Job Description P34210 Confidence 94.10% Date Thu Jan 5 11:53:03 GMT 2012 Rank 22 Aligned Residues 209 % Identity 18% Template c3kvnA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:esterase esta; PDBTitle: crystal structure of the full-length autotransporter esta from2 pseudomonas aeruginosa Resolution 2.50 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		68	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.						.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	A	A	I	L	K	G	A	V	N	W	E	L	N	P	W	L	S	V	G	A	A	G	W	T	.	.	.	.	.	T	L	N	S	R	G	G	N	M	V	D	Q	D	W	M	D	S	G	T	P	G	T	W	T	D	E	S	R	H	P	D	T	R	L	N	Y	A	N	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																											.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.																			.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.
Template Sequence		N	G	Y	N	L	T	L	G	G	S	Y	R	I	D	E	A	W	R	A	G	V	A	A	G	F	Y	R	Q	K	L	E	A	G	A	K	D	S	D	Y	R	M	N	S	Y	M	A	S	A	.	F	V	Q	Y	Q	E	N	R	W	W	A	D	A	A	L	T	G	G	Y	L	D	Y	D	D	L	K	R	K	F	A	L
Template Known Secondary structure															S	S	S																	T	T	T	T													.							T	T
Template Predicted Secondary structure																																																		.
Template SS confidence
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
																			132	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.			.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	L	N	V	K	G	W	F	L	K	E	.	.	S	D	Y	R	L	A	I	M	A	G	Y	Q	E	S	R	Y	S	F	N	A	T	G	G	T	Y	I	Y	S	E	N	G	G	F	R	N	E	T	G	A	L	P	D	K	I	K	V	I	G	Y
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.																					.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	G	E	R	S	E	K	G	D	T	N	G	H	L	W	A	F	S	A	R	L	G	Y	D	I	A	Q	Q	A	D	S	P	W	H	L	S	P	F	V	S	A	D	Y	A	R	V	E	V	D	G	.	.	.	.	.	.	Y	S	E	K	G	A	S	A	.	.	.	.	.	.	.	T	A	L	D	Y	D	D	Q
Template Known Secondary structure		T	T																								S		S		T	T		S																			.	.	.	.	.	.		B		S	S			T	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		451	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.							.	.	.	.	.	.	.	.								510	.	.	.	.	.	.	.
		193	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.							.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.																									.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.																									.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	Q	H	F	K	I	P	Y	V	G	L	T	G	N	Y	R	Y	.	D	N	F	E	F	G	G	A	F	K	Y	S	G	W	V	R	G	S	D	N	D	E	H	Y	.	.	.	.	.	.	V	R	Q	T	T	F	R	S	K	V	I	N	Q	N	Y	Y	S	V	A	V	N	A	G	Y	Y	I	T	P	E	A	K	V
Query Conservation																			.																									.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	R	S	S	K	R	L	G	A	G	L	Q	G	K	Y	A	F	G	S	D	T	Q	L	F	A	E	Y	A	H	E	R	E	Y	E	D	D	T	Q	D	L	T	M	S	L	N	S	L	P	G	N	R	F	T	L	E	G	Y	T	P	Q	D	H	L	N	R	V	S	L	G	F	S	Q	K	L	A	P	E	L	S	L
Template Known Secondary structure																		S	S	S	S													S												T	T															S															T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		518	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	I	E	G	V	W	S	R	L	T	N	K	K	G	D	T	S	L	Y	D	R	S	D	N	T	S	E	H	N	N	N	G	A	G	I	E	N	Y	N	F	I	T	T	A	G	L	K	Y	T	F
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	G	G	Y	N	W	R	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	D	T	Q	Q	S	V	S	L	A	L	S	L	D	F
Template Known Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		598	.	600	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions