Job Description P0A6A0 Confidence 98.20% Date Thu Jan 5 11:02:40 GMT 2012 Rank 293 Aligned Residues 138 % Identity 22% Template c2q83A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:ytaa protein; PDBTitle: crystal structure of ytaa (2635576) from bacillus subtilis at 2.50 a2 resolution Resolution 2.50 Å

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		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.		.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.
Query SS confidence																				.
Query Sequence		V	E	A	W	F	D	D	F	E	I	K	P	L	A	S	A	S	I	.	A	Q	V	H	T	A	R	L	K	S	N	G	K	E	V	V	I	K	V	I	R	P	D	I	L	P	V	I	K	A	D	L	K	L	I	Y	R	L	A	R	W	V	P	R	L	L	P	D	G	R	R	L	R	P	T	E	V	V	R	E	Y
Query Conservation																				.
Alig confidence																				.								.	.																		.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.																		.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	E	N	V	L	Q	G	W	D	V	Q	A	E	K	I	D	V	I	Q	A	L	V	W	K	V	H	.	.	T	D	S	G	A	V	C	L	K	R	I	H	R	P	E	K	K	.	.	.	.	.	A	L	F	S	I	F	A	Q	D	Y	L	A	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						G	G	G	S																			.	.		T	T										S					.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																												.	.																		.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.			60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.						.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.									.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	K	T	L	I	D	E	L	N	L	L	R	E	S	A	N	A	I	Q	L	R	R	N	F	E	D	S	P	M	L	Y	I	P	E	V	Y	P	D	Y	C	.	.	.	.	.	.	.	.	S	E	G	M	M	V	M	E	R	I	Y	G	I	P	V	S	D	V	A	A	L	E	K	N	G	T	N	M	K	L	L	A
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	X	N	V	P	G	I	L	P	N	K	K	G	S	L	Y	S	K	H	G	S	F	L	F	V	V	Y	D	W	I	E	G	R	P	F	E	.	.	.	.	.	L	T	V	K	Q	D	L	E	F	I	X
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		S	S			B				T	T	S		S					T	T												B				.	.	.	.	.	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
																														95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130						.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	R	G	V	Q	V	F	F	T	Q	V	F	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	G	L	A	D	F	H	T	A	S	V	G	Y	Q	P	P	N	G	V	P	I	F	T	K	L	G	R	W	P	N	H	Y	T	K	R	C	K	Q	X	E	T	W	K	L	X	A	E	A	E	K	E	D	P	F	S	Q	L	Y	L	Q	E	I	D	G	F	I	E	D	G	L	R	I	K	D	R	L	L	Q	S	T
Template Known Secondary structure												T	T					T	T					B		T	T																								S	S																												T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
														283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	F	F	H	A	D	M	H	P	G	N	I	F	V	S	Y	E	H	P	E	N	P	K	Y	I	G	I	D	C	G	I	V	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.
Template Sequence		Y	V	P	W	T	E	Q	L	K	K	S	P	N	L	C	H	Q	D	Y	G	T	G	N	T	L	L	G	.	.	.	.	E	N	E	Q	I	W	V	I	D	L	D	T	V	S
Template Known Secondary structure												S						S	S		S	T	T	S					.	.	.	.	G	G	G								T	T
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.
Template SS confidence
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.					.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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