Job Description P71237 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:12:28 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 383 % Identity 14% Template d1rzua_ SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Glycosyl transferases group 1 Resolution 2.30

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.					.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.
Query Sequence		M	N	I	L	Q	F	N	V	R	L	A	E	.	.	.	.	G	G	A	A	G	V	A	L	D	L	H	Q	R	A	L	Q	Q	G	L	A	S	H	F	V	Y	G	Y	G	K	G	G	K	E	S	V	S	H	Q	N	Y	P	Q	V	I	K	H	T	P	R	M	T	A	M	A	N	I	A	L	F	R	L	F	N	R
Query Conservation														.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	N	V	L	S	V	S	S	E	I	Y	P	L	I	K	T	G	G	L	A	D	V	V	G	A	L	P	I	A	L	E	A	H	G	V	R	T	R	T	L	I	P	G	Y	P	A	V	K	A	A	V	T	D	P	V	K	C	F	E	F	T	D	L	L	G	E	K	A	D	L	L	E	V	Q	H	E	R	L	D	L
Template Known Secondary structure									S		B	T	T	T	B		S	S															T	T	T																			S								S		S	S	S											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		77	.																																	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	N	F	N	E	L	Y	R	T	I	T	R	T	A	G	P	V	V	L	H	F	H	V	L	H	S	Y	W	L	N	L	K	S	V	V	R	F	C	E	K	V	K	N	H	K
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																												.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	I	L	D	A	P	A	Y	Y	E	R	S	G	G	P	Y	L	G	Q	T	G	K	D	Y	P	D	N	W	K	R	F	A	A	L	S	L	A	A	A	R	I	G	A	G	V	L	P	G	W	R	P	D	M	V	H	A	H	D	.	.	.	.	.	.	.	W	Q	A	A	M	T	P	V	Y	M	R	Y	A	E	T
Template Known Secondary structure												S	S	S		S	S	B		T	T	S	S	B		T	T																	T	T		S	S	S				S							.	.	.	.	.	.	.				T	T								S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.								.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
		125	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	D	V	T	L	V	W	T	L	H	D	H	W	S	V	T	G	R	C	A	F	T	D	G	C	E	G	W	K	T	G	C	Q	K	C	P	T	L	N	N	Y	P	P	V	K	I	D	R	A	H	Q	L	V	A	G	K	R	Q	L	F	R	E	M	L	A	L	G	C	Q	F	I	S	P	S	Q	H	V	A	D	A
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	E	I	P	S	L	L	T	I	H	N	I	A	F	Q	G	Q	F	G	A	N	I	F	S	K	L	A	L	P	A	H	A	F	G	M	E	G	I	E	Y	Y	N	D	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	L	K	G	G	L	Q	T	A	T	A	L	S	T	V	S	P	S	Y	A	E	E
Template Known Secondary structure											S		T	T							G	G	G	G	G	G	S				G	G	G	S	S	T	T	T	T			T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										S					S
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.														.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		205	.	.												.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	N	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	Y	G	P	G	R	C	R	I	I	N	N	G	I	D	M	A	T	E	A	I	L	A	D	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	R	E	T	Q	G	K	P	K	I	A	V	V	A	H	D	L	R
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	L	T	A	E	F	G	M	G	L	E	G	V	I	G	S	R	A	H	V	L	H	G	I	V	N	G	I	D	A	D	V	W	N	P	A	T	D	H	L	I	H	D	N	Y	S	A	A	N	L	K	N	R	A	L	N	K	K	A	V	A	E	H	F	R	I	D	D	D	G	S	P	L	F	C	V	I	S	R	L
Template Known Secondary structure		T	T	S					T	T							T	T	G	G	G								B		T	T	T	S		T	T	T		T	T	S	S	S			B	T	T	B		T	T													T				S	S	S							S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.												.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	D	G	K	T	N	Q	Q	L	V	R	E	M	M	A	L	G	D	K	I	E	L	H	T	F	G	K	F	S	P	F	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	N	V	V	N	H	G	F	E	T	D	K	R	K	L	M	S	A	L	N	Q	M	D	A	L	V	F	S	S	R	V	D	N	Y	P	L
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	W	Q	K	G	I	D	L	M	A	E	A	V	D	E	I	V	S	L	G	G	R	L	V	V	L	G	A	G	D	V	A	L	E	G	A	L	L	A	A	A	S	R	H	H	G	R	V	G	V	A	I	G	Y	N	E	P	L	S	H	L	M	Q	A	G	C	D	A	I	I	I	P	S	R	F	E	P	C	G	L
Template Known Secondary structure		S	T	T	T	T						T	T							T	T									B															T	T	T	T						S														S							S			S	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.										.		.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370				.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.		.																							.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.		.																							.	.	.
Query Sequence		I	L	C	E	A	L	S	I	G	V	P	V	I	A	T	H	S	D	A	A	R	E	V	L	Q	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	.	G	G	K	T	V	S	E	E	E	V	L	Q	L	V	Q	L	S	K	P	E	I	A	.	.	.	Q	A	I	F	G	T	T	L	A	E	F	S	Q	R	S	R	A	A
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.		.																							.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.		.																							.	.	.															.	.
Template Conservation																																																																														.	.
Template Sequence		T	Q	L	Y	A	L	R	Y	G	C	I	P	V	V	A	R	T	G	G	L	A	D	T	V	I	D	A	N	H	A	A	L	A	S	K	A	A	T	G	V	Q	F	S	P	V	T	L	D	G	L	K	Q	A	I	R	R	T	V	R	Y	Y	H	D	P	K	L	W	T	Q	M	Q	K	L	G	M	K	.	.	S	D
Template Known Secondary structure										T							S	S									B								T	T				B				S	S		S																T														T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.
Template SS confidence
		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.			.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	S	G	Q	Q	M	L	E	E	Y	V	N	F	Y	Q	N	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	S	W	E	K	S	A	G	L	Y	A	A	L	Y	S	Q	L
Template Known Secondary structure			B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.