Job Description P09029 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:01:47 GMT 2012 Rank 23 Aligned Residues 351 % Identity 13% Template c1w96B_ PDB info PDB header:ligase Chain: B: PDB Molecule:acetyl-coenzyme a carboxylase; PDBTitle: crystal structure of biotin carboxylase domain of acetyl-2 coenzyme a carboxylase from saccharomyces cerevisiae in3 complex with soraphen a Resolution 1.8 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.												.	.	30			.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	K	Q	V	C	V	L	G	N	G	Q	L	G	R	M	L	R	Q	A	G	E	P	L	G	I	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	P	V	.	.	G	L	D	A	E	P	A	A	V	P	F	Q	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	S	K	I	L	I	A	N	N	G	I	A	A	V	K	E	I	R	S	V	R	K	W	A	Y	E	T	F	G	D	D	R	T	V	Q	F	V	A	M	A	T	P	E	D	L	E	A	N	A	E	Y	I	R	M	A	D	Q	Y	I	E	V	P	G	G	T	N	N	N	N	Y	A	N	V	D	L	I	V	D	I	A
Template Known Secondary structure																														S		T	T	S	S													T	T							S	S								S	S	G	G	G	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
							44	.	.	.	.	.	50					.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.			.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.								.	.	.	.													.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.								.	.	.	.													.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	S	V	I	T	A	E	I	.	.	.	.	E	R	W	P	E	T	A	L	T	R	E	L	.	.	A	R	H	P	A	F	V	N	R	D	V	F	P	I	I	A	D	R	L	T	Q	K	Q	L	F	D	K	L	H	L	P	T	A	P	W	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.								.	.	.	.													.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.								.	.	.	.													.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	R	A	D	V	D	A	V	W	A	G	W	G	H	A	S	E	N	P	L	L	P	E	K	L	S	Q	S	K	R	K	V	I	F	I	G	P	P	G	N	A	M	R	S	L	G	D	K	I	S	S	T	I	V	A	Q	S	A	K	V	P	C	I	P	W	S	G	T	G	V	D	T	V	H	V	D	E	K	T	G
Template Known Secondary structure				T	T		S						S	S	T	T	T	T		T									S	T	T					S	S									S		S											T	T			B			B	T	T	T	T								T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		139	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
														99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.							.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	A	E	R	S	E	W	P	A	V	F	D	R	L	G	E	L	A	I	V	K	R	R	T	G	G	Y	D	G	R	G	Q	W	R	L	R	A	N	E	T	E	Q	L	P	A	E	C	.	.	.	.	.	.	Y	G	E	C	I	V	E	Q	G	I	N	F	S	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.
Template Sequence		L	V	S	V	D	D	D	I	Y	Q	K	G	C	C	T	S	P	E	D	G	L	Q	K	A	K	R	I	G	F	P	V	M	I	K	A	S	E	.	G	G	G	G	K	G	I	R	Q	V	E	R	E	E	D	F	I	A	L	Y	H	Q	A	A	N	E	I	P	G	S	P	I	F	I	M	K	L	A	G	R	A	R
Template Known Secondary structure											G	G	G	S		S	S													S	S						T	T	.			S	S	T	T					S	S	G	G	G												S	T	T											S
Template Predicted Secondary structure																																							.
Template SS confidence
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.		.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.		.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.		.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230			.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.																	.																																		.	.
Query SS confidence																							.																	.																																		.	.
Query Sequence		E	V	S	L	V	G	A	R	G	F	D	G	S	T	V	F	Y	P	L	T	H	.	N	L	H	Q	D	G	I	L	R	T	S	V	A	F	P	Q	.	A	N	A	Q	Q	Q	A	Q	A	E	E	M	L	S	A	I	M	Q	E	L	G	Y	V	G	V	M	A	M	E	C	F	V	T	.	.	P	Q	G	L	L	I
Query Conservation																							.																	.																																		.	.
Alig confidence																							.																	.																																		.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	L	E	V	Q	L	L	A	D	Q	Y	G	T	N	I	S	L	F	G	R	D	C	S	V	Q	R	R	H	Q	K	I	I	E	E	A	P	V	T	I	A	K	A	E	T	F	H	E	M	E	K	A	A	V	R	L	G	K	L	V	G	Y	V	S	A	G	T	V	E	Y	L	Y	S	H	D	D	G	K	F	Y	F
Template Known Secondary structure											T	T	S															T	T								S			S	S																				T													T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	E	L	A	P	R	V	H	N	S	G	H	W	T	Q	N	G	A	S	I	S	Q	F	E	L	H	L	R	A	I	T	D	L	P	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	P	V	V	N	N	P	S	V	M	I
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	E	L	N	P	R	L	Q	V	E	H	P	T	T	E	M	V	S	G	V	N	L	P	A	A	Q	L	Q	I	A	M	G	I	P	M	H	R	I	S	D	I	R	T	L	Y	G	M	N	P	H	S	A	S	E	I	D	F	E	F	K	T	Q	D	A	T	K	K	Q	R	R	P	I	P	K	G	H	C	T	A	C
Template Known Secondary structure							S			T	T	T																				T	T			G	G	G								T	T			T	T							T	T			S														S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.				.	.	.	.	310	.	.			.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.			.	.	.	.	.	.	350	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.								.	.																																.	.
Query SS confidence																								.	.	.								.	.																																.	.
Query Sequence		N	L	I	G	S	D	V	N	Y	D	W	L	K	L	P	L	V	H	L	H	W	Y	.	.	.	D	K	E	V	R	P	G	.	.	R	K	V	G	H	L	N	L	T	D	S	D	T	S	R	L	T	A	T	L	E	A	L	I	P	L	L	P	P	E	Y	.	.	A	S	G	V	I	W	A	Q	S
Query Conservation																								.	.	.								.	.																																.	.
Alig confidence																								.	.	.								.	.																																.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	I	T	G	T	L	H	E	L	N	F	R	S	S	S	N	V	W	G	Y	F	S	V	G	N	N	G	N	I	H	S	F	S	D	S	Q	F	G	H	I	F	A	F	G	E	N	R	Q	A	S	R	K	H	M	V	V	A	L	K	E	L	S	I	R	G	D	F	R	T	T	V	E	Y	L	I	K
Template Known Secondary structure													S	S		S	S									T	T		S	S		S	S		S											S	S																		T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.