![]() |
|
![]() |
  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
  | |
Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 81 | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | ||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | T | N | S | A | R | C | I | G | C | Q | S | C | V | S | A | C | P | F | G | M | I | T | I | Q | S | L | . | . | . | . | . | . | . | . | P | G | D | T | R | Q | Q | I | V | K | C | D | L | C | E | Q | R | E | E | G | P | A | C | V | E | S | C | P | T | Q | A | L | Q | L | L | T | E | R | E | L | R | R | V | R | Q | Q |
Template Sequence |   | N | G | L | E | K | C | I | G | C | S | L | C | A | A | A | C | P | A | Y | A | I | Y | V | E | P | A | E | N | D | P | E | N | P | V | S | A | G | E | R | Y | A | K | V | Y | E | I | N | M | L | R | C | I | F | C | G | L | C | E | E | A | C | P | T | G | A | I | V | L | G | Y | D | F | E | M | A | D | Y | E | Y | S |
Template Known Secondary structure |   | T | S | B | S | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | S | S | B | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | S | G | G | ||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 48 | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . |
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 153 | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | R | I | V | A | S | G | E | N | P | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | D | L | V | Y | G | K | E | D | M | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | G | ![]() | ![]() | S | T | T | T | B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 128 | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
  | ||||||||
|
|