Job Description P71237 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:12:28 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 379 % Identity 14% Template c2r60A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:glycosyl transferase, group 1; PDBTitle: structure of apo sucrose phosphate synthase (sps) of2 halothermothrix orenii Resolution 1.80 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.			.	10	.	.												.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50							.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.
Predicted Secondary structure										.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	N	I	L	Q	F	N	V	.	.	R	L	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	A	A	G	V	A	L	D	L	H	Q	R	A	L	Q	Q	G	L	A	S	H	F	V	Y	G	Y	G	K	G	G	K	E	S	V	S	H	Q	.	.	.	.	.	.	N	Y	P	Q	V	I	K	H	T	P	R
Query Conservation										.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	H	V	A	F	L	N	P	Q	G	N	F	D	P	A	D	S	Y	W	T	E	H	P	D	F	G	G	Q	L	V	Y	V	K	E	V	S	L	A	L	A	E	M	G	V	Q	V	D	I	I	T	R	R	I	K	D	E	N	W	P	E	F	S	G	E	I	D	Y	Y	Q	E	T	N	K	V	R	I	V	R	I	P
Template Known Secondary structure										S	S				T	T		T	T	T	T	S	B	T	T	B	S																T	T												B	T	T	B	G	G	G			S					T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		62	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	T	A	M	A	N	I	A	L	F	R	L	F	N	R	D	L	F	G	N	F	N	E	L	Y	R	T	I	T	R	T	A	G	P	V	V	L	H	F	H	V	L	H	S	Y	W	L	N	L	K	S	V	V	R	F	C	E	K	V	K	N	H	K	P	D	V	T	L	V	W	T	L	H	D	H	W	S	V	T	G
Query Conservation
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	G	G	D	K	F	L	P	K	E	E	L	W	P	Y	L	H	E	Y	V	N	K	I	I	N	F	Y	R	E	E	G	K	F	P	Q	V	V	T	T	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	D	G	G	L	A	G	V	L	L	K	N	I	K	G	L	P	F	T	F	T	G	H	S	L	G	A	Q	K	M
Template Known Secondary structure			S		S	S				G	G	G		G	G	G																T				S						.	.	.	.	.	.	.	.	.																								S	S
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.										.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.										.	.	210	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	C	A	F	T	D	G	C	E	G	W	K	T	G	C	Q	K	C	P	T	L	N	N	Y	P	P	V	K	I	D	R	A	H	Q	L	V	A	G	K	R	Q	L	F	R	E	M	L	A	L	G	C	Q	F	I	S	P	S	Q	H	V	A	D	A	F	N	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	Y	G	P	G
Query Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	K	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	V	N	T	S	N	F	K	E	M	D	E	R	F	K	F	H	R	R	I	I	A	E	R	L	T	M	S	Y	A	D	K	I	I	V	S	T	S	Q	E	R	F	G	Q	Y	S	H	D	L	Y	R	G	A	V	N	V	E	D	D	D
Template Known Secondary structure			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	T	T	S																								S					S	S							T	T	T	S	G	G	G	T	T	T			T	T		G	G
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		159	160	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.											.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.				.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.
Query Sequence		R	C	R	I	I	N	N	G	I	D	M	A	T	E	A	I	L	A	D	L	P	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	R	E	T	Q	G	K	P	K	I	A	V	V	A	H	D	L	R	Y	D	G	K	T	N	Q	Q	L	V	R	E	M	M	A	L	.	.	.	G	D	K	I	E	L	H	T	F	G	K
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	F	S	V	I	P	P	G	V	N	T	R	V	F	D	G	E	Y	G	D	K	I	K	A	K	I	T	K	Y	L	E	R	D	L	G	S	E	R	M	E	L	P	A	I	I	A	S	S	R	L	D	Q	K	K	N	H	Y	G	L	V	E	A	Y	V	Q	N	K	E	L	Q	D	K	A	N	L	V	L	T	L	R
Template Known Secondary structure		G								B		T	T	T	S	S	S																		S		G	G	G	T	T	S							S				G	G	G											T															S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
		280	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.					.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.
Query Sequence		F	S	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	G	N	V	V	N	H	G	F	E	T	D	K	R	K	L	M	S	A	.	.	.	.	L	N	Q	M	D	A	L	V	F	S	S	R	V	D	N	Y	P	L	I	L	C	E	A	L	S	I
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	I	E	N	P	F	E	D	Y	S	R	A	G	Q	E	E	K	E	I	L	G	K	I	I	E	L	I	D	N	N	D	C	R	G	K	V	S	M	F	P	L	N	S	Q	Q	E	L	A	G	C	Y	A	Y	L	A	S	K	G	S	V	F	A	L	T	S	F	Y	E	P	F	G	L	A	P	V	E	A	M	A	S
Template Known Secondary structure		S		S	B	T	T	T	B		T	T	S																		T	T		B	T	T								S														T	T								S		B				S								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.		.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.		.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.																																					.
Query SS confidence																					.																																					.
Query Sequence		G	V	P	V	I	A	T	H	S	D	A	A	R	E	V	L	Q	K	S	.	G	G	K	T	V	S	E	E	E	V	L	Q	L	V	Q	L	S	K	P	E	I	A	Q	A	I	F	G	T	T	L	A	E	F	S	Q	R	.	S	R	A	A	Y	S	G	Q	Q	M	L	E	E	Y	V	N	F	Y	Q	N	L
Query Conservation																					.																																					.
Alig confidence																					.																																					.
Template Conservation
Template Sequence		G	L	P	A	V	V	T	R	N	G	G	P	A	E	I	L	D	G	G	K	Y	G	V	L	V	D	P	E	D	P	E	D	I	A	R	G	L	L	K	A	F	E	S	E	E	T	W	S	A	Y	Q	E	K	G	K	Q	R	V	E	E	R	Y	T	W	Q	E	T	A	R	G	Y	L	E	V	I	Q	E	I
Template Known Secondary structure		T							S	S	B						T	G	G	G	T	S	S					T	T														S																				S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.