Job Description P38055 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:57:55 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 417 % Identity 13% Template d1pw4a_ SCOP info MFS general substrate transporter MFS general substrate transporter Glycerol-3-phosphate transporter Resolution 3.30

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	Y	D	Q	I	G	A	R	L	D	R	L	P	L	A	R	F	H	Y	R	I	F	G	I	I	S	F	S	L	L	L	T	G	F	L	S	Y	S	G	N	V	V	L	A	K	L	V	S	N	G	W	S	N	N	F	L	N	A	A	F	T	S	A	L	M	F	G	Y	F	I	G	S	L	T	G	G	F	I	G	D
Query Conservation
Alig confidence																																																.
Template Conservation																																																.
Template Sequence		H	K	A	R	L	P	A	A	E	I	D	P	T	Y	R	R	L	R	W	Q	I	F	L	G	I	F	F	G	Y	A	A	Y	Y	L	V	R	K	N	F	A	L	A	M	P	Y	L	.	V	E	Q	G	F	S	R	G	D	L	G	F	A	L	S	G	I	S	I	A	Y	G	F	S	K	F	I	M	G	S	V	S	D
Template Known Secondary structure									S																													T	S								T	.	T	S	S	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure																																																.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.		.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.					.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.
Query Sequence		Y	F	G	R	R	R	A	F	R	I	N	L	L	I	V	G	I	A	A	T	G	A	.	.	.	.	A	F	V	P	D	M	Y	W	L	I	F	F	R	F	L	M	G	T	G	M	G	A	L	I	M	V	G	Y	A	S	F	T	E	F	I	P	A	T	V	R	G	K	W	S	A	R	L	S	F	V	G	N	W	S
Query Conservation																								.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	S	N	P	R	V	F	L	P	A	G	L	I	L	A	A	A	V	M	L	F	M	G	F	V	P	W	A	T	S	S	I	A	V	M	F	V	L	L	F	L	C	G	W	F	Q	G	M	G	W	P	P	C	G	R	T	M	V	H	W	W	S	Q	K	E	R	G	G	I	V	S	V	W	N	C	A	H	N	V	G
Template Known Secondary structure			S																												S	S	S	S																T										T	T		T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.		.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.
Query SS confidence															.
Query Sequence		P	M	L	S	A	A	I	G	V	V	V	I	A	.	F	F	S	W	R	I	M	F	L	L	G	G	I	G	I	L	L	A	W	F	L	S	G	K	Y	F	I	E	S	P	R	W	L	A	G	K	G	Q	I	A	G	A	E	C	Q	L	R	E	V	E	Q	Q	I	E	R	E	K	S	I	R	L	P	P	L	T	S
Query Conservation															.
Alig confidence															.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	I	P	P	L	L	F	L	L	G	M	A	W	F	N	D	W	H	A	A	L	Y	M	P	A	F	C	A	I	L	V	A	L	F	A	F	A	M	M	R	D	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	S	C	G	L
Template Known Secondary structure			T	S												T			S	T	T		T																					S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.																																.	.	.	.	.
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	Q	S	N	S	K	V	K	V	I	K	G	T	F	W	L	L	F	K	G	E	M	L	R	R	T	L	V	A	I	T	V	L	I	A	M	N	I	S	L	Y	T	I	T	V	W	I	P	T	I	F	V	N	S	G	I	D	V	D	K	S	I	L	M	T	A	V	I	M	I	G	A	P	V	G	I	F	I	A	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		P	P	I	E	E	Y	K	N	D	T	A	K	Q	I	F	M	Q	Y	V	L	P	N	K	L	L	W	Y	I	A	I	A	N	V	F	V	Y	L	L	R	Y	G	I	L	D	W	S	P	T	Y	L	K	E	V	K	H	F	A	L	D	K	S	S	W	A	Y	F	L	Y	E	Y	A	G	I	P	G	T	L	L	C	G
Template Known Secondary structure			S		T	T	T						T							T	S	S																													B	T	T	B	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.					.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.
Query Sequence		L	I	I	D	H	F	P	R	R	L	F	G	S	T	L	L	I	I	I	A	V	L	G	Y	I	Y	S	I	Q	.	.	.	.	T	T	E	W	A	I	L	I	Y	G	L	V	M	I	F	F	L	Y	M	Y	V	C	F	A	S	A	V	Y	I	P	E	L	W	P	T	H	L	R	L	R	G	S	G	F	V	N	A
Query Conservation																															.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	M	S	D	K	V	F	R	G	N	R	G	A	T	G	V	F	F	M	T	L	V	T	I	A	T	I	V	Y	W	M	N	P	A	G	N	P	T	V	D	M	I	C	M	I	V	I	G	F	L	I	Y	G	P	V	M	L	I	G	L	H	A	L	E	L	A	P	K	K	A	A	G	T	A	A	G	F	T	G	L
Template Known Secondary structure							T	S	T	T																				T	T	S			T	T																	T													T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
		394	.	.	.		.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure						.
Query SS confidence						.
Query Sequence		V	G	R	I	.	V	A	V	F	T	P	Y	G	V	A	A	L	L	T	H	Y	G	S	I	T	V	F	M	V	L	G	V	M	L	L	L	C	A	L	V	L	S	I	F	G	I	E	T	R	K	V	S	L	E	E	I	S	E	V
Query Conservation						.
Alig confidence						.
Template Conservation
Template Sequence		F	G	Y	L	G	G	S	V	A	A	S	A	I	V	G	Y	T	V	D	F	F	G	W	D	G	G	F	M	V	M	I	G	G	S	I	L	A	V	I	L	L	I	V	V	M	I	G	E	K	R	R	H	E	Q	L	L	Q	E	L
Template Known Secondary structure																					S	S		S																															G	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.