	.	.	H	M	T	W	D	G	T	Q	Y	P	Y	K	E	W	N	Q	D	Q	D	L	F	S	A	M	S	S	S	T	T	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S			.	.	.	.		B								S	S	T	T	T	S	S		B									T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		421	.	.					.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
		205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	V	D	Y	M	L	L	G	F	I	V	E	S	V	T	G	Q	P	L	D	R	Y	V	E	E	S	I	Y	R	P	L	G	L	T	H	T	V	F	N	P	L	L	K	G	F	K	P	Q	Q	I	A	A	T	E	L	N	G	N	T	R	D	G	V	I	H	F	P	N	I	R	T	S	T	L	W	G	Q	V	H	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	Y	F	Q	K	L	D	R	Q	I	G	E	D	H	L	R	H	Y	L	K	S	.	.	.	.	.	I	H	Y	G	N	E	D	F	S	V	P	A	D	Y	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	T	T		T	T				S		T	T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
							454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.						.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	K	A	F	Y	S	M	G	G	V	S	G	H	A	G	L	F	S	N	T	G	D	I	A	V	L	M	Q	T	M	L	N	G	G	G	Y	G	D	V	Q	L	F	N	A	E	T	V	K	M	F	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	G	S	L	Q	I	S	P	L	E	Q	V	N	I	L	K	K	F	Y	D	N	E	.	.	.	.	.	F	D	F	K	Q	S	N	I	E	T	V	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	S	S	S		B															T	T	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Template SS confidence
													489	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.						.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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