Job Description P71237 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:12:28 GMT 2012 Rank 16 Aligned Residues 385 % Identity 19% Template c3nb0A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:glycogen [starch] synthase isoform 2; PDBTitle: glucose-6-phosphate activated form of yeast glycogen synthase Resolution 2.41 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		2	.	.	.		.	.	.	.	10			.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.		.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.						.	.												.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.						.	.												.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	I	L	Q	.	F	N	V	R	L	.	.	A	E	G	G	A	A	G	V	A	L	D	.	L	H	Q	R	A	L	Q	Q	G	L	A	S	H	F	V	Y	G	Y	G	K	G	G	K	E	S	V	S	H	Q	N	Y	P	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation						.						.	.												.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.						.	.												.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	L	L	F	E	T	A	T	E	V	A	N	R	V	G	G	I	Y	S	V	L	K	S	K	A	P	I	T	V	A	Q	Y	K	D	H	Y	H	L	I	G	P	L	N	K	A	T	Y	Q	N	E	V	D	I	L	D	W	K	K	P	E	A	F	S	D	E	M	R	P	V	Q	H	A	L	Q	T	M	E	S	R	G
Template Known Secondary structure									T	T	T	T	S		S	S																		G	G	G									T	T	T										S	S	S	G	G	G	S		S	T	T												T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
				55	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.							.	.	.	.	.	.	100
Predicted Secondary structure		.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	V	I	K	H	T	P	R	M	T	A	M	A	N	I	A	L	F	R	L	F	N	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	F	G	N	F	N	E	L	Y	R	T	I	T	R	T	A	.	.	.	.	.	.	G	P	V	V	L	H	F
Query Conservation		.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	H	F	V	Y	G	R	W	L	I	E	G	A	P	K	V	I	L	F	D	L	D	S	V	R	G	Y	S	N	E	W	K	G	D	L	W	S	L	V	G	I	P	S	P	E	N	D	F	E	T	N	D	A	I	L	L	G	Y	T	V	A	W	F	L	G	E	V	A	H	L	D	S	Q	H	A	I	V	A	H	F
Template Known Secondary structure										S	S	T	T									S	G	G	G	G	G	G																		S	S																											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
		101	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	V	L	H	S	Y	W	L	N	L	K	S	V	V	R	F	C	E	K	V	K	N	H	K	P	D	V	T	L	V	W	T	L	H	D	H	W	S	V	T	G	R	C	A	F	T	D	G	C	E	G	W	K	T	G	C	Q	K	C	P	T	L	N	N	Y	P	P	V	K	I	D	R	A	H	Q	L	V	A	G	K
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	E	W	L	A	G	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	L	C	R	K	R	R	I	D	V	V	T	I	F	T	T	H	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	L	G	R	Y	L	C	A	S	G	S	F	D	F	Y	N	C	L	E	S	V	D	V	D	H	E	A	G	R	F	G	I	Y	H	R
Template Known Secondary structure			S	G	G	G		T		.	.	.	.	.	.	.	.							T	T		S								S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	S	S	S		S						G	G	G										T	T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		168	.	170	.	.	.	.	.									.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.										.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
		181	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	Q	L	F	R	E	M	L	A	L	G	C	Q	F	I	S	P	S	Q	H	V	A	D	A	F	N	S	L	Y	G	P	G	R	C	R	I	I	N	N	G	I	D	M	A	T	E	A	I	L	A	D	L	P	P	V	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	Q	G	K
Query Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	C	I	E	R	A	A	A	H	S	A	D	V	F	T	T	V	S	Q	I	T	A	F	E	A	E	H	L	L	K	R	K	P	D	G	I	L	P	N	G	L	N	V	I	K	F	Q	A	F	H	E	F	Q	N	L	H	A	L	K	K	E	K	I	N	D	F	V	R	G	H	F	H	G	C	F	D	F	D	L	D
Template Known Secondary structure												S	S					S	S											T	S	S			S							B						S	S	T	T																					T	T	T				S		G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.		.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.											.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	K	I	A	V	V	A	H	D	L	R	Y	.	D	G	K	T	N	Q	Q	L	V	R	E	M	M	A	L	G	D	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	L	H	T	F	G	K	F	S	P	F	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	T	L	Y	F	F	I	A	G	R	Y	E	Y	K	N	K	G	A	D	M	F	I	E	A	L	A	R	L	N	Y	R	L	K	V	S	G	S	K	K	T	V	V	A	F	I	V	M	P	A	K	N	N	S	F	T	V	E	A	L	K	G	Q	A	E	V	R	A	L	E	N	T	V	H	E	V	T	T	S	I	G
Template Known Secondary structure		G								S	S			T	T	T	T	T																		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	R	I	F	D	H	A	I	R	Y	P	H	N	G	L	T	T	E	L	P	T	D	L	G	E	L	L	K	S	S	D	K	V	M	L	K	R	R	I	L	A	L	R	R	P	E	G	Q	L	P	P	I	V	T	H	N	M	V	D	D	A	N	D	L	I	L	N	K	I	R	Q	V	Q	L	F	N	S	P	S	D
Template Known Secondary structure											T	T	S	T	T			S	S	S																											T	T					S	B	S				T	T	G	G	G											T					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
								285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.									.	.	350
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	A	G	N	V	V	N	H	G	F	E	T	D	K	R	K	L	M	S	A	L	N	Q	M	D	A	L	V	F	S	S	R	V	D	N	Y	P	L	I	L	C	E	A	L	S	I	G	V	P	V	I	A	T	H	S	D	A	A	R	E	V	L	Q	K	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	V	K	M	I	F	H	P	E	F	L	N	A	N	N	P	I	L	G	L	D	Y	D	E	F	V	R	G	C	H	L	G	V	F	P	S	Y	Y	E	P	W	G	Y	T	P	A	E	C	T	V	M	G	V	P	S	I	T	T	N	V	S	G	F	G	S	Y	M	E	D	L	I	E	T	N	Q	A	K	D	Y	G
Template Known Secondary structure		S								S				T	T		S	S	S												S							S	S	B	S	S										T	T							T	T	B								T	T	S								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
		351	.	.	.	.	.	.								.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.		.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.																												.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.																												.
Query Sequence		K	T	V	S	E	E	E	.	.	.	.	.	.	.	V	L	Q	L	V	Q	L	S	K	P	E	I	A	Q	A	I	F	G	T	T	L	A	E	F	S	Q	R	.	S	R	A	A	Y	S	G	Q	Q	M	L	E	E	Y	V	N	F	Y	Q
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.																												.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.																												.
Template Conservation
Template Sequence		I	Y	I	V	D	R	R	F	K	A	P	D	E	S	V	E	Q	L	V	D	Y	M	E	E	F	V	K	K	T	R	R	Q	R	I	N	Q	R	N	A	T	E	A	L	S	D	L	L	D	W	K	R	M	G	L	E	Y	V	K	A	R	Q
Template Known Secondary structure								S	S	S																		T																G	G	G	G	G	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		551	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.