Job Description P0A8M0 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:08:10 GMT 2012 Rank 13 Aligned Residues 350 % Identity 32% Template c1n9wA_ PDB info PDB header:biosynthetic protein Chain: A: PDB Molecule:aspartyl-trna synthetase 2; PDBTitle: crystal structure of the non-discriminating and archaeal-2 type aspartyl-trna synthetase from thermus thermophilus Resolution 2.30 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	P	V	A	D	V	L	Q	G	R	V	A	V	D	S	E	V	T	V	R	G	W	V	R	T	R	R	D	S	K	A	G	I	S	F	L	A	V	Y	D	G	S	C	F	D	P	V	Q	A	V	I	N	N	S	L	P	N	Y	N	E	D	V	L	R	L	T	T	G	C	S	V	I	V	T	G	K	V	V	A
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.																					.															.	.									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.																					.															.	.									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	V	L	V	R	D	L	.	.	.	K	A	H	V	G	Q	E	V	E	L	L	G	F	L	H	W	R	R	D	L	.	G	R	I	Q	F	L	L	L	R	D	R	S	G	V	.	.	V	Q	V	V	T	G	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	P	L	P	E	S	A	L	R	V	R	G	L	V	V	E
Template Known Secondary structure		B			G	G	G	G	.	.	.	G	G		T	T	S															.	S	S									T	T			.	.							S		.	.	.	.	.	.	.	.					T	T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.																					.															.	.									.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.				.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.		.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.			.	.	.	.	.	.	.	50									.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	P	G	Q	G	Q	Q	F	E	I	Q	A	S	K	V	E	V	A	G	W	V	E	D	P	D	T	Y	P	M	A	A	K	R	H	S	I	E	Y	L	R	E	V	A	H	L	R	P	R	T	N	L	I	G	A	V	A	R	V	R	H	T	L	A	Q	A	L	H	R	F	F	N	E	Q	G	F	F	W	V	S	T
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	A	K	A	P	G	G	L	E	V	Q	A	K	E	V	E	V	L	S	P	A	L	E	P	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	R	Y	V	T	L	R	G	E	K	A	R	A	P	L	K	V	Q	A	A	L	V	R	G	F	R	R	Y	L	D	R	Q	D	F	T	E	I	F	T
Template Known Secondary structure			T	T	S	T	T	S																S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T	S																								T	T
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		68	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.																.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	L	I	T	A	S	D	T	E	G	A	G	E	M	F	R	V	S	T	L	D	L	E	N	L	P	R	N	D	Q	G	K	V	D	F	D	K	D	F	F	G	K	E	S	F	L	T	V	S	G	Q	L	N	G	E	T	Y	A	C	A	L	S	K	I	Y	T	F	G	P	T	F	R	A	E	N	S	N	T	S	R
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Q	L	Y	K	Q	I	M	V	G	V	F	E	R	V	Y	E	V	A	P	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		150																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.		.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure																.
Query SS confidence																.
Query Sequence		H	L	A	E	F	W	M	L	E	P	E	V	A	F	.	A	N	L	N	D	I	A	G	L	A	E	A	M	L	K	Y	V	F	K	A	V	L	E	E	R	A	D	D	M	K	F	F	A	E	R	V	D	K	D	A	V	S	R	L	E	R	F	I	E	A	D	F	A	Q	V	D	Y	T	D	A	V	T	I	L	E
Query Conservation																.
Alig confidence		.	.	.												.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	E	Y	L	S	L	D	V	E	M	G	F	I	A	D	E	E	D	L	M	R	L	E	E	A	L	L	A	E	M	L	E	E	A	L	N	T	A	G	D	E	I	R	L	L	G	A	T	W	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	P	Q	D	I	P	R	L	T	H	A	E	A	K	R	I	L	K
Template Known Secondary structure		.	.	.											S		S	S																							S							T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.										.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.					.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.
Query Sequence		N	C	G	R	K	F	E	N	P	V	Y	W	G	V	D	L	S	S	E	H	E	R	Y	L	A	.	.	.	.	E	E	H	F	K	A	P	V	V	V	K	N	Y	P	K	D	I	K	A	F	Y	M	R	L	N	E	D	G	K	T	V	A	A	M	D	V	L	A	P	G	I	G	E	I	I	G	G	S	Q	R	E
Query Conservation																											.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.																				.	.	.	.																								.																		.
Template Conservation			.	.	.	.	.																																															.																		.
Template Sequence		E	.	.	.	.	.	E	L	G	Y	P	V	G	Q	D	L	S	E	E	A	E	R	L	L	G	E	Y	A	K	E	R	W	G	S	D	W	L	F	V	T	R	Y	P	R	S	V	R	P	F	Y	T	Y	.	P	E	E	D	G	T	T	R	S	F	D	L	L	F	R	G	L	.	E	I	T	S	G	G	Q	R	I
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	T	S						S	S																	T			S								B	G	G	G	S		T	T	B		.	B		T	T	S	B	B	S							T	T		.								B
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.																																															.																		.
Template SS confidence
		281						.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.		.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.		.	.	.	.	.	350	.	.	.
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	R	L	D	V	L	D	E	R	M	L	E	M	G	L	N	K	E	D	Y	W	W	Y	R	D	L	R	R	Y	G	T	V	P	H	S	G	F	G	L	G	F	E	R	L	I	A	Y	V	T	G	V	Q	N	V	R	D	V	I	P	F	P
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		H	R	Y	E	E	L	L	E	S	L	K	A	K	G	M	D	P	E	A	F	H	G	Y	L	E	V	F	K	Y	G	M	P	P	H	G	G	F	A	I	G	A	E	R	L	T	Q	K	L	L	G	L	P	N	V	R	Y	A	R	A	F	P
Template Known Secondary structure														T	T			G	G	G	G					G	G	G	G	S				S																T	T		S	S	G	G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.